RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369762.6

ATP6AP1-201, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATP6AP1, Length 2,099 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1-201ENST00000369762 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.19■■■□□ 2.42
ATP6AP1-201ENST00000369762 ABCA8O94911 1581 aa30.18■■■□□ 2.42
ATP6AP1-201ENST00000369762 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.14■■■□□ 2.41
ATP6AP1-201ENST00000369762 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
ATP6AP1-201ENST00000369762 KIF14Q15058 1648 aa30.11■■■□□ 2.41
ATP6AP1-201ENST00000369762 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
ATP6AP1-201ENST00000369762 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.1■■■□□ 2.41
ATP6AP1-201ENST00000369762 TRIM52Q96A61 297 aa30.09■■■□□ 2.41
ATP6AP1-201ENST00000369762 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30.07■■■□□ 2.4
ATP6AP1-201ENST00000369762 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
ATP6AP1-201ENST00000369762 ATP10BO94823 1461 aa30.04■■■□□ 2.4
ATP6AP1-201ENST00000369762 ADGBQ8N7X0 1667 aa30.01■■■□□ 2.4
ATP6AP1-201ENST00000369762 ADGRL2O95490 1459 aa30■■■□□ 2.39
ATP6AP1-201ENST00000369762 CROCC2H7BZ55 1655 aa30■■■□□ 2.39
ATP6AP1-201ENST00000369762 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.99■■■□□ 2.39
ATP6AP1-201ENST00000369762 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.98■■■□□ 2.39
ATP6AP1-201ENST00000369762 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
ATP6AP1-201ENST00000369762 NCOA1Q15788 1441 aa29.96■■■□□ 2.39
ATP6AP1-201ENST00000369762 CHD1O14646 1710 aa29.96■■■□□ 2.39
ATP6AP1-201ENST00000369762 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.95■■■□□ 2.38
ATP6AP1-201ENST00000369762 PTPRGP23470 1445 aa29.93■■■□□ 2.38
ATP6AP1-201ENST00000369762 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.92■■■□□ 2.38
ATP6AP1-201ENST00000369762 SHROOM2Q13796 1616 aa29.91■■■□□ 2.38
ATP6AP1-201ENST00000369762 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
ATP6AP1-201ENST00000369762 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
ATP6AP1-201ENST00000369762 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.87■■■□□ 2.37
ATP6AP1-201ENST00000369762 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.85■■■□□ 2.37
ATP6AP1-201ENST00000369762 PZPP20742 1482 aa29.84■■■□□ 2.37
ATP6AP1-201ENST00000369762 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
ATP6AP1-201ENST00000369762 FOXD1Q16676 465 aa29.82■■■□□ 2.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.79■■■□□ 2.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.79■■■□□ 2.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.77■■■□□ 2.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.75■■■□□ 2.35
ATP6AP1-201ENST00000369762 CCER2I3L3R5 266 aa29.74■■■□□ 2.35
ATP6AP1-201ENST00000369762 KCNH8Q96L42 1107 aa29.74■■■□□ 2.35
ATP6AP1-201ENST00000369762 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.74■■■□□ 2.35
ATP6AP1-201ENST00000369762 PREX2Q70Z35 1606 aa29.72■■■□□ 2.35
ATP6AP1-201ENST00000369762 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.72■■■□□ 2.35
ATP6AP1-201ENST00000369762 ANP32CO43423 234 aa29.71■■■□□ 2.35
ATP6AP1-201ENST00000369762 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
ATP6AP1-201ENST00000369762 MBD5Q9P267 1494 aa29.69■■■□□ 2.34
ATP6AP1-201ENST00000369762 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.68■■■□□ 2.34
ATP6AP1-201ENST00000369762 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.68■■■□□ 2.34
ATP6AP1-201ENST00000369762 ABCC2Q92887 1545 aa29.66■■■□□ 2.34
ATP6AP1-201ENST00000369762 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.66■■■□□ 2.34
ATP6AP1-201ENST00000369762 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.66■■■□□ 2.34
ATP6AP1-201ENST00000369762 TSPY4P0CV99 314 aa29.64■■■□□ 2.34
ATP6AP1-201ENST00000369762 TSPY10P0CW01 314 aa29.64■■■□□ 2.34
