RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 DAPK1P53355 1430 aa23.08■■□□□ 1.29
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SHQ1-201ENST00000325599 CEP170Q5SW79 1584 aa23.05■■□□□ 1.28
SHQ1-201ENST00000325599 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.04■■□□□ 1.28
SHQ1-201ENST00000325599 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
SHQ1-201ENST00000325599 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
SHQ1-201ENST00000325599 CCER2I3L3R5 266 aa23.02■■□□□ 1.28
SHQ1-201ENST00000325599 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
SHQ1-201ENST00000325599 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.02■■□□□ 1.28
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SHQ1-201ENST00000325599 SYNJ2O15056 1496 aa23■■□□□ 1.27
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SHQ1-201ENST00000325599 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.94■■□□□ 1.26
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SHQ1-201ENST00000325599 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.89■■□□□ 1.25
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SHQ1-201ENST00000325599 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.83■■□□□ 1.24
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SHQ1-201ENST00000325599 ATP10BO94823 1461 aa22.77■■□□□ 1.24
SHQ1-201ENST00000325599 ABCA8O94911 1581 aa22.77■■□□□ 1.24
SHQ1-201ENST00000325599 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.77■■□□□ 1.23
SHQ1-201ENST00000325599 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.76■■□□□ 1.23
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SHQ1-201ENST00000325599 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.74■■□□□ 1.23
SHQ1-201ENST00000325599 ADGRL2O95490 1459 aa22.74■■□□□ 1.23
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SHQ1-201ENST00000325599 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.74■■□□□ 1.23
SHQ1-201ENST00000325599 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.72■■□□□ 1.23
SHQ1-201ENST00000325599 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.72■■□□□ 1.23
SHQ1-201ENST00000325599 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.71■■□□□ 1.23
SHQ1-201ENST00000325599 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.7■■□□□ 1.23
SHQ1-201ENST00000325599 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.7■■□□□ 1.22
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SHQ1-201ENST00000325599 NUP155O75694 1391 aa22.64■■□□□ 1.22
SHQ1-201ENST00000325599 PTPRGP23470 1445 aa22.64■■□□□ 1.22
SHQ1-201ENST00000325599 TSPY4P0CV99 314 aa22.63■■□□□ 1.21
SHQ1-201ENST00000325599 TSPY10P0CW01 314 aa22.63■■□□□ 1.21
SHQ1-201ENST00000325599 MBD5Q9P267 1494 aa22.63■■□□□ 1.21
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SHQ1-201ENST00000325599 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.59■■□□□ 1.21
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SHQ1-201ENST00000325599 MRS2Q9HD23 443 aa22.57■■□□□ 1.2
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SHQ1-201ENST00000325599 KIF15Q9NS87 1388 aa22.56■■□□□ 1.2
SHQ1-201ENST00000325599 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.55■■□□□ 1.2
SHQ1-201ENST00000325599 CHD1O14646 1710 aa22.55■■□□□ 1.2
SHQ1-201ENST00000325599 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.54■■□□□ 1.2
SHQ1-201ENST00000325599 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.54■■□□□ 1.2
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SHQ1-201ENST00000325599 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.42■■□□□ 1.18
SHQ1-201ENST00000325599 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.41■■□□□ 1.18
SHQ1-201ENST00000325599 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.41■■□□□ 1.18
SHQ1-201ENST00000325599 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.18
SHQ1-201ENST00000325599 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.4■■□□□ 1.18
SHQ1-201ENST00000325599 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.4■■□□□ 1.18
SHQ1-201ENST00000325599 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.182e-6■■■■□ 20.7
SHQ1-201ENST00000325599 SHROOM2Q13796 1616 aa22.39■■□□□ 1.18
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