RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368876.2

AMD1-201, Transcript of adenosylmethionine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene AMD1, Length 3,040 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1-201ENST00000368876 HECW1Q76N89 1606 aa14.95□□□□□ -0.02
AMD1-201ENST00000368876 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
AMD1-201ENST00000368876 SAMD9Q5K651 1589 aa14.94□□□□□ -0.02
AMD1-201ENST00000368876 NCOA1Q15788 1441 aa14.91□□□□□ -0.02
AMD1-201ENST00000368876 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
AMD1-201ENST00000368876 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
AMD1-201ENST00000368876 PRXQ9BXM0 1461 aa14.88□□□□□ -0.03
AMD1-201ENST00000368876 AGLP35573 1532 aa14.87□□□□□ -0.03
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AMD1-201ENST00000368876 MROH2AA6NES4 1674 aa14.84□□□□□ -0.03
AMD1-201ENST00000368876 KDM5CP41229 1560 aa14.83□□□□□ -0.04
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AMD1-201ENST00000368876 PLA2R1Q13018 1463 aa14.82□□□□□ -0.04
AMD1-201ENST00000368876 PLCH2O75038 1416 aa14.82□□□□□ -0.04
AMD1-201ENST00000368876 SCAPERQ9BY12 1400 aa14.81□□□□□ -0.04
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AMD1-201ENST00000368876 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa14.77□□□□□ -0.04
AMD1-201ENST00000368876 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa14.77□□□□□ -0.05
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AMD1-201ENST00000368876 MLH3Q9UHC1 1453 aa14.74□□□□□ -0.05
AMD1-201ENST00000368876 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
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AMD1-201ENST00000368876 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
AMD1-201ENST00000368876 ABCA6Q8N139 1617 aa14.69□□□□□ -0.06
AMD1-201ENST00000368876 PTPRKQ15262 1439 aa14.67□□□□□ -0.06
AMD1-201ENST00000368876 TOM1O60784 492 aa14.67□□□□□ -0.06
AMD1-201ENST00000368876 MYO3AQ8NEV4 1616 aa14.67□□□□□ -0.06
AMD1-201ENST00000368876 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
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AMD1-201ENST00000368876 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
AMD1-201ENST00000368876 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
AMD1-201ENST00000368876 KIF14Q15058 1648 aa14.64□□□□□ -0.07
AMD1-201ENST00000368876 HSPA1LP34931 641 aa14.63□□□□□ -0.07
AMD1-201ENST00000368876 P3H3Q8IVL6 736 aa14.63□□□□□ -0.07
AMD1-201ENST00000368876 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
AMD1-201ENST00000368876 ITSN2Q9NZM3 1697 aa14.61□□□□□ -0.07
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AMD1-201ENST00000368876 ARHGAP5Q13017 1502 aa14.59□□□□□ -0.07
AMD1-201ENST00000368876 ABCC1P33527 1531 aa14.59□□□□□ -0.07
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AMD1-201ENST00000368876 A2ML1A8K2U0 1454 aa14.57□□□□□ -0.08
AMD1-201ENST00000368876 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.57□□□□□ -0.08
AMD1-201ENST00000368876 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa14.57□□□□□ -0.08
AMD1-201ENST00000368876 FAM135AQ9P2D6 1515 aa14.57□□□□□ -0.08
AMD1-201ENST00000368876 ZMYM3Q14202 1370 aa14.56□□□□□ -0.08
AMD1-201ENST00000368876 CLIP1P30622 1438 aa14.56□□□□□ -0.08
AMD1-201ENST00000368876 SYNMO15061 1565 aa14.56□□□□□ -0.08
AMD1-201ENST00000368876 PREX2Q70Z35 1606 aa14.55□□□□□ -0.08
AMD1-201ENST00000368876 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
AMD1-201ENST00000368876 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
AMD1-201ENST00000368876 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
AMD1-201ENST00000368876 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.53□□□□□ -0.08
AMD1-201ENST00000368876 EEA1Q15075 1411 aa14.53□□□□□ -0.08
AMD1-201ENST00000368876 DEPDC5O75140 1603 aa14.52□□□□□ -0.08
AMD1-201ENST00000368876 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
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AMD1-201ENST00000368876 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
AMD1-201ENST00000368876 PLXNC1O60486 1568 aa14.52□□□□□ -0.09
AMD1-201ENST00000368876 VWDEQ8N2E2 1590 aa14.52□□□□□ -0.09
AMD1-201ENST00000368876 NEURL4Q96JN8 1562 aa14.52□□□□□ -0.09
AMD1-201ENST00000368876 FMN1Q68DA7 1419 aa14.51□□□□□ -0.09
AMD1-201ENST00000368876 AFAP1Q8N556 730 aa14.51□□□□□ -0.09
AMD1-201ENST00000368876 MED14O60244 1454 aa14.5□□□□□ -0.09
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AMD1-201ENST00000368876 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
AMD1-201ENST00000368876 PIP4K2BP78356 416 aa14.47□□□□□ -0.09
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AMD1-201ENST00000368876 ADGBQ8N7X0 1667 aa14.44□□□□□ -0.1
AMD1-201ENST00000368876 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
AMD1-201ENST00000368876 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa14.43□□□□□ -0.1
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AMD1-201ENST00000368876 A2MP01023 1474 aa14.41□□□□□ -0.1
AMD1-201ENST00000368876 NLRP1Q9C000 1473 aa14.41□□□□□ -0.1
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AMD1-201ENST00000368876 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa14.4□□□□□ -0.1
AMD1-201ENST00000368876 CCDC18Q5T9S5 1454 aa14.39□□□□□ -0.11
AMD1-201ENST00000368876 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
AMD1-201ENST00000368876 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa14.39□□□□□ -0.11
AMD1-201ENST00000368876 LRRC7Q96NW7 1537 aa14.39□□□□□ -0.11
AMD1-201ENST00000368876 ANKLE2Q86XL3 938 aa14.38□□□□□ -0.11
AMD1-201ENST00000368876 PZPP20742 1482 aa14.37□□□□□ -0.11
AMD1-201ENST00000368876 TNRQ92752 1358 aa14.36□□□□□ -0.11
AMD1-201ENST00000368876 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
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