RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294702.5

GFI1-201, Transcript of growth factor independent 1 transcriptional repressor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GFI1, Length 2,784 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1-201ENST00000294702 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.12■■□□□ 1.77
GFI1-201ENST00000294702 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.12■■□□□ 1.77
GFI1-201ENST00000294702 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.11■■□□□ 1.77
GFI1-201ENST00000294702 MS4A1P11836 297 aa26.1■■□□□ 1.77
GFI1-201ENST00000294702 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
GFI1-201ENST00000294702 NESP48681 1621 aa26.09■■□□□ 1.77
GFI1-201ENST00000294702 IGF1RP08069 1367 aa26.09■■□□□ 1.77
GFI1-201ENST00000294702 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.07■■□□□ 1.76
GFI1-201ENST00000294702 ERCC6Q03468 1493 aa26.07■■□□□ 1.76
GFI1-201ENST00000294702 SLC4A3P48751 1232 aa26.06■■□□□ 1.76
GFI1-201ENST00000294702 FAM43AQ8N2R8 423 aa26.05■■□□□ 1.76
GFI1-201ENST00000294702 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.05■■□□□ 1.76
GFI1-201ENST00000294702 RRP1P56182 461 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
GFI1-201ENST00000294702 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.03■■□□□ 1.76
GFI1-201ENST00000294702 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
GFI1-201ENST00000294702 DDRGK1Q96HY6 314 aa26.02■■□□□ 1.76
GFI1-201ENST00000294702 FMN1Q68DA7 1419 aa26.01■■□□□ 1.75
GFI1-201ENST00000294702 SKAP1Q86WV1 359 aa26.01■■□□□ 1.75
GFI1-201ENST00000294702 NBPF8Q3BBV2 869 aa26■■□□□ 1.75
GFI1-201ENST00000294702 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
GFI1-201ENST00000294702 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
GFI1-201ENST00000294702 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.96■■□□□ 1.75
GFI1-201ENST00000294702 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.95■■□□□ 1.75
GFI1-201ENST00000294702 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.94■■□□□ 1.74
GFI1-201ENST00000294702 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.92■■□□□ 1.74
GFI1-201ENST00000294702 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.92■■□□□ 1.74
GFI1-201ENST00000294702 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.91■■□□□ 1.74
GFI1-201ENST00000294702 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
GFI1-201ENST00000294702 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.91■■□□□ 1.74
GFI1-201ENST00000294702 FOXD1Q16676 465 aa25.9■■□□□ 1.74
GFI1-201ENST00000294702 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.89■■□□□ 1.74
GFI1-201ENST00000294702 RCAN3Q9UKA8 241 aa25.89■■□□□ 1.74
GFI1-201ENST00000294702 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.84■■□□□ 1.73
GFI1-201ENST00000294702 TMC1Q8TDI8 760 aa25.84■■□□□ 1.73
GFI1-201ENST00000294702 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.84■■□□□ 1.73
GFI1-201ENST00000294702 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.83■■□□□ 1.73
GFI1-201ENST00000294702 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.72
GFI1-201ENST00000294702 ZMYND15Q9H091 742 aa25.82■■□□□ 1.72
GFI1-201ENST00000294702 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
GFI1-201ENST00000294702 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.81■■□□□ 1.72
GFI1-201ENST00000294702 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.81■■□□□ 1.72
GFI1-201ENST00000294702 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
GFI1-201ENST00000294702 VSIG10Q8N0Z9 540 aa25.78■■□□□ 1.72
GFI1-201ENST00000294702 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
GFI1-201ENST00000294702 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
GFI1-201ENST00000294702 HECW1Q76N89 1606 aa25.77■■□□□ 1.72
GFI1-201ENST00000294702 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.77■■□□□ 1.72
