RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401088.8

SZRD1-201, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SZRD1, Length 3,636 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-201ENST00000401088 KIF7Q2M1P5 1343 aa16.04■□□□□ 0.16
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SZRD1-201ENST00000401088 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa16.02■□□□□ 0.16
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SZRD1-201ENST00000401088 NCOA2Q15596 1464 aa15.85■□□□□ 0.13
SZRD1-201ENST00000401088 FGD6Q6ZV73 1430 aa15.85■□□□□ 0.13
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SZRD1-201ENST00000401088 HFM1A2PYH4 1435 aa15.83■□□□□ 0.13
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SZRD1-201ENST00000401088 ARID3AQ99856 593 aa15.82■□□□□ 0.12
SZRD1-201ENST00000401088 FHOD3Q2V2M9 1422 aa15.82■□□□□ 0.12
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SZRD1-201ENST00000401088 CLCN1P35523 988 aa15.8■□□□□ 0.12
SZRD1-201ENST00000401088 MAP3K1Q13233 1512 aa15.79■□□□□ 0.12
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SZRD1-201ENST00000401088 C20orf194Q5TEA3 1177 aa15.79■□□□□ 0.12
SZRD1-201ENST00000401088 NLRP13Q86W25 1043 aa15.79■□□□□ 0.12
SZRD1-201ENST00000401088 PANK2Q9BZ23 570 aa15.79■□□□□ 0.12
SZRD1-201ENST00000401088 NAIPQ13075 1403 aa15.79■□□□□ 0.12
SZRD1-201ENST00000401088 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP15.78■□□□□ 0.12
SZRD1-201ENST00000401088 KIF15Q9NS87 1388 aa15.78■□□□□ 0.12
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SZRD1-201ENST00000401088 TOP2BQ02880 1626 aa15.76■□□□□ 0.11
SZRD1-201ENST00000401088 C8orf34Q49A92 452 aa15.76■□□□□ 0.11
SZRD1-201ENST00000401088 ESPNB1AK53 854 aa15.76■□□□□ 0.11
SZRD1-201ENST00000401088 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP15.75■□□□□ 0.11
SZRD1-201ENST00000401088 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP15.75■□□□□ 0.11
SZRD1-201ENST00000401088 MRE11P49959 708 aa15.74■□□□□ 0.11
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SZRD1-201ENST00000401088 PTPRKQ15262 1439 aa15.73■□□□□ 0.11
SZRD1-201ENST00000401088 IGF1RP08069 1367 aa15.72■□□□□ 0.11
SZRD1-201ENST00000401088 FAM13BQ9NYF5 915 aa15.72■□□□□ 0.11
SZRD1-201ENST00000401088 RBM10P98175 930 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
SZRD1-201ENST00000401088 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
SZRD1-201ENST00000401088 NESP48681 1621 aa15.71■□□□□ 0.11
SZRD1-201ENST00000401088 TPM2P07951 284 aa15.71■□□□□ 0.11
SZRD1-201ENST00000401088 TRAK2O60296 914 aa15.7■□□□□ 0.1
SZRD1-201ENST00000401088 MSNP26038 577 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
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SZRD1-201ENST00000401088 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa15.7■□□□□ 0.1
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SZRD1-201ENST00000401088 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
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SZRD1-201ENST00000401088 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa15.68■□□□□ 0.1
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SZRD1-201ENST00000401088 PTPN23Q9H3S7 1636 aa15.66■□□□□ 0.1
SZRD1-201ENST00000401088 MYOM3Q5VTT5 1437 aa15.64■□□□□ 0.09
SZRD1-201ENST00000401088 GOLGA2Q08379 1002 aa15.64■□□□□ 0.09
SZRD1-201ENST00000401088 CADPSQ9ULU8 1353 aa15.63■□□□□ 0.09
SZRD1-201ENST00000401088 CHMP5Q9NZZ3 219 aa15.63■□□□□ 0.09
SZRD1-201ENST00000401088 PRDM2Q13029 1718 aa15.63■□□□□ 0.09
SZRD1-201ENST00000401088 HSCBQ8IWL3 235 aa15.62■□□□□ 0.09
SZRD1-201ENST00000401088 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
SZRD1-201ENST00000401088 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
SZRD1-201ENST00000401088 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa15.62■□□□□ 0.09
SZRD1-201ENST00000401088 DDX11L8A8MPP1 907 aa15.61■□□□□ 0.09
SZRD1-201ENST00000401088 KDM2BQ8NHM5 1336 aa15.61■□□□□ 0.09
SZRD1-201ENST00000401088 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa15.6■□□□□ 0.09
SZRD1-201ENST00000401088 SEC24BO95487 1268 aa15.6■□□□□ 0.09
SZRD1-201ENST00000401088 PKD2Q13563 968 aa15.6■□□□□ 0.09
SZRD1-201ENST00000401088 NCLP19338 710 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
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