ATP6AP1-201ENST00000369762 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.64■■■□□ 2.33
ATP6AP1-201ENST00000369762 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
ATP6AP1-201ENST00000369762 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.62■■■□□ 2.33
ATP6AP1-201ENST00000369762 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.61■■■□□ 2.33
ATP6AP1-201ENST00000369762 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.6■■■□□ 2.33
ATP6AP1-201ENST00000369762 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.6■■■□□ 2.33
ATP6AP1-201ENST00000369762 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.6■■■□□ 2.33
ATP6AP1-201ENST00000369762 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.59■■■□□ 2.33
ATP6AP1-201ENST00000369762 PKD2Q13563 968 aa29.58■■■□□ 2.33
ATP6AP1-201ENST00000369762 KIF15Q9NS87 1388 aa29.58■■■□□ 2.33
ATP6AP1-201ENST00000369762 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.57■■■□□ 2.32
ATP6AP1-201ENST00000369762 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.57■■■□□ 2.32
ATP6AP1-201ENST00000369762 NUP155O75694 1391 aa29.54■■■□□ 2.32
ATP6AP1-201ENST00000369762 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.54■■■□□ 2.32
ATP6AP1-201ENST00000369762 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.53■■■□□ 2.32
ATP6AP1-201ENST00000369762 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.52■■■□□ 2.32
ATP6AP1-201ENST00000369762 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.5■■■□□ 2.31
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ATP6AP1-201ENST00000369762 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.48■■■□□ 2.31
ATP6AP1-201ENST00000369762 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.47■■■□□ 2.31
ATP6AP1-201ENST00000369762 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.47■■■□□ 2.31
ATP6AP1-201ENST00000369762 CCDC7Q96M83 1385 aa29.47■■■□□ 2.31
ATP6AP1-201ENST00000369762 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
ATP6AP1-201ENST00000369762 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
ATP6AP1-201ENST00000369762 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.42■■■□□ 2.3
ATP6AP1-201ENST00000369762 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.42■■■□□ 2.3
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ATP6AP1-201ENST00000369762 PLXNC1O60486 1568 aa29.41■■■□□ 2.3
ATP6AP1-201ENST00000369762 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.39■■■□□ 2.29
ATP6AP1-201ENST00000369762 UNC13BO14795 1591 aa29.38■■■□□ 2.29
ATP6AP1-201ENST00000369762 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
ATP6AP1-201ENST00000369762 PLCH2O75038 1416 aa29.37■■■□□ 2.29
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ATP6AP1-201ENST00000369762 KIF7Q2M1P5 1343 aa29.32■■■□□ 2.28
ATP6AP1-201ENST00000369762 KDM5CP41229 1560 aa29.3■■■□□ 2.28
ATP6AP1-201ENST00000369762 USP47Q96K76 1375 aa29.29■■■□□ 2.28
ATP6AP1-201ENST00000369762 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.28■■■□□ 2.28
ATP6AP1-201ENST00000369762 ABCC1P33527 1531 aa29.26■■■□□ 2.27
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ATP6AP1-201ENST00000369762 OSCARQ8IYS5 282 aa29.24■■■□□ 2.27
ATP6AP1-201ENST00000369762 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.23■■■□□ 2.27
ATP6AP1-201ENST00000369762 ERBINQ96RT1 1412 aa29.23■■■□□ 2.27
ATP6AP1-201ENST00000369762 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
ATP6AP1-201ENST00000369762 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.22■■■□□ 2.27
ATP6AP1-201ENST00000369762 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
ATP6AP1-201ENST00000369762 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
ATP6AP1-201ENST00000369762 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.17■■■□□ 2.26
ATP6AP1-201ENST00000369762 PLA2R1Q13018 1463 aa29.17■■■□□ 2.26
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