RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411328.1

RN7SKP194-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 194, humanhuman

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Gene RN7SKP194, Length 351 nt, Biotype misc RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP194-201ENST00000411328 PLEKHD1A6NEE1 506 aa16.62■□□□□ 0.25
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RN7SKP194-201ENST00000411328 CFAP74Q9C0B2 1584 aa16.6■□□□□ 0.25
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RN7SKP194-201ENST00000411328 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa16.59■□□□□ 0.25
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RN7SKP194-201ENST00000411328 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa16.57■□□□□ 0.24
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RN7SKP194-201ENST00000411328 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
RN7SKP194-201ENST00000411328 SAMD9Q5K651 1589 aa16.43■□□□□ 0.22
RN7SKP194-201ENST00000411328 HSPA1LP34931 641 aa16.43■□□□□ 0.22
RN7SKP194-201ENST00000411328 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
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RN7SKP194-201ENST00000411328 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa16.42■□□□□ 0.22
RN7SKP194-201ENST00000411328 PIP4K2BP78356 416 aa16.41■□□□□ 0.22
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RN7SKP194-201ENST00000411328 MYO5CQ9NQX4 1742 aa16.3■□□□□ 0.2
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RN7SKP194-201ENST00000411328 PLA2R1Q13018 1463 aa16.25■□□□□ 0.19
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RN7SKP194-201ENST00000411328 CPS1P31327 1500 aa16.19■□□□□ 0.18
RN7SKP194-201ENST00000411328 PTPRKQ15262 1439 aa16.19■□□□□ 0.18
RN7SKP194-201ENST00000411328 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
RN7SKP194-201ENST00000411328 KIF14Q15058 1648 aa16.16■□□□□ 0.18
RN7SKP194-201ENST00000411328 MYO3AQ8NEV4 1616 aa16.16■□□□□ 0.18
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RN7SKP194-201ENST00000411328 SHANK2Q9UPX8 1470 aa16.16■□□□□ 0.18
RN7SKP194-201ENST00000411328 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
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RN7SKP194-201ENST00000411328 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa16.13■□□□□ 0.17
RN7SKP194-201ENST00000411328 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
RN7SKP194-201ENST00000411328 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
RN7SKP194-201ENST00000411328 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa16.11■□□□□ 0.17
RN7SKP194-201ENST00000411328 GGT6Q6P531 493 aa16.11■□□□□ 0.17
RN7SKP194-201ENST00000411328 ABCC1P33527 1531 aa16.09■□□□□ 0.17
RN7SKP194-201ENST00000411328 ITSN2Q9NZM3 1697 aa16.08■□□□□ 0.17
RN7SKP194-201ENST00000411328 ANKLE2Q86XL3 938 aa16.08■□□□□ 0.16
RN7SKP194-201ENST00000411328 A2ML1A8K2U0 1454 aa16.08■□□□□ 0.16
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RN7SKP194-201ENST00000411328 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
RN7SKP194-201ENST00000411328 ALKQ9UM73 1620 aa16.05■□□□□ 0.16
RN7SKP194-201ENST00000411328 PREX2Q70Z35 1606 aa16.02■□□□□ 0.16
RN7SKP194-201ENST00000411328 NEURL4Q96JN8 1562 aa16.02■□□□□ 0.16
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RN7SKP194-201ENST00000411328 VWDEQ8N2E2 1590 aa16.01■□□□□ 0.15
RN7SKP194-201ENST00000411328 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
RN7SKP194-201ENST00000411328 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
RN7SKP194-201ENST00000411328 A2MP01023 1474 aa15.99■□□□□ 0.15
RN7SKP194-201ENST00000411328 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.15
RN7SKP194-201ENST00000411328 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
RN7SKP194-201ENST00000411328 TNRQ92752 1358 aa15.98■□□□□ 0.15
RN7SKP194-201ENST00000411328 EEA1Q15075 1411 aa15.97■□□□□ 0.15
RN7SKP194-201ENST00000411328 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RN7SKP194-201ENST00000411328 LRRC7Q96NW7 1537 aa15.96■□□□□ 0.15
RN7SKP194-201ENST00000411328 ATP7AQ04656 1500 aa15.95■□□□□ 0.14
RN7SKP194-201ENST00000411328 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
RN7SKP194-201ENST00000411328 UBTFP17480 764 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
RN7SKP194-201ENST00000411328 PLXNC1O60486 1568 aa15.94■□□□□ 0.14
RN7SKP194-201ENST00000411328 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa15.94■□□□□ 0.14
RN7SKP194-201ENST00000411328 MED14O60244 1454 aa15.93■□□□□ 0.14
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