RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358821.7

CNDP1-201, Transcript of carnosine dipeptidase 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNDP1, Length 2,215 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNDP1-201ENST00000358821 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CNDP1-201ENST00000358821 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CNDP1-201ENST00000358821 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CNDP1-201ENST00000358821 ATP10BO94823 1461 aa22.43■■□□□ 1.18
CNDP1-201ENST00000358821 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.43■■□□□ 1.18
CNDP1-201ENST00000358821 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CNDP1-201ENST00000358821 TONSLQ96HA7 1378 aa22.41■■□□□ 1.18
CNDP1-201ENST00000358821 SHROOM2Q13796 1616 aa22.4■■□□□ 1.18
CNDP1-201ENST00000358821 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
CNDP1-201ENST00000358821 PTPRGP23470 1445 aa22.39■■□□□ 1.17
CNDP1-201ENST00000358821 TRIM52Q96A61 297 aa22.38■■□□□ 1.17
CNDP1-201ENST00000358821 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.38■■□□□ 1.17
CNDP1-201ENST00000358821 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.37■■□□□ 1.17
CNDP1-201ENST00000358821 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.36■■□□□ 1.17
CNDP1-201ENST00000358821 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.36■■□□□ 1.17
CNDP1-201ENST00000358821 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.36■■□□□ 1.17
CNDP1-201ENST00000358821 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CNDP1-201ENST00000358821 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.33■■□□□ 1.16
CNDP1-201ENST00000358821 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.32■■□□□ 1.16
CNDP1-201ENST00000358821 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CNDP1-201ENST00000358821 ADGRL2O95490 1459 aa22.29■■□□□ 1.16
CNDP1-201ENST00000358821 NCOA1Q15788 1441 aa22.28■■□□□ 1.16
CNDP1-201ENST00000358821 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.26■■□□□ 1.15
CNDP1-201ENST00000358821 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.21■■□□□ 1.15
CNDP1-201ENST00000358821 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.21■■□□□ 1.15
CNDP1-201ENST00000358821 FOXD1Q16676 465 aa22.21■■□□□ 1.15
CNDP1-201ENST00000358821 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.2■■□□□ 1.14
CNDP1-201ENST00000358821 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.19■■□□□ 1.14
CNDP1-201ENST00000358821 ABCC2Q92887 1545 aa22.19■■□□□ 1.14
CNDP1-201ENST00000358821 PREX2Q70Z35 1606 aa22.19■■□□□ 1.14
CNDP1-201ENST00000358821 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CNDP1-201ENST00000358821 PZPP20742 1482 aa22.19■■□□□ 1.14
CNDP1-201ENST00000358821 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.19■■□□□ 1.14
CNDP1-201ENST00000358821 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CNDP1-201ENST00000358821 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.16■■□□□ 1.14
CNDP1-201ENST00000358821 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.16■■□□□ 1.14
CNDP1-201ENST00000358821 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CNDP1-201ENST00000358821 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CNDP1-201ENST00000358821 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.15■■□□□ 1.14
CNDP1-201ENST00000358821 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.15■■□□□ 1.14
CNDP1-201ENST00000358821 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.13■■□□□ 1.13
CNDP1-201ENST00000358821 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.12■■□□□ 1.13
CNDP1-201ENST00000358821 MBD5Q9P267 1494 aa22.12■■□□□ 1.13
CNDP1-201ENST00000358821 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.11■■□□□ 1.13
CNDP1-201ENST00000358821 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
CNDP1-201ENST00000358821 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.09■■□□□ 1.13
CNDP1-201ENST00000358821 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
CNDP1-201ENST00000358821 TSPY4P0CV99 314 aa22.08■■□□□ 1.13
