RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 FKBP8Q14318 412 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 GBP4Q96PP9 640 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 MAP3K1Q13233 1512 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 MCCP23508 829 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 BCL11AQ9H165 835 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 NINLQ9Y2I6 1382 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC88BA6NC98 1476 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 SETD5Q9C0A6 1442 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP6.27□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 RALBP1Q15311 655 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 MROH2BQ7Z745 1585 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 CHIC2Q9UKJ5 165 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 FANCD2Q9BXW9 1451 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 MSNP26038 577 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 TAF3Q5VWG9 929 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 FANCIQ9NVI1 1328 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 DDX11L8A8MPP1 907 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 MIA2Q96PC5 1412 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 TPM4P67936 248 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 NUDCQ9Y266 331 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 ITSN2Q9NZM3 1697 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 KIAA2012Q0VF49 1180 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 MRS2Q9HD23 443 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 KIF3AQ9Y496 699 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 CNTLNQ9NXG0 1405 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 HSCBQ8IWL3 235 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 PTPRGP23470 1445 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 TPM3P06753 285 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 KIF16BQ96L93 1317 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa6.21□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 JPH4Q96JJ6 628 aa6.21□□□□□ -1.41
PTPRD-201ENST00000355233 AKNAQ7Z591 1439 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-201ENST00000355233 ROCK1Q13464 1354 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-201ENST00000355233 SETQ01105 290 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-201ENST00000355233 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-201ENST00000355233 HECW1Q76N89 1606 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-201ENST00000355233 PTMAP06454 111 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-201ENST00000355233 GPS2Q13227 327 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-201ENST00000355233 IFT140Q96RY7 1462 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-201ENST00000355233 POGKQ9P215 609 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-201ENST00000355233 FYCO1Q9BQS8 1478 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-201ENST00000355233 MRC2Q9UBG0 1479 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-201ENST00000355233 KNSTRNQ9Y448 316 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-201ENST00000355233 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRD-201ENST00000355233 EID1Q9Y6B2 187 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRD-201ENST00000355233 WASHC2AQ641Q2 1341 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRD-201ENST00000355233 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRD-201ENST00000355233 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRD-201ENST00000355233 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRD-201ENST00000355233 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRD-201ENST00000355233 KIF15Q9NS87 1388 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRD-201ENST00000355233 HMGXB3Q12766 1538 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRD-201ENST00000355233 WDR97A6NE52 1622 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRD-201ENST00000355233 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC7Q96M83 1385 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC144AA2RUR9 1427 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRD-201ENST00000355233 WIZO95785 1651 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRD-201ENST00000355233 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRD-201ENST00000355233 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRD-201ENST00000355233 LMOD3Q0VAK6 560 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRD-201ENST00000355233 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRD-201ENST00000355233 TOP2BQ02880 1626 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRD-201ENST00000355233 GRIN2BQ13224 1484 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-201ENST00000355233 TMF1P82094 1093 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-201ENST00000355233 TSPYL1Q9H0U9 437 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-201ENST00000355233 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-201ENST00000355233 ZBED9Q6R2W3 1325 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-201ENST00000355233 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 CCP110O43303 1012 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 KIF7Q2M1P5 1343 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 GAPVD1Q14C86 1478 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 GPATCH3Q96I76 525 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 TPM2P07951 284 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 MLECQ14165 292 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC70Q6NSX1 233 aa6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms