RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298564.14

TSPAN17-201, Transcript of tetraspanin 17, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPAN17, Length 2,810 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TSPAN17-201ENST00000298564 CEP170Q5SW79 1584 aa24.97■■□□□ 1.59
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TSPAN17-201ENST00000298564 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
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TSPAN17-201ENST00000298564 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.62■■□□□ 1.53
TSPAN17-201ENST00000298564 PZPP20742 1482 aa24.6■■□□□ 1.53
TSPAN17-201ENST00000298564 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.59■■□□□ 1.53
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TSPAN17-201ENST00000298564 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.58■■□□□ 1.53
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TSPAN17-201ENST00000298564 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.49■■□□□ 1.51
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TSPAN17-201ENST00000298564 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.43■■□□□ 1.5
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TSPAN17-201ENST00000298564 CHD1O14646 1710 aa24.42■■□□□ 1.5
TSPAN17-201ENST00000298564 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.42■■□□□ 1.5
TSPAN17-201ENST00000298564 KIF15Q9NS87 1388 aa24.39■■□□□ 1.49
TSPAN17-201ENST00000298564 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.38■■□□□ 1.49
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TSPAN17-201ENST00000298564 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.36■■□□□ 1.49
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TSPAN17-201ENST00000298564 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.31■■□□□ 1.48
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TSPAN17-201ENST00000298564 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.27■■□□□ 1.48
TSPAN17-201ENST00000298564 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
TSPAN17-201ENST00000298564 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.26■■□□□ 1.47
TSPAN17-201ENST00000298564 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.25■■□□□ 1.47
TSPAN17-201ENST00000298564 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.25■■□□□ 1.47
TSPAN17-201ENST00000298564 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.24■■□□□ 1.472e-6■■■■■ 51.7
TSPAN17-201ENST00000298564 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.24■■□□□ 1.47
TSPAN17-201ENST00000298564 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
TSPAN17-201ENST00000298564 ABCC2Q92887 1545 aa24.22■■□□□ 1.47
TSPAN17-201ENST00000298564 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.21■■□□□ 1.47
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