RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
AMIGO1-201ENST00000369862 KDM5BQ9UGL1 1544 aa33.92■■■■□ 3.02
AMIGO1-201ENST00000369862 ABCC5O15440 1437 aa33.92■■■■□ 3.02
AMIGO1-201ENST00000369862 TRIM52Q96A61 297 aa33.89■■■■□ 3.02
AMIGO1-201ENST00000369862 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP33.89■■■■□ 3.02
AMIGO1-201ENST00000369862 ROCK1Q13464 1354 aa33.88■■■■□ 3.01
AMIGO1-201ENST00000369862 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP33.87■■■■□ 3.01
AMIGO1-201ENST00000369862 KIF14Q15058 1648 aa33.85■■■■□ 3.01
AMIGO1-201ENST00000369862 ADCY10Q96PN6 1610 aa33.84■■■■□ 3.01
AMIGO1-201ENST00000369862 MPHOSPH9Q99550 1183 aa33.81■■■■□ 3
AMIGO1-201ENST00000369862 ITSN2Q9NZM3 1697 aa33.81■■■■□ 3
AMIGO1-201ENST00000369862 KCNH8Q96L42 1107 aa33.81■■■■□ 3
AMIGO1-201ENST00000369862 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP33.8■■■■□ 3
AMIGO1-201ENST00000369862 ABCA8O94911 1581 aa33.79■■■■□ 3
AMIGO1-201ENST00000369862 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa33.79■■■■□ 3
AMIGO1-201ENST00000369862 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP33.75■■■□□ 2.99
AMIGO1-201ENST00000369862 FOXD1Q16676 465 aa33.7■■■□□ 2.99
AMIGO1-201ENST00000369862 ATP10BO94823 1461 aa33.68■■■□□ 2.98
AMIGO1-201ENST00000369862 ADGBQ8N7X0 1667 aa33.65■■■□□ 2.98
AMIGO1-201ENST00000369862 CROCC2H7BZ55 1655 aa33.64■■■□□ 2.98
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP33.63■■■□□ 2.97
AMIGO1-201ENST00000369862 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa33.63■■■□□ 2.97
AMIGO1-201ENST00000369862 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa33.63■■■□□ 2.97
AMIGO1-201ENST00000369862 NCOA1Q15788 1441 aa33.63■■■□□ 2.97
AMIGO1-201ENST00000369862 PLEKHD1A6NEE1 506 aa33.61■■■□□ 2.97
AMIGO1-201ENST00000369862 ABCC10Q5T3U5 1492 aa33.61■■■□□ 2.97
AMIGO1-201ENST00000369862 CCER2I3L3R5 266 aa33.6■■■□□ 2.97
AMIGO1-201ENST00000369862 ADGRL2O95490 1459 aa33.59■■■□□ 2.97
AMIGO1-201ENST00000369862 CHD1O14646 1710 aa33.59■■■□□ 2.97
AMIGO1-201ENST00000369862 L3MBTL2Q969R5 705 aa33.57■■■□□ 2.96
AMIGO1-201ENST00000369862 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa33.56■■■□□ 2.96
AMIGO1-201ENST00000369862 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP33.56■■■□□ 2.96
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP33.55■■■□□ 2.96
AMIGO1-201ENST00000369862 PZPP20742 1482 aa33.54■■■□□ 2.96
AMIGO1-201ENST00000369862 PTPRGP23470 1445 aa33.53■■■□□ 2.96
AMIGO1-201ENST00000369862 ANP32CO43423 234 aa33.51■■■□□ 2.96
AMIGO1-201ENST00000369862 TEX14Q8IWB6 1497 aa33.48■■■□□ 2.95
AMIGO1-201ENST00000369862 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP33.47■■■□□ 2.95
AMIGO1-201ENST00000369862 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa33.47■■■□□ 2.95
AMIGO1-201ENST00000369862 SHROOM2Q13796 1616 aa33.43■■■□□ 2.94
AMIGO1-201ENST00000369862 SHANK2Q9UPX8 1470 aa33.42■■■□□ 2.94
AMIGO1-201ENST00000369862 FKBP8Q14318 412 aa33.4■■■□□ 2.94
AMIGO1-201ENST00000369862 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa33.39■■■□□ 2.94
AMIGO1-201ENST00000369862 C9orf84Q5VXU9 1444 aa33.39■■■□□ 2.94
AMIGO1-201ENST00000369862 WASHC2AQ641Q2 1341 aa33.39■■■□□ 2.94
AMIGO1-201ENST00000369862 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP33.38■■■□□ 2.93
AMIGO1-201ENST00000369862 NBPF8Q3BBV2 869 aa33.38■■■□□ 2.93
AMIGO1-201ENST00000369862 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa33.35■■■□□ 2.93
AMIGO1-201ENST00000369862 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa33.32■■■□□ 2.92
AMIGO1-201ENST00000369862 ARHGEF5Q12774 1597 aa33.32■■■□□ 2.92
AMIGO1-201ENST00000369862 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.31■■■□□ 2.92
