RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293230.9

CYGB-201, Transcript of cytoglobin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CYGB, Length 2,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYGB-201ENST00000293230 DAPK1P53355 1430 aa27.85■■■□□ 2.05
CYGB-201ENST00000293230 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
CYGB-201ENST00000293230 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
CYGB-201ENST00000293230 KIF14Q15058 1648 aa27.83■■■□□ 2.05
CYGB-201ENST00000293230 PTPRGP23470 1445 aa27.81■■■□□ 2.04
CYGB-201ENST00000293230 ABCC5O15440 1437 aa27.81■■■□□ 2.04
CYGB-201ENST00000293230 TONSLQ96HA7 1378 aa27.8■■■□□ 2.04
CYGB-201ENST00000293230 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.8■■■□□ 2.04
CYGB-201ENST00000293230 ABCA8O94911 1581 aa27.8■■■□□ 2.04
CYGB-201ENST00000293230 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.76■■■□□ 2.03
CYGB-201ENST00000293230 ROCK1Q13464 1354 aa27.75■■■□□ 2.03
CYGB-201ENST00000293230 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
CYGB-201ENST00000293230 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa27.74■■■□□ 2.03
CYGB-201ENST00000293230 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.74■■■□□ 2.03
CYGB-201ENST00000293230 TRIM52Q96A61 297 aa27.73■■■□□ 2.03
CYGB-201ENST00000293230 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.73■■■□□ 2.03
CYGB-201ENST00000293230 ATP10BO94823 1461 aa27.7■■■□□ 2.02
CYGB-201ENST00000293230 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
CYGB-201ENST00000293230 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.66■■■□□ 2.02
CYGB-201ENST00000293230 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
CYGB-201ENST00000293230 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.63■■■□□ 2.01
CYGB-201ENST00000293230 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.63■■■□□ 2.01
CYGB-201ENST00000293230 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.63■■■□□ 2.01
CYGB-201ENST00000293230 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.63■■■□□ 2.01
CYGB-201ENST00000293230 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.62■■■□□ 2.01
CYGB-201ENST00000293230 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.62■■■□□ 2.01
CYGB-201ENST00000293230 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
CYGB-201ENST00000293230 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.6■■■□□ 2.01
CYGB-201ENST00000293230 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.6■■■□□ 2.01
CYGB-201ENST00000293230 FOXD1Q16676 465 aa27.6■■■□□ 2.01
CYGB-201ENST00000293230 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
CYGB-201ENST00000293230 ABCC2Q92887 1545 aa27.58■■■□□ 2.01
CYGB-201ENST00000293230 NCOA1Q15788 1441 aa27.57■■■□□ 2
CYGB-201ENST00000293230 ADGRL2O95490 1459 aa27.54■■■□□ 2
CYGB-201ENST00000293230 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.5■■□□□ 1.99
CYGB-201ENST00000293230 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.48■■□□□ 1.99
CYGB-201ENST00000293230 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.48■■□□□ 1.99
CYGB-201ENST00000293230 PZPP20742 1482 aa27.48■■□□□ 1.99
CYGB-201ENST00000293230 KCNH8Q96L42 1107 aa27.46■■□□□ 1.99
CYGB-201ENST00000293230 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
CYGB-201ENST00000293230 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
CYGB-201ENST00000293230 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
CYGB-201ENST00000293230 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.43■■□□□ 1.98
CYGB-201ENST00000293230 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.43■■□□□ 1.98
CYGB-201ENST00000293230 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.42■■□□□ 1.98
CYGB-201ENST00000293230 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.4■■□□□ 1.98
CYGB-201ENST00000293230 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.4■■□□□ 1.98
CYGB-201ENST00000293230 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.39■■□□□ 1.98
