RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376709.8

VSX1-202, Transcript of visual system homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VSX1, Length 2,192 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1-202ENST00000376709 DAPK1P53355 1430 aa29.05■■■□□ 2.24
VSX1-202ENST00000376709 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.05■■■□□ 2.24
VSX1-202ENST00000376709 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
VSX1-202ENST00000376709 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.04■■■□□ 2.24
VSX1-202ENST00000376709 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
VSX1-202ENST00000376709 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
VSX1-202ENST00000376709 KDM6BO15054 1643 aa29.01■■■□□ 2.24
VSX1-202ENST00000376709 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.01■■■□□ 2.23
VSX1-202ENST00000376709 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
VSX1-202ENST00000376709 ABCC5O15440 1437 aa29■■■□□ 2.23
VSX1-202ENST00000376709 TRIM52Q96A61 297 aa29■■■□□ 2.23
VSX1-202ENST00000376709 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.99■■■□□ 2.23
VSX1-202ENST00000376709 ROCK1Q13464 1354 aa28.98■■■□□ 2.23
VSX1-202ENST00000376709 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.94■■■□□ 2.22
VSX1-202ENST00000376709 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
VSX1-202ENST00000376709 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.92■■■□□ 2.22
VSX1-202ENST00000376709 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa28.91■■■□□ 2.22
VSX1-202ENST00000376709 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
VSX1-202ENST00000376709 ABCC2Q92887 1545 aa28.87■■■□□ 2.21
VSX1-202ENST00000376709 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.86■■■□□ 2.21
VSX1-202ENST00000376709 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.83■■■□□ 2.21
VSX1-202ENST00000376709 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.81■■■□□ 2.2
VSX1-202ENST00000376709 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
VSX1-202ENST00000376709 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.76■■■□□ 2.2
VSX1-202ENST00000376709 NCOA1Q15788 1441 aa28.75■■■□□ 2.19
VSX1-202ENST00000376709 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
VSX1-202ENST00000376709 ADGRL2O95490 1459 aa28.74■■■□□ 2.19
VSX1-202ENST00000376709 FOXD1Q16676 465 aa28.73■■■□□ 2.19
VSX1-202ENST00000376709 PREX2Q70Z35 1606 aa28.71■■■□□ 2.19
VSX1-202ENST00000376709 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.71■■■□□ 2.19
VSX1-202ENST00000376709 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.71■■■□□ 2.19
VSX1-202ENST00000376709 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.7■■■□□ 2.18
VSX1-202ENST00000376709 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.7■■■□□ 2.18
VSX1-202ENST00000376709 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
VSX1-202ENST00000376709 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
VSX1-202ENST00000376709 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.68■■■□□ 2.18
VSX1-202ENST00000376709 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.67■■■□□ 2.18
VSX1-202ENST00000376709 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.66■■■□□ 2.18
VSX1-202ENST00000376709 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.66■■■□□ 2.18
VSX1-202ENST00000376709 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.65■■■□□ 2.18
VSX1-202ENST00000376709 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.65■■■□□ 2.18
VSX1-202ENST00000376709 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.62■■■□□ 2.17
VSX1-202ENST00000376709 MBD5Q9P267 1494 aa28.62■■■□□ 2.17
VSX1-202ENST00000376709 KCNH8Q96L42 1107 aa28.62■■■□□ 2.17
VSX1-202ENST00000376709 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
VSX1-202ENST00000376709 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.61■■■□□ 2.17
VSX1-202ENST00000376709 PZPP20742 1482 aa28.6■■■□□ 2.17
VSX1-202ENST00000376709 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.6■■■□□ 2.17