CNDP1-201ENST00000358821 TSPY10P0CW01 314 aa22.08■■□□□ 1.13
CNDP1-201ENST00000358821 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.07■■□□□ 1.12
CNDP1-201ENST00000358821 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CNDP1-201ENST00000358821 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.06■■□□□ 1.12
CNDP1-201ENST00000358821 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.06■■□□□ 1.12
CNDP1-201ENST00000358821 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.05■■□□□ 1.12
CNDP1-201ENST00000358821 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.04■■□□□ 1.12
CNDP1-201ENST00000358821 KIF15Q9NS87 1388 aa22.04■■□□□ 1.12
CNDP1-201ENST00000358821 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.03■■□□□ 1.12
CNDP1-201ENST00000358821 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.02■■□□□ 1.12
CNDP1-201ENST00000358821 PKD2Q13563 968 aa22■■□□□ 1.11
CNDP1-201ENST00000358821 RSPH4AQ5TD94 716 aa22■■□□□ 1.11
CNDP1-201ENST00000358821 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CNDP1-201ENST00000358821 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.99■■□□□ 1.11
CNDP1-201ENST00000358821 NUP155O75694 1391 aa21.99■■□□□ 1.11
CNDP1-201ENST00000358821 KCNH8Q96L42 1107 aa21.98■■□□□ 1.11
CNDP1-201ENST00000358821 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.97■■□□□ 1.11
CNDP1-201ENST00000358821 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
CNDP1-201ENST00000358821 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.95■■□□□ 1.1
CNDP1-201ENST00000358821 ANP32CO43423 234 aa21.92■■□□□ 1.1
CNDP1-201ENST00000358821 PLCH2O75038 1416 aa21.92■■□□□ 1.1
CNDP1-201ENST00000358821 PLXNC1O60486 1568 aa21.91■■□□□ 1.1
CNDP1-201ENST00000358821 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.91■■□□□ 1.1
CNDP1-201ENST00000358821 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.9■■□□□ 1.1
CNDP1-201ENST00000358821 CCER2I3L3R5 266 aa21.88■■□□□ 1.09
CNDP1-201ENST00000358821 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.88■■□□□ 1.09
CNDP1-201ENST00000358821 UNC13BO14795 1591 aa21.87■■□□□ 1.09
CNDP1-201ENST00000358821 ABCC1P33527 1531 aa21.86■■□□□ 1.09
CNDP1-201ENST00000358821 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.85■■□□□ 1.09
CNDP1-201ENST00000358821 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.84■■□□□ 1.09
CNDP1-201ENST00000358821 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
CNDP1-201ENST00000358821 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.81■■□□□ 1.08
CNDP1-201ENST00000358821 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.81■■□□□ 1.08
CNDP1-201ENST00000358821 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CNDP1-201ENST00000358821 CCDC7Q96M83 1385 aa21.8■■□□□ 1.08
CNDP1-201ENST00000358821 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.8■■□□□ 1.08
CNDP1-201ENST00000358821 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.79■■□□□ 1.08
CNDP1-201ENST00000358821 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.79■■□□□ 1.08
CNDP1-201ENST00000358821 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.79■■□□□ 1.08
CNDP1-201ENST00000358821 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.78■■□□□ 1.08
CNDP1-201ENST00000358821 ERBINQ96RT1 1412 aa21.76■■□□□ 1.07
CNDP1-201ENST00000358821 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.75■■□□□ 1.07
CNDP1-201ENST00000358821 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
CNDP1-201ENST00000358821 RALGAPBQ86X10 1494 aa21.75■■□□□ 1.07
CNDP1-201ENST00000358821 KDM5CP41229 1560 aa21.74■■□□□ 1.07
CNDP1-201ENST00000358821 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.73■■□□□ 1.07
CNDP1-201ENST00000358821 MYT1Q01538 1121 aa21.72■■□□□ 1.07
CNDP1-201ENST00000358821 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.72■■□□□ 1.07
CNDP1-201ENST00000358821 USP47Q96K76 1375 aa21.72■■□□□ 1.07
CNDP1-201ENST00000358821 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.71■■□□□ 1.07
CNDP1-201ENST00000358821 PLA2R1Q13018 1463 aa21.7■■□□□ 1.06
CNDP1-201ENST00000358821 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms