RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318160.4

GREM2-201, Transcript of gremlin 2, DAN family BMP antagonist, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GREM2, Length 4,170 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREM2-201ENST00000318160 WDR97A6NE52 1622 aa18.01■□□□□ 0.47
GREM2-201ENST00000318160 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP18.01■□□□□ 0.47
GREM2-201ENST00000318160 PTPN23Q9H3S7 1636 aa17.99■□□□□ 0.47
GREM2-201ENST00000318160 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
GREM2-201ENST00000318160 PTPRKQ15262 1439 aa17.99■□□□□ 0.47
GREM2-201ENST00000318160 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
GREM2-201ENST00000318160 PLB1Q6P1J6 1458 aa17.97■□□□□ 0.47
GREM2-201ENST00000318160 UGGT2Q9NYU1 1516 aa17.97■□□□□ 0.47
GREM2-201ENST00000318160 MAPKBP1O60336 1514 aa17.96■□□□□ 0.47
GREM2-201ENST00000318160 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP17.96■□□□□ 0.47
GREM2-201ENST00000318160 BCANQ96GW7 911 aa17.96■□□□□ 0.47
GREM2-201ENST00000318160 NUP155O75694 1391 aa17.95■□□□□ 0.46
GREM2-201ENST00000318160 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
GREM2-201ENST00000318160 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP17.93■□□□□ 0.46
GREM2-201ENST00000318160 RGL3Q3MIN7 710 aa17.91■□□□□ 0.46
GREM2-201ENST00000318160 DAPK1P53355 1430 aa17.91■□□□□ 0.46
GREM2-201ENST00000318160 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
GREM2-201ENST00000318160 KIAA0556O60303 1618 aa17.89■□□□□ 0.45
GREM2-201ENST00000318160 FAM9BQ8IZU0 186 aa17.88■□□□□ 0.45
GREM2-201ENST00000318160 DISP1Q96F81 1524 aa17.88■□□□□ 0.45
GREM2-201ENST00000318160 RSPH4AQ5TD94 716 aa17.87■□□□□ 0.45
GREM2-201ENST00000318160 CCER2I3L3R5 266 aa17.87■□□□□ 0.45
GREM2-201ENST00000318160 CARD11Q9BXL7 1154 aa17.87■□□□□ 0.45
GREM2-201ENST00000318160 MRS2Q9HD23 443 aa17.86■□□□□ 0.45
GREM2-201ENST00000318160 ABCC5O15440 1437 aa17.85■□□□□ 0.45
GREM2-201ENST00000318160 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa17.85■□□□□ 0.45
GREM2-201ENST00000318160 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa17.85■□□□□ 0.45
GREM2-201ENST00000318160 FKBP8Q14318 412 aa17.85■□□□□ 0.45
GREM2-201ENST00000318160 DCAF11Q8TEB1 546 aa17.85■□□□□ 0.45
GREM2-201ENST00000318160 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa17.84■□□□□ 0.45
GREM2-201ENST00000318160 ROCK1Q13464 1354 aa17.84■□□□□ 0.45
GREM2-201ENST00000318160 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa17.82■□□□□ 0.44
GREM2-201ENST00000318160 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
GREM2-201ENST00000318160 MYT1Q01538 1121 aa17.8■□□□□ 0.44
GREM2-201ENST00000318160 KIF15Q9NS87 1388 aa17.79■□□□□ 0.44
GREM2-201ENST00000318160 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa17.79■□□□□ 0.44
GREM2-201ENST00000318160 NUP160Q12769 1436 aa17.78■□□□□ 0.44
GREM2-201ENST00000318160 AKNAQ7Z591 1439 aa17.78■□□□□ 0.44
GREM2-201ENST00000318160 ARHGEF11O15085 1522 aa17.76■□□□□ 0.43
GREM2-201ENST00000318160 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
GREM2-201ENST00000318160 C9orf84Q5VXU9 1444 aa17.75■□□□□ 0.43
GREM2-201ENST00000318160 CEP170Q5SW79 1584 aa17.75■□□□□ 0.43
GREM2-201ENST00000318160 CHGAP10645 457 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
GREM2-201ENST00000318160 ATP10BO94823 1461 aa17.73■□□□□ 0.43
GREM2-201ENST00000318160 NCOA1Q15788 1441 aa17.73■□□□□ 0.43
GREM2-201ENST00000318160 TMC1Q8TDI8 760 aa17.73■□□□□ 0.43
GREM2-201ENST00000318160 NBPF8Q3BBV2 869 aa17.72■□□□□ 0.43
GREM2-201ENST00000318160 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
