RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373779.7

PTPRU-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-202ENST00000373779 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRU-202ENST00000373779 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRU-202ENST00000373779 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRU-202ENST00000373779 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRU-202ENST00000373779 ERCC6Q03468 1493 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRU-202ENST00000373779 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRU-202ENST00000373779 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRU-202ENST00000373779 UACAQ9BZF9 1416 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRU-202ENST00000373779 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRU-202ENST00000373779 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PTPRU-202ENST00000373779 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
PTPRU-202ENST00000373779 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
PTPRU-202ENST00000373779 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRU-202ENST00000373779 NLRP13Q86W25 1043 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRU-202ENST00000373779 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRU-202ENST00000373779 KIF15Q9NS87 1388 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRU-202ENST00000373779 PRXQ9BXM0 1461 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRU-202ENST00000373779 PDE3BQ13370 1112 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRU-202ENST00000373779 CUX1P39880 1505 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRU-202ENST00000373779 TOP2BQ02880 1626 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRU-202ENST00000373779 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRU-202ENST00000373779 MS4A1P11836 297 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRU-202ENST00000373779 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
PTPRU-202ENST00000373779 KANK1Q14678 1352 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRU-202ENST00000373779 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRU-202ENST00000373779 USP47Q96K76 1375 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRU-202ENST00000373779 NCAPD3P42695 1498 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRU-202ENST00000373779 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRU-202ENST00000373779 CCDC7Q96M83 1385 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRU-202ENST00000373779 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRU-202ENST00000373779 MORC1Q86VD1 984 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRU-202ENST00000373779 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRU-202ENST00000373779 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRU-202ENST00000373779 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PTPRU-202ENST00000373779 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
PTPRU-202ENST00000373779 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRU-202ENST00000373779 NCOA2Q15596 1464 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRU-202ENST00000373779 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PTPRU-202ENST00000373779 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PTPRU-202ENST00000373779 GOLGA2Q08379 1002 aa22.33■■□□□ 1.16
PTPRU-202ENST00000373779 TIAM1Q13009 1591 aa22.33■■□□□ 1.16
PTPRU-202ENST00000373779 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PTPRU-202ENST00000373779 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRU-202ENST00000373779 CASC1Q6TDU7 716 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRU-202ENST00000373779 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PTPRU-202ENST00000373779 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRU-202ENST00000373779 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRU-202ENST00000373779 HSCBQ8IWL3 235 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRU-202ENST00000373779 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRU-202ENST00000373779 POGKQ9P215 609 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRU-202ENST00000373779 CFTRP13569 1480 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRU-202ENST00000373779 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRU-202ENST00000373779 PDE4AP27815 886 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRU-202ENST00000373779 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRU-202ENST00000373779 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPRU-202ENST00000373779 WDR97A6NE52 1622 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRU-202ENST00000373779 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPRU-202ENST00000373779 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPRU-202ENST00000373779 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRU-202ENST00000373779 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRU-202ENST00000373779 PANK3Q9H999 370 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRU-202ENST00000373779 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRU-202ENST00000373779 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRU-202ENST00000373779 USP35Q9P2H5 1018 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRU-202ENST00000373779 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRU-202ENST00000373779 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRU-202ENST00000373779 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PTPRU-202ENST00000373779 PLIN1O60240 522 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRU-202ENST00000373779 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRU-202ENST00000373779 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PTPRU-202ENST00000373779 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PTPRU-202ENST00000373779 HFM1A2PYH4 1435 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRU-202ENST00000373779 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPRU-202ENST00000373779 JPH4Q96JJ6 628 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRU-202ENST00000373779 CRBNQ96SW2 442 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPRU-202ENST00000373779 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PTPRU-202ENST00000373779 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PTPRU-202ENST00000373779 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
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PTPRU-202ENST00000373779 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRU-202ENST00000373779 FAM161AQ3B820 660 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRU-202ENST00000373779 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
PTPRU-202ENST00000373779 HMGXB3Q12766 1538 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-202ENST00000373779 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.139e-7■■■■■ 37.2
PTPRU-202ENST00000373779 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-202ENST00000373779 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-202ENST00000373779 MIA2Q96PC5 1412 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRU-202ENST00000373779 GGT6Q6P531 493 aa22.08■■□□□ 1.12
PTPRU-202ENST00000373779 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PTPRU-202ENST00000373779 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PTPRU-202ENST00000373779 KIF3BO15066 747 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRU-202ENST00000373779 C14orf37Q86TY3 774 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRU-202ENST00000373779 SLC4A3P48751 1232 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRU-202ENST00000373779 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRU-202ENST00000373779 CFAP44Q96MT7 982 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRU-202ENST00000373779 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRU-202ENST00000373779 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRU-202ENST00000373779 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRU-202ENST00000373779 E9PSI1 815 aa22.04■■□□□ 1.12
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