RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425046.1

SETMAR-204, Transcript of SET domain and mariner transposase fusion gene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SETMAR, Length 1,359 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETMAR-204ENST00000425046 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa32.53■■■□□ 2.8
SETMAR-204ENST00000425046 MLECQ14165 292 aa32.52■■■□□ 2.8
SETMAR-204ENST00000425046 STRCQ7RTU9 1775 aa32.48■■■□□ 2.79
SETMAR-204ENST00000425046 PLEKHD1A6NEE1 506 aa32.42■■■□□ 2.78
SETMAR-204ENST00000425046 C9orf84Q5VXU9 1444 aa32.38■■■□□ 2.77
SETMAR-204ENST00000425046 SCAPERQ9BY12 1400 aa32.37■■■□□ 2.77
SETMAR-204ENST00000425046 ATP10AO60312 1499 aa32.37■■■□□ 2.77
SETMAR-204ENST00000425046 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP32.35■■■□□ 2.77
SETMAR-204ENST00000425046 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa32.32■■■□□ 2.76
SETMAR-204ENST00000425046 DMRT2Q9Y5R5 561 aa32.31■■■□□ 2.76
SETMAR-204ENST00000425046 PLCH2O75038 1416 aa32.3■■■□□ 2.76
SETMAR-204ENST00000425046 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
SETMAR-204ENST00000425046 LTBP4Q8N2S1 1624 aa32.27■■■□□ 2.76
SETMAR-204ENST00000425046 PTPRTO14522 1441 aa32.27■■■□□ 2.76
SETMAR-204ENST00000425046 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.22■■■□□ 2.75
SETMAR-204ENST00000425046 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.21■■■□□ 2.75
SETMAR-204ENST00000425046 KDM5CP41229 1560 aa32.19■■■□□ 2.74
SETMAR-204ENST00000425046 IQSEC2Q5JU85 1478 aa32.18■■■□□ 2.74
SETMAR-204ENST00000425046 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
SETMAR-204ENST00000425046 C3P01024 1663 aa32.16■■■□□ 2.74
SETMAR-204ENST00000425046 MYO5CQ9NQX4 1742 aa32.16■■■□□ 2.74
SETMAR-204ENST00000425046 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa32.16■■■□□ 2.74
SETMAR-204ENST00000425046 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa32.14■■■□□ 2.74
SETMAR-204ENST00000425046 REREQ9P2R6 1566 aa32.14■■■□□ 2.73
SETMAR-204ENST00000425046 NCOA1Q15788 1441 aa32.09■■■□□ 2.73
SETMAR-204ENST00000425046 KIF14Q15058 1648 aa32.09■■■□□ 2.73
SETMAR-204ENST00000425046 ABCA6Q8N139 1617 aa32.09■■■□□ 2.73
SETMAR-204ENST00000425046 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa32.08■■■□□ 2.73
SETMAR-204ENST00000425046 AFAP1Q8N556 730 aa32.03■■■□□ 2.72
SETMAR-204ENST00000425046 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa32.01■■■□□ 2.71
SETMAR-204ENST00000425046 AGLP35573 1532 aa32■■■□□ 2.71
SETMAR-204ENST00000425046 ARHGAP5Q13017 1502 aa32■■■□□ 2.71
SETMAR-204ENST00000425046 MLH3Q9UHC1 1453 aa31.97■■■□□ 2.71
SETMAR-204ENST00000425046 EEA1Q15075 1411 aa31.94■■■□□ 2.7
SETMAR-204ENST00000425046 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa31.93■■■□□ 2.7
SETMAR-204ENST00000425046 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP31.91■■■□□ 2.7
SETMAR-204ENST00000425046 ABCC1P33527 1531 aa31.88■■■□□ 2.69
SETMAR-204ENST00000425046 CNTLNQ9NXG0 1405 aa31.88■■■□□ 2.69
SETMAR-204ENST00000425046 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.87■■■□□ 2.69
SETMAR-204ENST00000425046 MYT1LQ9UL68 1186 aa31.86■■■□□ 2.69
SETMAR-204ENST00000425046 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP31.85■■■□□ 2.69
SETMAR-204ENST00000425046 NPATQ14207 1427 aa31.84■■■□□ 2.69
SETMAR-204ENST00000425046 FMN1Q68DA7 1419 aa31.83■■■□□ 2.69
SETMAR-204ENST00000425046 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.83■■■□□ 2.69
SETMAR-204ENST00000425046 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa31.83■■■□□ 2.69
SETMAR-204ENST00000425046 MROH2AA6NES4 1674 aa31.82■■■□□ 2.68
SETMAR-204ENST00000425046 UBAP1LF5GYI3 381 aa31.81■■■□□ 2.68
SETMAR-204ENST00000425046 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP31.81■■■□□ 2.68
SETMAR-204ENST00000425046 PREX2Q70Z35 1606 aa31.81■■■□□ 2.68
SETMAR-204ENST00000425046 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.8■■■□□ 2.68
