RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392273.7

LATS1-202, Transcript of large tumor suppressor kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LATS1, Length 2,567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LATS1-202ENST00000392273 PTPRGP23470 1445 aa23.44■■□□□ 1.34
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LATS1-202ENST00000392273 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.43■■□□□ 1.34
LATS1-202ENST00000392273 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
LATS1-202ENST00000392273 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.42■■□□□ 1.34
LATS1-202ENST00000392273 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
LATS1-202ENST00000392273 TONSLQ96HA7 1378 aa23.41■■□□□ 1.34
LATS1-202ENST00000392273 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
LATS1-202ENST00000392273 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
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LATS1-202ENST00000392273 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.37■■□□□ 1.33
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LATS1-202ENST00000392273 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.37■■□□□ 1.33
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LATS1-202ENST00000392273 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.34■■□□□ 1.33
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LATS1-202ENST00000392273 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.27■■□□□ 1.32
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LATS1-202ENST00000392273 ADGRL2O95490 1459 aa23.21■■□□□ 1.31
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LATS1-202ENST00000392273 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.16■■□□□ 1.3
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LATS1-202ENST00000392273 PREX2Q70Z35 1606 aa23.15■■□□□ 1.3
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LATS1-202ENST00000392273 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.13■■□□□ 1.29
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LATS1-202ENST00000392273 TSPY10P0CW01 314 aa23.1■■□□□ 1.29
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LATS1-202ENST00000392273 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.7■■□□□ 1.22
LATS1-202ENST00000392273 ERBINQ96RT1 1412 aa22.7■■□□□ 1.22
LATS1-202ENST00000392273 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.7■■□□□ 1.22
LATS1-202ENST00000392273 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.69■■□□□ 1.22
LATS1-202ENST00000392273 USP47Q96K76 1375 aa22.69■■□□□ 1.22
LATS1-202ENST00000392273 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.68■■□□□ 1.22
LATS1-202ENST00000392273 FANCAO15360 1455 aa22.68■■□□□ 1.22
LATS1-202ENST00000392273 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
LATS1-202ENST00000392273 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.68■■□□□ 1.22
LATS1-202ENST00000392273 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.68■■□□□ 1.22
LATS1-202ENST00000392273 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
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