RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320031.12

ITGA3-202, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITGA3, Length 4,888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-202ENST00000320031 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.75■■□□□ 1.07
ITGA3-202ENST00000320031 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
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ITGA3-202ENST00000320031 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
ITGA3-202ENST00000320031 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.71■■□□□ 1.07
ITGA3-202ENST00000320031 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.71■■□□□ 1.07
ITGA3-202ENST00000320031 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.71■■□□□ 1.07
ITGA3-202ENST00000320031 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.71■■□□□ 1.07
ITGA3-202ENST00000320031 HDGFP51858 240 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
ITGA3-202ENST00000320031 KIF3BO15066 747 aa21.7■■□□□ 1.06
ITGA3-202ENST00000320031 NUDCQ9Y266 331 aa21.7■■□□□ 1.06
ITGA3-202ENST00000320031 IFT140Q96RY7 1462 aa21.69■■□□□ 1.06
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ITGA3-202ENST00000320031 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.59■■□□□ 1.05
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ITGA3-202ENST00000320031 OSCARQ8IYS5 282 aa21.57■■□□□ 1.04
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ITGA3-202ENST00000320031 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.53■■□□□ 1.04
ITGA3-202ENST00000320031 ZBTB7CA1YPR0 619 aa21.51■■□□□ 1.03
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ITGA3-202ENST00000320031 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
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ITGA3-202ENST00000320031 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.48■■□□□ 1.03
ITGA3-202ENST00000320031 TIAM1Q13009 1591 aa21.48■■□□□ 1.03
ITGA3-202ENST00000320031 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
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ITGA3-202ENST00000320031 STK26Q9P289 416 aa21.47■■□□□ 1.03
ITGA3-202ENST00000320031 KIF15Q9NS87 1388 aa21.46■■□□□ 1.03
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ITGA3-202ENST00000320031 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
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ITGA3-202ENST00000320031 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.43■■□□□ 1.02
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ITGA3-202ENST00000320031 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.41■■□□□ 1.02
ITGA3-202ENST00000320031 NLRP13Q86W25 1043 aa21.41■■□□□ 1.02
ITGA3-202ENST00000320031 CUL7Q14999 1698 aa21.41■■□□□ 1.02
ITGA3-202ENST00000320031 PLEKHG5O94827 1062 aa21.41■■□□□ 1.02
ITGA3-202ENST00000320031 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.4■■□□□ 1.02
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ITGA3-202ENST00000320031 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.4■■□□□ 1.02
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ITGA3-202ENST00000320031 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
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ITGA3-202ENST00000320031 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.34■■□□□ 1.01
ITGA3-202ENST00000320031 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.34■■□□□ 1.01
ITGA3-202ENST00000320031 STAC3Q96MF2 364 aa21.34■■□□□ 1.01
ITGA3-202ENST00000320031 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
ITGA3-202ENST00000320031 BECN1Q14457 450 aa21.33■■□□□ 1
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ITGA3-202ENST00000320031 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
ITGA3-202ENST00000320031 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
ITGA3-202ENST00000320031 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.31■■□□□ 1
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ITGA3-202ENST00000320031 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.28■■□□□ 1
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ITGA3-202ENST00000320031 PDE3BQ13370 1112 aa21.28■■□□□ 1
ITGA3-202ENST00000320031 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
ITGA3-202ENST00000320031 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
ITGA3-202ENST00000320031 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.27■■□□□ 1
ITGA3-202ENST00000320031 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
ITGA3-202ENST00000320031 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.27■■□□□ 1
ITGA3-202ENST00000320031 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.26■□□□□ 0.99
ITGA3-202ENST00000320031 PANK3Q9H999 370 aa21.26■□□□□ 0.99
ITGA3-202ENST00000320031 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.26■□□□□ 0.99
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