AMIGO1-201ENST00000369862 NEFLP07196 543 aa33.3■■■□□ 2.92
AMIGO1-201ENST00000369862 PREX2Q70Z35 1606 aa33.3■■■□□ 2.92
AMIGO1-201ENST00000369862 MBD5Q9P267 1494 aa33.3■■■□□ 2.92
AMIGO1-201ENST00000369862 BCANQ96GW7 911 aa33.3■■■□□ 2.92
AMIGO1-201ENST00000369862 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa33.29■■■□□ 2.92
AMIGO1-201ENST00000369862 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP33.29■■■□□ 2.92
AMIGO1-201ENST00000369862 PKD2Q13563 968 aa33.28■■■□□ 2.92
AMIGO1-201ENST00000369862 TSPY4P0CV99 314 aa33.26■■■□□ 2.91
AMIGO1-201ENST00000369862 TSPY10P0CW01 314 aa33.26■■■□□ 2.91
AMIGO1-201ENST00000369862 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP33.22■■■□□ 2.91
AMIGO1-201ENST00000369862 NUP155O75694 1391 aa33.22■■■□□ 2.91
AMIGO1-201ENST00000369862 KIF15Q9NS87 1388 aa33.21■■■□□ 2.91
AMIGO1-201ENST00000369862 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.2■■■□□ 2.91
AMIGO1-201ENST00000369862 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa33.2■■■□□ 2.91
AMIGO1-201ENST00000369862 KDM5DQ9BY66 1539 aa33.2■■■□□ 2.91
AMIGO1-201ENST00000369862 ABCC2Q92887 1545 aa33.2■■■□□ 2.9
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC141Q6ZP82 1450 aa33.19■■■□□ 2.9
AMIGO1-201ENST00000369862 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.17■■■□□ 2.9
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC7Q96M83 1385 aa33.17■■■□□ 2.9
AMIGO1-201ENST00000369862 CNTLNQ9NXG0 1405 aa33.16■■■□□ 2.9
AMIGO1-201ENST00000369862 SYCP2Q9BX26 1530 aa33.12■■■□□ 2.89
AMIGO1-201ENST00000369862 ARHGAP5Q13017 1502 aa33.1■■■□□ 2.89
AMIGO1-201ENST00000369862 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP33.1■■■□□ 2.89
AMIGO1-201ENST00000369862 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.1■■■□□ 2.89
AMIGO1-201ENST00000369862 RSPH4AQ5TD94 716 aa33.08■■■□□ 2.89
AMIGO1-201ENST00000369862 ANP32EQ9BTT0 268 aa33.06■■■□□ 2.88
AMIGO1-201ENST00000369862 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.05■■■□□ 2.88
AMIGO1-201ENST00000369862 KIF7Q2M1P5 1343 aa33.04■■■□□ 2.88
AMIGO1-201ENST00000369862 MAST1Q9Y2H9 1570 aa33.03■■■□□ 2.88
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP33■■■□□ 2.87
AMIGO1-201ENST00000369862 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP33■■■□□ 2.87
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AMIGO1-201ENST00000369862 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa32.99■■■□□ 2.87
AMIGO1-201ENST00000369862 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa32.97■■■□□ 2.87
AMIGO1-201ENST00000369862 USP47Q96K76 1375 aa32.96■■■□□ 2.87
AMIGO1-201ENST00000369862 KDM5CP41229 1560 aa32.95■■■□□ 2.87
AMIGO1-201ENST00000369862 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa32.95■■■□□ 2.87
AMIGO1-201ENST00000369862 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP32.95■■■□□ 2.87
AMIGO1-201ENST00000369862 BCORL1Q5H9F3 1711 aa32.94■■■□□ 2.86
AMIGO1-201ENST00000369862 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa32.93■■■□□ 2.86
AMIGO1-201ENST00000369862 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP32.93■■■□□ 2.86
AMIGO1-201ENST00000369862 RALGAPBQ86X10 1494 aa32.92■■■□□ 2.86
AMIGO1-201ENST00000369862 UNC13BO14795 1591 aa32.92■■■□□ 2.86
AMIGO1-201ENST00000369862 PLXNC1O60486 1568 aa32.92■■■□□ 2.86
AMIGO1-201ENST00000369862 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP32.9■■■□□ 2.86
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC184Q52MB2 194 aa32.9■■■□□ 2.86
AMIGO1-201ENST00000369862 PLCH2O75038 1416 aa32.89■■■□□ 2.85
AMIGO1-201ENST00000369862 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa32.81■■■□□ 2.84
AMIGO1-201ENST00000369862 DCAF11Q8TEB1 546 aa32.8■■■□□ 2.84
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