SETMAR-204ENST00000425046 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.8■■■□□ 2.68
SETMAR-204ENST00000425046 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.79■■■□□ 2.68
SETMAR-204ENST00000425046 CLIP1P30622 1438 aa31.78■■■□□ 2.68
SETMAR-204ENST00000425046 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa31.78■■■□□ 2.68
SETMAR-204ENST00000425046 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.78■■■□□ 2.68
SETMAR-204ENST00000425046 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP31.77■■■□□ 2.68
SETMAR-204ENST00000425046 PLA2R1Q13018 1463 aa31.75■■■□□ 2.67
SETMAR-204ENST00000425046 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
SETMAR-204ENST00000425046 MYO3AQ8NEV4 1616 aa31.74■■■□□ 2.67
SETMAR-204ENST00000425046 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.73■■■□□ 2.67
SETMAR-204ENST00000425046 ZMYM3Q14202 1370 aa31.69■■■□□ 2.66
SETMAR-204ENST00000425046 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP31.68■■■□□ 2.66
SETMAR-204ENST00000425046 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.67■■■□□ 2.66
SETMAR-204ENST00000425046 PKD2Q13563 968 aa31.63■■■□□ 2.65
SETMAR-204ENST00000425046 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
SETMAR-204ENST00000425046 PTPRKQ15262 1439 aa31.62■■■□□ 2.65
SETMAR-204ENST00000425046 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.61■■■□□ 2.65
SETMAR-204ENST00000425046 PLXNC1O60486 1568 aa31.6■■■□□ 2.65
SETMAR-204ENST00000425046 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.6■■■□□ 2.65
SETMAR-204ENST00000425046 HSPA1LP34931 641 aa31.59■■■□□ 2.65
SETMAR-204ENST00000425046 SYCP2Q9BX26 1530 aa31.55■■■□□ 2.64
SETMAR-204ENST00000425046 PPP6R1Q9UPN7 881 aa31.55■■■□□ 2.64
SETMAR-204ENST00000425046 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP31.51■■■□□ 2.64
SETMAR-204ENST00000425046 ATP7AQ04656 1500 aa31.51■■■□□ 2.63
SETMAR-204ENST00000425046 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.49■■■□□ 2.63
SETMAR-204ENST00000425046 NEURL4Q96JN8 1562 aa31.48■■■□□ 2.63
SETMAR-204ENST00000425046 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.48■■■□□ 2.63
SETMAR-204ENST00000425046 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
SETMAR-204ENST00000425046 CPS1P31327 1500 aa31.47■■■□□ 2.63
SETMAR-204ENST00000425046 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
SETMAR-204ENST00000425046 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.46■■■□□ 2.63
SETMAR-204ENST00000425046 PIP4K2BP78356 416 aa31.46■■■□□ 2.63
SETMAR-204ENST00000425046 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP31.46■■■□□ 2.63
SETMAR-204ENST00000425046 A2ML1A8K2U0 1454 aa31.46■■■□□ 2.63
SETMAR-204ENST00000425046 A2MP01023 1474 aa31.46■■■□□ 2.63
SETMAR-204ENST00000425046 ALKQ9UM73 1620 aa31.44■■■□□ 2.62
SETMAR-204ENST00000425046 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP31.43■■■□□ 2.62
SETMAR-204ENST00000425046 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.43■■■□□ 2.62
SETMAR-204ENST00000425046 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
SETMAR-204ENST00000425046 SHANK2Q9UPX8 1470 aa31.4■■■□□ 2.62
SETMAR-204ENST00000425046 TOM1O60784 492 aa31.39■■■□□ 2.62
SETMAR-204ENST00000425046 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.39■■■□□ 2.62
SETMAR-204ENST00000425046 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP31.38■■■□□ 2.61
SETMAR-204ENST00000425046 VWDEQ8N2E2 1590 aa31.35■■■□□ 2.61
SETMAR-204ENST00000425046 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa31.35■■■□□ 2.61
SETMAR-204ENST00000425046 GGT6Q6P531 493 aa31.35■■■□□ 2.61
SETMAR-204ENST00000425046 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP31.32■■■□□ 2.6
SETMAR-204ENST00000425046 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa31.3■■■□□ 2.6
SETMAR-204ENST00000425046 ADGBQ8N7X0 1667 aa31.3■■■□□ 2.6
SETMAR-204ENST00000425046 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.27■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.3 ms