GFI1-201ENST00000294702 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa25.77■■□□□ 1.72
GFI1-201ENST00000294702 PLIN1O60240 522 aa25.76■■□□□ 1.71
GFI1-201ENST00000294702 KDM6BO15054 1643 aa25.76■■□□□ 1.71
GFI1-201ENST00000294702 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.72■■□□□ 1.71
GFI1-201ENST00000294702 TOPBP1Q92547 1522 aa25.72■■□□□ 1.71
GFI1-201ENST00000294702 CRBNQ96SW2 442 aa25.71■■□□□ 1.71
GFI1-201ENST00000294702 IFT140Q96RY7 1462 aa25.7■■□□□ 1.7
GFI1-201ENST00000294702 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.69■■□□□ 1.7
GFI1-201ENST00000294702 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
GFI1-201ENST00000294702 CDCA7LQ96GN5 454 aa25.68■■□□□ 1.7
GFI1-201ENST00000294702 POGKQ9P215 609 aa25.68■■□□□ 1.7
GFI1-201ENST00000294702 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.67■■□□□ 1.7
GFI1-201ENST00000294702 MIA2Q96PC5 1412 aa25.66■■□□□ 1.7
GFI1-201ENST00000294702 C8orf34Q49A92 452 aa25.66■■□□□ 1.7
GFI1-201ENST00000294702 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.64■■□□□ 1.7
GFI1-201ENST00000294702 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.62■■□□□ 1.69
GFI1-201ENST00000294702 FAM161AQ3B820 660 aa25.62■■□□□ 1.69
GFI1-201ENST00000294702 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.62■■□□□ 1.69
GFI1-201ENST00000294702 KDM2BQ8NHM5 1336 aa25.62■■□□□ 1.69
GFI1-201ENST00000294702 PDE3BQ13370 1112 aa25.61■■□□□ 1.69
GFI1-201ENST00000294702 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
GFI1-201ENST00000294702 USP47Q96K76 1375 aa25.59■■□□□ 1.69
GFI1-201ENST00000294702 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
GFI1-201ENST00000294702 C20orf194Q5TEA3 1177 aa25.58■■□□□ 1.69
GFI1-201ENST00000294702 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
GFI1-201ENST00000294702 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
GFI1-201ENST00000294702 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
GFI1-201ENST00000294702 KIF15Q9NS87 1388 aa25.54■■□□□ 1.68
GFI1-201ENST00000294702 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
GFI1-201ENST00000294702 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
GFI1-201ENST00000294702 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.53■■□□□ 1.68
GFI1-201ENST00000294702 RRP9O43818 475 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
GFI1-201ENST00000294702 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
GFI1-201ENST00000294702 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
GFI1-201ENST00000294702 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
GFI1-201ENST00000294702 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.5■■□□□ 1.67
GFI1-201ENST00000294702 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
GFI1-201ENST00000294702 RALBP1Q15311 655 aa25.49■■□□□ 1.67
GFI1-201ENST00000294702 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
GFI1-201ENST00000294702 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
GFI1-201ENST00000294702 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
GFI1-201ENST00000294702 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
GFI1-201ENST00000294702 ARHGEF11O15085 1522 aa25.46■■□□□ 1.67
GFI1-201ENST00000294702 CLCN1P35523 988 aa25.45■■□□□ 1.67
GFI1-201ENST00000294702 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
GFI1-201ENST00000294702 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP25.44■■□□□ 1.66
GFI1-201ENST00000294702 RGS3P49796 1198 aa25.44■■□□□ 1.66
GFI1-201ENST00000294702 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
GFI1-201ENST00000294702 ARXQ96QS3 562 aa25.43■■□□□ 1.66
GFI1-201ENST00000294702 GRIN2BQ13224 1484 aa25.43■■□□□ 1.66
GFI1-201ENST00000294702 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.43■■□□□ 1.66
GFI1-201ENST00000294702 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.42■■□□□ 1.66
GFI1-201ENST00000294702 USP19O94966 1318 aa25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.4 ms