GREM2-201ENST00000318160 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa17.71■□□□□ 0.43
GREM2-201ENST00000318160 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
GREM2-201ENST00000318160 WASHC2AQ641Q2 1341 aa17.7■□□□□ 0.42
GREM2-201ENST00000318160 KIF14Q15058 1648 aa17.7■□□□□ 0.42
GREM2-201ENST00000318160 ARHGAP5Q13017 1502 aa17.69■□□□□ 0.42
GREM2-201ENST00000318160 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa17.69■□□□□ 0.42
GREM2-201ENST00000318160 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
GREM2-201ENST00000318160 CCDC144AA2RUR9 1427 aa17.65■□□□□ 0.42
GREM2-201ENST00000318160 USP47Q96K76 1375 aa17.64■□□□□ 0.41
GREM2-201ENST00000318160 CCDC7Q96M83 1385 aa17.63■□□□□ 0.41
GREM2-201ENST00000318160 ITSN2Q9NZM3 1697 aa17.62■□□□□ 0.41
GREM2-201ENST00000318160 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
GREM2-201ENST00000318160 KANK1Q14678 1352 aa17.61■□□□□ 0.41
GREM2-201ENST00000318160 KIF3BO15066 747 aa17.61■□□□□ 0.41
GREM2-201ENST00000318160 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa17.61■□□□□ 0.41
GREM2-201ENST00000318160 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa17.61■□□□□ 0.41
GREM2-201ENST00000318160 OSCARQ8IYS5 282 aa17.61■□□□□ 0.41
GREM2-201ENST00000318160 KIF7Q2M1P5 1343 aa17.61■□□□□ 0.41
GREM2-201ENST00000318160 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
GREM2-201ENST00000318160 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP17.6■□□□□ 0.41
GREM2-201ENST00000318160 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
GREM2-201ENST00000318160 CCDC141Q6ZP82 1450 aa17.6■□□□□ 0.41
GREM2-201ENST00000318160 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa17.59■□□□□ 0.41
GREM2-201ENST00000318160 AFAP1Q8N556 730 aa17.59■□□□□ 0.41
GREM2-201ENST00000318160 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.41
GREM2-201ENST00000318160 CNTLNQ9NXG0 1405 aa17.56■□□□□ 0.4
GREM2-201ENST00000318160 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa17.56■□□□□ 0.4
GREM2-201ENST00000318160 GCC2Q8IWJ2 1684 aa17.54■□□□□ 0.4
GREM2-201ENST00000318160 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
GREM2-201ENST00000318160 TMF1P82094 1093 aa17.53■□□□□ 0.4
GREM2-201ENST00000318160 KDM6BO15054 1643 aa17.53■□□□□ 0.4
GREM2-201ENST00000318160 GGT6Q6P531 493 aa17.53■□□□□ 0.4
GREM2-201ENST00000318160 ABCA8O94911 1581 aa17.51■□□□□ 0.39
GREM2-201ENST00000318160 ERICH6Q7L0X2 663 aa17.49■□□□□ 0.39
GREM2-201ENST00000318160 CDCA8Q53HL2 280 aa17.49■□□□□ 0.39
GREM2-201ENST00000318160 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
GREM2-201ENST00000318160 PZPP20742 1482 aa17.48■□□□□ 0.39
GREM2-201ENST00000318160 KNSTRNQ9Y448 316 aa17.47■□□□□ 0.39
GREM2-201ENST00000318160 ADGRL2O95490 1459 aa17.47■□□□□ 0.39
GREM2-201ENST00000318160 ABCC10Q5T3U5 1492 aa17.45■□□□□ 0.38
GREM2-201ENST00000318160 STAG3Q9UJ98 1225 aa17.45■□□□□ 0.38
GREM2-201ENST00000318160 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
GREM2-201ENST00000318160 SHANK2Q9UPX8 1470 aa17.45■□□□□ 0.38
GREM2-201ENST00000318160 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
GREM2-201ENST00000318160 SYCP2Q9BX26 1530 aa17.43■□□□□ 0.38
GREM2-201ENST00000318160 RALBP1Q15311 655 aa17.43■□□□□ 0.38
GREM2-201ENST00000318160 NBPF1Q3BBV0 1214 aa17.43■□□□□ 0.38
GREM2-201ENST00000318160 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
GREM2-201ENST00000318160 ABCC2Q92887 1545 aa17.42■□□□□ 0.38
GREM2-201ENST00000318160 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP17.42■□□□□ 0.38
GREM2-201ENST00000318160 CCDC184Q52MB2 194 aa17.42■□□□□ 0.38
GREM2-201ENST00000318160 SCAPERQ9BY12 1400 aa17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.9 ms