VSX1-202ENST00000376709 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.59■■■□□ 2.17
VSX1-202ENST00000376709 TSPY4P0CV99 314 aa28.59■■■□□ 2.17
VSX1-202ENST00000376709 TSPY10P0CW01 314 aa28.59■■■□□ 2.17
VSX1-202ENST00000376709 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.57■■■□□ 2.16
VSX1-202ENST00000376709 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.56■■■□□ 2.16
VSX1-202ENST00000376709 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.54■■■□□ 2.16
VSX1-202ENST00000376709 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.51■■■□□ 2.15
VSX1-202ENST00000376709 KIF15Q9NS87 1388 aa28.51■■■□□ 2.15
VSX1-202ENST00000376709 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.49■■■□□ 2.15
VSX1-202ENST00000376709 OSCARQ8IYS5 282 aa28.49■■■□□ 2.15
VSX1-202ENST00000376709 ANP32CO43423 234 aa28.47■■■□□ 2.15
VSX1-202ENST00000376709 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
VSX1-202ENST00000376709 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.46■■■□□ 2.15
VSX1-202ENST00000376709 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.46■■■□□ 2.15
VSX1-202ENST00000376709 PKD2Q13563 968 aa28.45■■■□□ 2.15
VSX1-202ENST00000376709 PLCH2O75038 1416 aa28.45■■■□□ 2.15
VSX1-202ENST00000376709 NUP155O75694 1391 aa28.43■■■□□ 2.14
VSX1-202ENST00000376709 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.43■■■□□ 2.14
VSX1-202ENST00000376709 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.4■■■□□ 2.14
VSX1-202ENST00000376709 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.4■■■□□ 2.14
VSX1-202ENST00000376709 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.4■■■□□ 2.14
VSX1-202ENST00000376709 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.38■■■□□ 2.13
VSX1-202ENST00000376709 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.38■■■□□ 2.13
VSX1-202ENST00000376709 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.37■■■□□ 2.13
VSX1-202ENST00000376709 CCER2I3L3R5 266 aa28.35■■■□□ 2.13
VSX1-202ENST00000376709 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.35■■■□□ 2.13
VSX1-202ENST00000376709 ABCC1P33527 1531 aa28.33■■■□□ 2.13
VSX1-202ENST00000376709 PLXNC1O60486 1568 aa28.3■■■□□ 2.12
VSX1-202ENST00000376709 ASXL2Q76L83 1435 aa28.28■■■□□ 2.12
VSX1-202ENST00000376709 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.28■■■□□ 2.12
VSX1-202ENST00000376709 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.27■■■□□ 2.12
VSX1-202ENST00000376709 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.25■■■□□ 2.11
VSX1-202ENST00000376709 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.24■■■□□ 2.11
VSX1-202ENST00000376709 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
VSX1-202ENST00000376709 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.21■■■□□ 2.11
VSX1-202ENST00000376709 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.21■■■□□ 2.11
VSX1-202ENST00000376709 UNC13BO14795 1591 aa28.2■■■□□ 2.11
VSX1-202ENST00000376709 CCDC7Q96M83 1385 aa28.2■■■□□ 2.1
VSX1-202ENST00000376709 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
VSX1-202ENST00000376709 FANCAO15360 1455 aa28.19■■■□□ 2.1
VSX1-202ENST00000376709 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.18■■■□□ 2.1
VSX1-202ENST00000376709 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
VSX1-202ENST00000376709 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.17■■■□□ 2.1
VSX1-202ENST00000376709 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
VSX1-202ENST00000376709 AFAP1Q8N556 730 aa28.16■■■□□ 2.1
VSX1-202ENST00000376709 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.16■■■□□ 2.1
VSX1-202ENST00000376709 ERBINQ96RT1 1412 aa28.14■■■□□ 2.1
VSX1-202ENST00000376709 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
VSX1-202ENST00000376709 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.12■■■□□ 2.09
VSX1-202ENST00000376709 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.12■■■□□ 2.09
VSX1-202ENST00000376709 USP47Q96K76 1375 aa28.1■■■□□ 2.09
VSX1-202ENST00000376709 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.7 ms