RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361523.8

BECN1-201, Transcript of beclin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BECN1, Length 2,112 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1-201ENST00000361523 KIF14Q15058 1648 aa25.8■■□□□ 1.72
BECN1-201ENST00000361523 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
BECN1-201ENST00000361523 CHD1O14646 1710 aa25.79■■□□□ 1.72
BECN1-201ENST00000361523 TRIM52Q96A61 297 aa25.79■■□□□ 1.72
BECN1-201ENST00000361523 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
BECN1-201ENST00000361523 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
BECN1-201ENST00000361523 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.76■■□□□ 1.71
BECN1-201ENST00000361523 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.75■■□□□ 1.71
BECN1-201ENST00000361523 ATP10BO94823 1461 aa25.75■■□□□ 1.71
BECN1-201ENST00000361523 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
BECN1-201ENST00000361523 PTPRGP23470 1445 aa25.72■■□□□ 1.71
BECN1-201ENST00000361523 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.71■■□□□ 1.71
BECN1-201ENST00000361523 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.67■■□□□ 1.7
BECN1-201ENST00000361523 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.67■■□□□ 1.7
BECN1-201ENST00000361523 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.66■■□□□ 1.7
BECN1-201ENST00000361523 SHROOM2Q13796 1616 aa25.66■■□□□ 1.7
BECN1-201ENST00000361523 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
BECN1-201ENST00000361523 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.65■■□□□ 1.7
BECN1-201ENST00000361523 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.64■■□□□ 1.69
BECN1-201ENST00000361523 NCOA1Q15788 1441 aa25.63■■□□□ 1.69
BECN1-201ENST00000361523 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.63■■□□□ 1.69
BECN1-201ENST00000361523 ADGRL2O95490 1459 aa25.61■■□□□ 1.69
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BECN1-201ENST00000361523 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
BECN1-201ENST00000361523 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.54■■□□□ 1.68
BECN1-201ENST00000361523 FOXD1Q16676 465 aa25.54■■□□□ 1.68
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BECN1-201ENST00000361523 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.52■■□□□ 1.68
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BECN1-201ENST00000361523 PZPP20742 1482 aa25.48■■□□□ 1.67
BECN1-201ENST00000361523 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.47■■□□□ 1.67
BECN1-201ENST00000361523 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.47■■□□□ 1.67
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BECN1-201ENST00000361523 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.46■■□□□ 1.67
BECN1-201ENST00000361523 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.46■■□□□ 1.67
BECN1-201ENST00000361523 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.46■■□□□ 1.67
BECN1-201ENST00000361523 PREX2Q70Z35 1606 aa25.45■■□□□ 1.67
BECN1-201ENST00000361523 ABCC2Q92887 1545 aa25.45■■□□□ 1.66
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BECN1-201ENST00000361523 TSPY10P0CW01 314 aa25.45■■□□□ 1.66
BECN1-201ENST00000361523 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.43■■□□□ 1.66
BECN1-201ENST00000361523 MBD5Q9P267 1494 aa25.4■■□□□ 1.66
BECN1-201ENST00000361523 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.4■■□□□ 1.66
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BECN1-201ENST00000361523 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.39■■□□□ 1.65
BECN1-201ENST00000361523 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.38■■□□□ 1.65
BECN1-201ENST00000361523 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.37■■□□□ 1.65
BECN1-201ENST00000361523 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.36■■□□□ 1.65
BECN1-201ENST00000361523 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.35■■□□□ 1.65
BECN1-201ENST00000361523 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.35■■□□□ 1.65
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BECN1-201ENST00000361523 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.34■■□□□ 1.65
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BECN1-201ENST00000361523 KIF15Q9NS87 1388 aa25.33■■□□□ 1.65
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BECN1-201ENST00000361523 CCER2I3L3R5 266 aa25.28■■□□□ 1.64
BECN1-201ENST00000361523 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.28■■□□□ 1.64
BECN1-201ENST00000361523 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.27■■□□□ 1.64
BECN1-201ENST00000361523 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.24■■□□□ 1.63
BECN1-201ENST00000361523 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.24■■□□□ 1.63
BECN1-201ENST00000361523 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.24■■□□□ 1.63
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BECN1-201ENST00000361523 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.16■■□□□ 1.62
BECN1-201ENST00000361523 PLXNC1O60486 1568 aa25.15■■□□□ 1.62
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BECN1-201ENST00000361523 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.13■■□□□ 1.61
BECN1-201ENST00000361523 CCDC7Q96M83 1385 aa25.11■■□□□ 1.61
BECN1-201ENST00000361523 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
BECN1-201ENST00000361523 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.11■■□□□ 1.61
BECN1-201ENST00000361523 UNC13BO14795 1591 aa25.11■■□□□ 1.61
BECN1-201ENST00000361523 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
BECN1-201ENST00000361523 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.09■■□□□ 1.61
BECN1-201ENST00000361523 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.08■■□□□ 1.6
BECN1-201ENST00000361523 ABCC1P33527 1531 aa25.07■■□□□ 1.6
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BECN1-201ENST00000361523 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
BECN1-201ENST00000361523 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.05■■□□□ 1.6
BECN1-201ENST00000361523 ERBINQ96RT1 1412 aa25.02■■□□□ 1.6
BECN1-201ENST00000361523 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.02■■□□□ 1.6
BECN1-201ENST00000361523 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.01■■□□□ 1.59
BECN1-201ENST00000361523 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.01■■□□□ 1.59
BECN1-201ENST00000361523 USP47Q96K76 1375 aa25.01■■□□□ 1.59
BECN1-201ENST00000361523 RALGAPBQ86X10 1494 aa25■■□□□ 1.59
BECN1-201ENST00000361523 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.99■■□□□ 1.591e-6■□□□□ 11.3
BECN1-201ENST00000361523 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.99■■□□□ 1.59
BECN1-201ENST00000361523 KDM5CP41229 1560 aa24.99■■□□□ 1.59
BECN1-201ENST00000361523 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.97■■□□□ 1.59
BECN1-201ENST00000361523 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.97■■□□□ 1.59
BECN1-201ENST00000361523 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.95■■□□□ 1.59
BECN1-201ENST00000361523 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.94■■□□□ 1.58
BECN1-201ENST00000361523 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.93■■□□□ 1.58
BECN1-201ENST00000361523 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.93■■□□□ 1.58
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