RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345957.8

SNX16-201, Transcript of sorting nexin 16, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX16, Length 1,853 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16-201ENST00000345957 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.35■■□□□ 1.65
SNX16-201ENST00000345957 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.35■■□□□ 1.65
SNX16-201ENST00000345957 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.34■■□□□ 1.65
SNX16-201ENST00000345957 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
SNX16-201ENST00000345957 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.31■■□□□ 1.64
SNX16-201ENST00000345957 ABCC2Q92887 1545 aa25.31■■□□□ 1.64
SNX16-201ENST00000345957 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.28■■□□□ 1.64
SNX16-201ENST00000345957 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.26■■□□□ 1.63
SNX16-201ENST00000345957 NEUROD1Q13562 356 aa25.23■■□□□ 1.63
SNX16-201ENST00000345957 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.23■■□□□ 1.63
SNX16-201ENST00000345957 KDM6BO15054 1643 aa25.23■■□□□ 1.63
SNX16-201ENST00000345957 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.23■■□□□ 1.63
SNX16-201ENST00000345957 ADGRL2O95490 1459 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX16-201ENST00000345957 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX16-201ENST00000345957 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
SNX16-201ENST00000345957 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX16-201ENST00000345957 TRIM52Q96A61 297 aa25.17■■□□□ 1.62
SNX16-201ENST00000345957 NCOA1Q15788 1441 aa25.16■■□□□ 1.62
SNX16-201ENST00000345957 PREX2Q70Z35 1606 aa25.16■■□□□ 1.62
SNX16-201ENST00000345957 TONSLQ96HA7 1378 aa25.14■■□□□ 1.62
SNX16-201ENST00000345957 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.14■■□□□ 1.62
SNX16-201ENST00000345957 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.13■■□□□ 1.61
SNX16-201ENST00000345957 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SNX16-201ENST00000345957 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.12■■□□□ 1.61
SNX16-201ENST00000345957 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.11■■□□□ 1.61
SNX16-201ENST00000345957 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
SNX16-201ENST00000345957 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SNX16-201ENST00000345957 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.61
SNX16-201ENST00000345957 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.08■■□□□ 1.61
SNX16-201ENST00000345957 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.08■■□□□ 1.61
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SNX16-201ENST00000345957 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.07■■□□□ 1.6
SNX16-201ENST00000345957 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.06■■□□□ 1.6
SNX16-201ENST00000345957 MBD5Q9P267 1494 aa25.05■■□□□ 1.6
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SNX16-201ENST00000345957 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.03■■□□□ 1.6
SNX16-201ENST00000345957 TSPY4P0CV99 314 aa25.03■■□□□ 1.6
SNX16-201ENST00000345957 TSPY10P0CW01 314 aa25.03■■□□□ 1.6
SNX16-201ENST00000345957 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.02■■□□□ 1.6
SNX16-201ENST00000345957 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.02■■□□□ 1.6
SNX16-201ENST00000345957 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.01■■□□□ 1.59
SNX16-201ENST00000345957 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.01■■□□□ 1.59
SNX16-201ENST00000345957 PZPP20742 1482 aa24.98■■□□□ 1.59
SNX16-201ENST00000345957 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.97■■□□□ 1.59
SNX16-201ENST00000345957 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
SNX16-201ENST00000345957 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.97■■□□□ 1.59
SNX16-201ENST00000345957 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.96■■□□□ 1.59
SNX16-201ENST00000345957 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.94■■□□□ 1.58
SNX16-201ENST00000345957 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.94■■□□□ 1.58
SNX16-201ENST00000345957 PLCH2O75038 1416 aa24.94■■□□□ 1.58
SNX16-201ENST00000345957 KIF15Q9NS87 1388 aa24.93■■□□□ 1.58
SNX16-201ENST00000345957 MIER1Q8N108 512 aa24.93■■□□□ 1.58
SNX16-201ENST00000345957 KCNH8Q96L42 1107 aa24.92■■□□□ 1.58
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SNX16-201ENST00000345957 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.9■■□□□ 1.58
SNX16-201ENST00000345957 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.9■■□□□ 1.58
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SNX16-201ENST00000345957 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.89■■□□□ 1.58
SNX16-201ENST00000345957 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.88■■□□□ 1.57
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SNX16-201ENST00000345957 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.87■■□□□ 1.57
SNX16-201ENST00000345957 PLXNC1O60486 1568 aa24.84■■□□□ 1.57
SNX16-201ENST00000345957 ABCC1P33527 1531 aa24.82■■□□□ 1.56
SNX16-201ENST00000345957 NUP155O75694 1391 aa24.82■■□□□ 1.56
SNX16-201ENST00000345957 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.8■■□□□ 1.56
SNX16-201ENST00000345957 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.79■■□□□ 1.56
SNX16-201ENST00000345957 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
SNX16-201ENST00000345957 PKD2Q13563 968 aa24.79■■□□□ 1.56
SNX16-201ENST00000345957 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.79■■□□□ 1.56
SNX16-201ENST00000345957 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.79■■□□□ 1.56
SNX16-201ENST00000345957 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.77■■□□□ 1.56
SNX16-201ENST00000345957 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.74■■□□□ 1.55
SNX16-201ENST00000345957 UNC13BO14795 1591 aa24.73■■□□□ 1.55
SNX16-201ENST00000345957 ASXL2Q76L83 1435 aa24.73■■□□□ 1.55
SNX16-201ENST00000345957 ERBINQ96RT1 1412 aa24.71■■□□□ 1.55
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SNX16-201ENST00000345957 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.7■■□□□ 1.54
SNX16-201ENST00000345957 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.68■■□□□ 1.54
SNX16-201ENST00000345957 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.68■■□□□ 1.54
SNX16-201ENST00000345957 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.68■■□□□ 1.54
SNX16-201ENST00000345957 FANCAO15360 1455 aa24.67■■□□□ 1.54
SNX16-201ENST00000345957 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
SNX16-201ENST00000345957 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
SNX16-201ENST00000345957 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.63■■□□□ 1.53
SNX16-201ENST00000345957 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.63■■□□□ 1.53
SNX16-201ENST00000345957 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
SNX16-201ENST00000345957 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.62■■□□□ 1.53
SNX16-201ENST00000345957 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.62■■□□□ 1.53
SNX16-201ENST00000345957 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
SNX16-201ENST00000345957 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.59■■□□□ 1.53
SNX16-201ENST00000345957 ADGRL1O94910 1474 aa24.58■■□□□ 1.52
SNX16-201ENST00000345957 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
SNX16-201ENST00000345957 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
SNX16-201ENST00000345957 ATP7AQ04656 1500 aa24.54■■□□□ 1.52
SNX16-201ENST00000345957 AFAP1Q8N556 730 aa24.54■■□□□ 1.52
SNX16-201ENST00000345957 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.54■■□□□ 1.52
SNX16-201ENST00000345957 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.53■■□□□ 1.52
SNX16-201ENST00000345957 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.53■■□□□ 1.52
SNX16-201ENST00000345957 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.52■■□□□ 1.52
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