CYGB-201ENST00000293230 BCL11AQ9H165 835 aa27.39■■□□□ 1.97
CYGB-201ENST00000293230 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.38■■□□□ 1.97
CYGB-201ENST00000293230 PREX2Q70Z35 1606 aa27.38■■□□□ 1.97
CYGB-201ENST00000293230 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.36■■□□□ 1.97
CYGB-201ENST00000293230 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.35■■□□□ 1.97
CYGB-201ENST00000293230 MBD5Q9P267 1494 aa27.35■■□□□ 1.97
CYGB-201ENST00000293230 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.33■■□□□ 1.97
CYGB-201ENST00000293230 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.32■■□□□ 1.96
CYGB-201ENST00000293230 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
CYGB-201ENST00000293230 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.31■■□□□ 1.96
CYGB-201ENST00000293230 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.29■■□□□ 1.96
CYGB-201ENST00000293230 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.28■■□□□ 1.96
CYGB-201ENST00000293230 NBPF8Q3BBV2 869 aa27.28■■□□□ 1.96
CYGB-201ENST00000293230 TSPY4P0CV99 314 aa27.28■■□□□ 1.96
CYGB-201ENST00000293230 TSPY10P0CW01 314 aa27.28■■□□□ 1.96
CYGB-201ENST00000293230 PKD2Q13563 968 aa27.26■■□□□ 1.95
CYGB-201ENST00000293230 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.26■■□□□ 1.95
CYGB-201ENST00000293230 KIF15Q9NS87 1388 aa27.25■■□□□ 1.95
CYGB-201ENST00000293230 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.25■■□□□ 1.95
CYGB-201ENST00000293230 WASHC2AQ641Q2 1341 aa27.25■■□□□ 1.95
CYGB-201ENST00000293230 ANP32CO43423 234 aa27.24■■□□□ 1.95
CYGB-201ENST00000293230 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.23■■□□□ 1.95
CYGB-201ENST00000293230 NUP155O75694 1391 aa27.22■■□□□ 1.95
CYGB-201ENST00000293230 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.22■■□□□ 1.95
CYGB-201ENST00000293230 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.22■■□□□ 1.95
CYGB-201ENST00000293230 ASXL2Q76L83 1435 aa27.21■■□□□ 1.95
CYGB-201ENST00000293230 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.19■■□□□ 1.94
CYGB-201ENST00000293230 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.19■■□□□ 1.94
CYGB-201ENST00000293230 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.19■■□□□ 1.94
CYGB-201ENST00000293230 CCER2I3L3R5 266 aa27.18■■□□□ 1.94
CYGB-201ENST00000293230 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
CYGB-201ENST00000293230 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.12■■□□□ 1.93
CYGB-201ENST00000293230 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.12■■□□□ 1.93
CYGB-201ENST00000293230 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.12■■□□□ 1.93
CYGB-201ENST00000293230 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
CYGB-201ENST00000293230 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.07■■□□□ 1.92
CYGB-201ENST00000293230 CCDC7Q96M83 1385 aa27.07■■□□□ 1.92
CYGB-201ENST00000293230 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.06■■□□□ 1.92
CYGB-201ENST00000293230 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.05■■□□□ 1.92
CYGB-201ENST00000293230 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.04■■□□□ 1.92
CYGB-201ENST00000293230 PLCH2O75038 1416 aa27.04■■□□□ 1.92
CYGB-201ENST00000293230 PLXNC1O60486 1568 aa27.04■■□□□ 1.92
CYGB-201ENST00000293230 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
CYGB-201ENST00000293230 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
CYGB-201ENST00000293230 UNC13BO14795 1591 aa27.01■■□□□ 1.91
CYGB-201ENST00000293230 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.99■■□□□ 1.91
CYGB-201ENST00000293230 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.98■■□□□ 1.91
CYGB-201ENST00000293230 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.97■■□□□ 1.91
CYGB-201ENST00000293230 ABCC1P33527 1531 aa26.97■■□□□ 1.91
CYGB-201ENST00000293230 USP47Q96K76 1375 aa26.94■■□□□ 1.9
CYGB-201ENST00000293230 KDM5CP41229 1560 aa26.94■■□□□ 1.9
CYGB-201ENST00000293230 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.7 ms