RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 GRIN2AQ12879 1464 aa10.18□□□□□ -0.78
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PTPRR-202ENST00000342084 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
PTPRR-202ENST00000342084 DISP1Q96F81 1524 aa10.17□□□□□ -0.78
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PTPRR-202ENST00000342084 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
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PTPRR-202ENST00000342084 KIF7Q2M1P5 1343 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRR-202ENST00000342084 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
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PTPRR-202ENST00000342084 SHROOM2Q13796 1616 aa9.94□□□□□ -0.82
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PTPRR-202ENST00000342084 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRR-202ENST00000342084 SHANK2Q9UPX8 1470 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRR-202ENST00000342084 TSPY4P0CV99 314 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRR-202ENST00000342084 TSPY10P0CW01 314 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRR-202ENST00000342084 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRR-202ENST00000342084 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRR-202ENST00000342084 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRR-202ENST00000342084 KDM5DQ9BY66 1539 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRR-202ENST00000342084 RGL3Q3MIN7 710 aa9.87□□□□□ -0.83
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