RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 MLECQ14165 292 aa13.31□□□□□ -0.28
PGGT1B-201ENST00000296642 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1B-201ENST00000296642 SAMD9Q5K651 1589 aa13.29□□□□□ -0.28
PGGT1B-201ENST00000296642 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa13.29□□□□□ -0.28
PGGT1B-201ENST00000296642 YEATS2Q9ULM3 1422 aa13.29□□□□□ -0.28
PGGT1B-201ENST00000296642 TTC37Q6PGP7 1564 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1B-201ENST00000296642 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
PGGT1B-201ENST00000296642 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
PGGT1B-201ENST00000296642 PREX1Q8TCU6 1659 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1B-201ENST00000296642 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa13.25□□□□□ -0.29
PGGT1B-201ENST00000296642 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP10AO60312 1499 aa13.24□□□□□ -0.29
PGGT1B-201ENST00000296642 C9orf84Q5VXU9 1444 aa13.24□□□□□ -0.29
PGGT1B-201ENST00000296642 CSRNP3Q8WYN3 585 aa13.24□□□□□ -0.29
PGGT1B-201ENST00000296642 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP13.23□□□□□ -0.29
PGGT1B-201ENST00000296642 SCAPERQ9BY12 1400 aa13.23□□□□□ -0.29
PGGT1B-201ENST00000296642 ILDR2Q71H61 639 aa13.23□□□□□ -0.29
PGGT1B-201ENST00000296642 MYT1LQ9UL68 1186 aa13.23□□□□□ -0.29
PGGT1B-201ENST00000296642 HECW1Q76N89 1606 aa13.22□□□□□ -0.29
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PGGT1B-201ENST00000296642 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa13.22□□□□□ -0.29
PGGT1B-201ENST00000296642 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
PGGT1B-201ENST00000296642 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa13.22□□□□□ -0.29
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa13.21□□□□□ -0.29
PGGT1B-201ENST00000296642 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
PGGT1B-201ENST00000296642 PLCH2O75038 1416 aa13.2□□□□□ -0.3
PGGT1B-201ENST00000296642 IQSEC2Q5JU85 1478 aa13.19□□□□□ -0.3
PGGT1B-201ENST00000296642 PTPRTO14522 1441 aa13.19□□□□□ -0.3
PGGT1B-201ENST00000296642 EEA1Q15075 1411 aa13.18□□□□□ -0.3
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa13.17□□□□□ -0.3
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PGGT1B-201ENST00000296642 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
PGGT1B-201ENST00000296642 MYO5CQ9NQX4 1742 aa13.13□□□□□ -0.31
PGGT1B-201ENST00000296642 STRCQ7RTU9 1775 aa13.13□□□□□ -0.31
PGGT1B-201ENST00000296642 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa13.13□□□□□ -0.31
PGGT1B-201ENST00000296642 CLIP1P30622 1438 aa13.12□□□□□ -0.31
PGGT1B-201ENST00000296642 FMN1Q68DA7 1419 aa13.11□□□□□ -0.31
PGGT1B-201ENST00000296642 CNTLNQ9NXG0 1405 aa13.11□□□□□ -0.31
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa13.11□□□□□ -0.31
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGAP5Q13017 1502 aa13.1□□□□□ -0.31
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PGGT1B-201ENST00000296642 KIF14Q15058 1648 aa13.09□□□□□ -0.31
PGGT1B-201ENST00000296642 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
PGGT1B-201ENST00000296642 KDM5CP41229 1560 aa13.07□□□□□ -0.32
PGGT1B-201ENST00000296642 AFAP1Q8N556 730 aa13.07□□□□□ -0.32
PGGT1B-201ENST00000296642 AGLP35573 1532 aa13.07□□□□□ -0.32
PGGT1B-201ENST00000296642 MLH3Q9UHC1 1453 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1B-201ENST00000296642 UBAP1LF5GYI3 381 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1B-201ENST00000296642 LTBP4Q8N2S1 1624 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1B-201ENST00000296642 C3P01024 1663 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1B-201ENST00000296642 NCOA1Q15788 1441 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1B-201ENST00000296642 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1B-201ENST00000296642 PKD2Q13563 968 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1B-201ENST00000296642 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PGGT1B-201ENST00000296642 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PGGT1B-201ENST00000296642 NPATQ14207 1427 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1B-201ENST00000296642 UBTFP17480 764 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
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PGGT1B-201ENST00000296642 MROH2AA6NES4 1674 aa12.99□□□□□ -0.33
PGGT1B-201ENST00000296642 ABCA6Q8N139 1617 aa12.99□□□□□ -0.33
PGGT1B-201ENST00000296642 TOM1O60784 492 aa12.98□□□□□ -0.33
PGGT1B-201ENST00000296642 PLA2R1Q13018 1463 aa12.97□□□□□ -0.33
PGGT1B-201ENST00000296642 ZMYM3Q14202 1370 aa12.97□□□□□ -0.33
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
PGGT1B-201ENST00000296642 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa12.96□□□□□ -0.33
PGGT1B-201ENST00000296642 ABCC1P33527 1531 aa12.96□□□□□ -0.33
PGGT1B-201ENST00000296642 PREX2Q70Z35 1606 aa12.95□□□□□ -0.34
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PGGT1B-201ENST00000296642 ITSN2Q9NZM3 1697 aa12.94□□□□□ -0.34
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC18Q5T9S5 1454 aa12.94□□□□□ -0.34
PGGT1B-201ENST00000296642 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa12.93□□□□□ -0.34
PGGT1B-201ENST00000296642 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
PGGT1B-201ENST00000296642 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa12.92□□□□□ -0.34
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa12.91□□□□□ -0.34
PGGT1B-201ENST00000296642 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
PGGT1B-201ENST00000296642 CPS1P31327 1500 aa12.9□□□□□ -0.34
PGGT1B-201ENST00000296642 PIP4K2BP78356 416 aa12.9□□□□□ -0.34
PGGT1B-201ENST00000296642 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
PGGT1B-201ENST00000296642 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa12.9□□□□□ -0.34
PGGT1B-201ENST00000296642 MYO3AQ8NEV4 1616 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1B-201ENST00000296642 GGT6Q6P531 493 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1B-201ENST00000296642 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PGGT1B-201ENST00000296642 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1B-201ENST00000296642 PTPRKQ15262 1439 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1B-201ENST00000296642 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
PGGT1B-201ENST00000296642 DCAF8L1A6NGE4 600 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1B-201ENST00000296642 HSPA1LP34931 641 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1B-201ENST00000296642 A2MP01023 1474 aa12.86□□□□□ -0.35
PGGT1B-201ENST00000296642 A2ML1A8K2U0 1454 aa12.85□□□□□ -0.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP7AQ04656 1500 aa12.85□□□□□ -0.35
PGGT1B-201ENST00000296642 EHMT2Q96KQ7 1210 aa12.85□□□□□ -0.35
PGGT1B-201ENST00000296642 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa12.85□□□□□ -0.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKLE2Q86XL3 938 aa12.84□□□□□ -0.35
PGGT1B-201ENST00000296642 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa12.84□□□□□ -0.35
PGGT1B-201ENST00000296642 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa12.84□□□□□ -0.35
PGGT1B-201ENST00000296642 SYCP2Q9BX26 1530 aa12.83□□□□□ -0.35
PGGT1B-201ENST00000296642 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP12.83□□□□□ -0.36
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