RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329286.6

RAB12-201, Transcript of RAB12, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB12, Length 2,137 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB12-201ENST00000329286 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP43.83■■■■■ 4.61
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RAB12-201ENST00000329286 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.74■■■■■ 4.59
RAB12-201ENST00000329286 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP43.73■■■■■ 4.59
RAB12-201ENST00000329286 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.72■■■■■ 4.59
RAB12-201ENST00000329286 PLB1Q6P1J6 1458 aa43.7■■■■■ 4.59
RAB12-201ENST00000329286 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.7■■■■■ 4.59
RAB12-201ENST00000329286 NUP160Q12769 1436 aa43.69■■■■■ 4.58
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RAB12-201ENST00000329286 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.61■■■■■ 4.57
RAB12-201ENST00000329286 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP43.61■■■■■ 4.57
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RAB12-201ENST00000329286 TEX14Q8IWB6 1497 aa43.59■■■■■ 4.57
RAB12-201ENST00000329286 WASHC2AQ641Q2 1341 aa43.58■■■■■ 4.57
RAB12-201ENST00000329286 CROCC2H7BZ55 1655 aa43.57■■■■■ 4.57
RAB12-201ENST00000329286 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP43.56■■■■■ 4.56
RAB12-201ENST00000329286 ADGRL2O95490 1459 aa43.53■■■■■ 4.56
RAB12-201ENST00000329286 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP43.52■■■■■ 4.56
RAB12-201ENST00000329286 NCOA1Q15788 1441 aa43.51■■■■■ 4.56
RAB12-201ENST00000329286 PZPP20742 1482 aa43.5■■■■■ 4.55
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RAB12-201ENST00000329286 CNTLNQ9NXG0 1405 aa43.4■■■■■ 4.54
RAB12-201ENST00000329286 NBPF8Q3BBV2 869 aa43.37■■■■■ 4.53
RAB12-201ENST00000329286 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa43.37■■■■■ 4.53
RAB12-201ENST00000329286 ABCC10Q5T3U5 1492 aa43.34■■■■■ 4.53
RAB12-201ENST00000329286 CCDC7Q96M83 1385 aa43.32■■■■■ 4.53
RAB12-201ENST00000329286 FKBP8Q14318 412 aa43.32■■■■■ 4.53
RAB12-201ENST00000329286 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa43.31■■■■■ 4.52
RAB12-201ENST00000329286 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa43.3■■■■■ 4.52
RAB12-201ENST00000329286 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP43.3■■■■■ 4.52
RAB12-201ENST00000329286 ATP10BO94823 1461 aa43.3■■■■■ 4.52
RAB12-201ENST00000329286 SHANK2Q9UPX8 1470 aa43.29■■■■■ 4.52
RAB12-201ENST00000329286 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa43.29■■■■■ 4.52
RAB12-201ENST00000329286 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP43.28■■■■■ 4.52
RAB12-201ENST00000329286 MBD5Q9P267 1494 aa43.27■■■■■ 4.52
RAB12-201ENST00000329286 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP43.25■■■■■ 4.51
RAB12-201ENST00000329286 PLEKHD1A6NEE1 506 aa43.23■■■■■ 4.51
RAB12-201ENST00000329286 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa43.21■■■■■ 4.51
RAB12-201ENST00000329286 NEFLP07196 543 aa43.19■■■■■ 4.51
RAB12-201ENST00000329286 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa43.17■■■■■ 4.5
RAB12-201ENST00000329286 BCANQ96GW7 911 aa43.15■■■■■ 4.5
