RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369838.5

SH3BGRL2-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL2, Length 4,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3BGRL2-201ENST00000369838 NUTM2FA1L443 756 aa15.9■□□□□ 0.14
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SH3BGRL2-201ENST00000369838 CCER2I3L3R5 266 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRL2-201ENST00000369838 GOLGA2Q08379 1002 aa15.67■□□□□ 0.1
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SH3BGRL2-201ENST00000369838 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP15.65■□□□□ 0.1
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SH3BGRL2-201ENST00000369838 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRL2-201ENST00000369838 NESP48681 1621 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TOPBP1Q92547 1522 aa15.59■□□□□ 0.09
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SH3BGRL2-201ENST00000369838 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa15.58■□□□□ 0.08
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SH3BGRL2-201ENST00000369838 CFAP43Q8NDM7 1665 aa15.51■□□□□ 0.07
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SH3BGRL2-201ENST00000369838 EVA1CP58658 441 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRL2-201ENST00000369838 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRL2-201ENST00000369838 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PTPRKQ15262 1439 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BGRL2-201ENST00000369838 MSH5O43196 834 aa15.47■□□□□ 0.07
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SH3BGRL2-201ENST00000369838 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
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