RAB12-201ENST00000329286 C9orf84Q5VXU9 1444 aa43.15■■■■■ 4.5
RAB12-201ENST00000329286 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP43.09■■■■■ 4.49
RAB12-201ENST00000329286 KDM5DQ9BY66 1539 aa43.09■■■■■ 4.49
RAB12-201ENST00000329286 PKD2Q13563 968 aa43.09■■■■■ 4.49
RAB12-201ENST00000329286 KIF7Q2M1P5 1343 aa43.08■■■■■ 4.49
RAB12-201ENST00000329286 ARHGEF5Q12774 1597 aa43.07■■■■■ 4.49
RAB12-201ENST00000329286 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP43.07■■■■■ 4.49
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RAB12-201ENST00000329286 NUP155O75694 1391 aa42.96■■■■■ 4.47
RAB12-201ENST00000329286 CCDC184Q52MB2 194 aa42.96■■■■■ 4.47
RAB12-201ENST00000329286 PREX2Q70Z35 1606 aa42.95■■■■■ 4.47
RAB12-201ENST00000329286 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa42.94■■■■■ 4.46
RAB12-201ENST00000329286 KDM5CP41229 1560 aa42.93■■■■■ 4.46
RAB12-201ENST00000329286 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa42.92■■■■■ 4.46
RAB12-201ENST00000329286 TSPY4P0CV99 314 aa42.92■■■■■ 4.46
RAB12-201ENST00000329286 TSPY10P0CW01 314 aa42.92■■■■■ 4.46
RAB12-201ENST00000329286 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa42.91■■■■■ 4.46
RAB12-201ENST00000329286 USP47Q96K76 1375 aa42.91■■■■■ 4.46
RAB12-201ENST00000329286 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa42.91■■■■■ 4.46
RAB12-201ENST00000329286 KIF15Q9NS87 1388 aa42.91■■■■■ 4.46
RAB12-201ENST00000329286 BCORL1Q5H9F3 1711 aa42.9■■■■■ 4.46
RAB12-201ENST00000329286 MYT1Q01538 1121 aa42.9■■■■■ 4.46
RAB12-201ENST00000329286 RALGAPBQ86X10 1494 aa42.87■■■■■ 4.45
RAB12-201ENST00000329286 CHD1O14646 1710 aa42.87■■■■■ 4.45
RAB12-201ENST00000329286 CCDC141Q6ZP82 1450 aa42.87■■■■■ 4.45
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RAB12-201ENST00000329286 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP42.78■■■■■ 4.44
RAB12-201ENST00000329286 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP42.77■■■■■ 4.44
RAB12-201ENST00000329286 RSPH4AQ5TD94 716 aa42.73■■■■■ 4.43
RAB12-201ENST00000329286 MAST1Q9Y2H9 1570 aa42.71■■■■■ 4.43
RAB12-201ENST00000329286 FAM135AQ9P2D6 1515 aa42.7■■■■■ 4.43
RAB12-201ENST00000329286 TTC37Q6PGP7 1564 aa42.7■■■■■ 4.43
RAB12-201ENST00000329286 FAM9BQ8IZU0 186 aa42.7■■■■■ 4.43
RAB12-201ENST00000329286 ZBED9Q6R2W3 1325 aa42.7■■■■■ 4.43
RAB12-201ENST00000329286 SYCP2Q9BX26 1530 aa42.66■■■■■ 4.42
RAB12-201ENST00000329286 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP42.64■■■■■ 4.422e-6■■■■□ 21.2
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RAB12-201ENST00000329286 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP42.62■■■■■ 4.41
RAB12-201ENST00000329286 ARHGAP5Q13017 1502 aa42.61■■■■■ 4.41
RAB12-201ENST00000329286 ABCC2Q92887 1545 aa42.61■■■■■ 4.41
RAB12-201ENST00000329286 CARD11Q9BXL7 1154 aa42.58■■■■■ 4.41
RAB12-201ENST00000329286 MYO5CQ9NQX4 1742 aa42.57■■■■■ 4.4
RAB12-201ENST00000329286 PLXNC1O60486 1568 aa42.55■■■■■ 4.4
RAB12-201ENST00000329286 ERICH6BQ5W0A0 696 aa42.55■■■■■ 4.4
RAB12-201ENST00000329286 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.53■■■■■ 4.4
RAB12-201ENST00000329286 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa42.51■■■■■ 4.4
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