RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 CD109Q6YHK3 1445 aa11.75□□□□□ -0.53
SMARCE1-201ENST00000264640 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa11.75□□□□□ -0.53
SMARCE1-201ENST00000264640 BCORL1Q5H9F3 1711 aa11.73□□□□□ -0.53
SMARCE1-201ENST00000264640 UGGT2Q9NYU1 1516 aa11.73□□□□□ -0.53
SMARCE1-201ENST00000264640 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
SMARCE1-201ENST00000264640 SPDYE2BA6NHP3 402 aa11.72□□□□□ -0.53
SMARCE1-201ENST00000264640 SPDYE6P0CI01 402 aa11.72□□□□□ -0.53
SMARCE1-201ENST00000264640 SPDYE2Q495Y8 402 aa11.72□□□□□ -0.53
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNH8Q96L42 1107 aa11.71□□□□□ -0.53
SMARCE1-201ENST00000264640 ILDR2Q71H61 639 aa11.7□□□□□ -0.54
SMARCE1-201ENST00000264640 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa11.7□□□□□ -0.54
SMARCE1-201ENST00000264640 ARAP3Q8WWN8 1544 aa11.68□□□□□ -0.54
SMARCE1-201ENST00000264640 ABCA8O94911 1581 aa11.67□□□□□ -0.54
SMARCE1-201ENST00000264640 DISP3Q9P2K9 1392 aa11.67□□□□□ -0.54
SMARCE1-201ENST00000264640 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa11.66□□□□□ -0.54
SMARCE1-201ENST00000264640 HSPA2P54652 639 aa11.65□□□□□ -0.54
SMARCE1-201ENST00000264640 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
SMARCE1-201ENST00000264640 SOCS7O14512 581 aa11.64□□□□□ -0.55
SMARCE1-201ENST00000264640 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-201ENST00000264640 HAX1O00165 279 aa11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-201ENST00000264640 ABCA9Q8IUA7 1624 aa11.63□□□□□ -0.55
SMARCE1-201ENST00000264640 ARID3CA6NKF2 412 aa11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-201ENST00000264640 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa11.62□□□□□ -0.55
SMARCE1-201ENST00000264640 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
SMARCE1-201ENST00000264640 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa11.61□□□□□ -0.55
SMARCE1-201ENST00000264640 RAPGEF3O95398 923 aa11.61□□□□□ -0.55
SMARCE1-201ENST00000264640 CERKQ8TCT0 537 aa11.61□□□□□ -0.55
SMARCE1-201ENST00000264640 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa11.6□□□□□ -0.55
SMARCE1-201ENST00000264640 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa11.59□□□□□ -0.55
SMARCE1-201ENST00000264640 RICTORQ6R327 1708 aa11.58□□□□□ -0.56
SMARCE1-201ENST00000264640 SSUH2Q9Y2M2 353 aa11.57□□□□□ -0.56
SMARCE1-201ENST00000264640 GOLGA3Q08378 1498 aa11.56□□□□□ -0.56
SMARCE1-201ENST00000264640 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
SMARCE1-201ENST00000264640 NEO1Q92859 1461 aa11.54□□□□□ -0.56
SMARCE1-201ENST00000264640 PREX1Q8TCU6 1659 aa11.53□□□□□ -0.56
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP10BO94823 1461 aa11.53□□□□□ -0.56
SMARCE1-201ENST00000264640 STRCQ7RTU9 1775 aa11.53□□□□□ -0.56
SMARCE1-201ENST00000264640 EVX2Q03828 476 aa11.52□□□□□ -0.57
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
SMARCE1-201ENST00000264640 PHLDB1Q86UU1 1377 aa11.52□□□□□ -0.57
SMARCE1-201ENST00000264640 TTC37Q6PGP7 1564 aa11.51□□□□□ -0.57
SMARCE1-201ENST00000264640 FANCAO15360 1455 aa11.5□□□□□ -0.57
SMARCE1-201ENST00000264640 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa11.49□□□□□ -0.57
SMARCE1-201ENST00000264640 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa11.48□□□□□ -0.57
SMARCE1-201ENST00000264640 CFAP74Q9C0B2 1584 aa11.47□□□□□ -0.57
SMARCE1-201ENST00000264640 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
SMARCE1-201ENST00000264640 POGZQ7Z3K3 1410 aa11.47□□□□□ -0.57
SMARCE1-201ENST00000264640 YEATS2Q9ULM3 1422 aa11.47□□□□□ -0.57
SMARCE1-201ENST00000264640 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
SMARCE1-201ENST00000264640 MLECQ14165 292 aa11.47□□□□□ -0.57
SMARCE1-201ENST00000264640 P3H3Q8IVL6 736 aa11.47□□□□□ -0.57
SMARCE1-201ENST00000264640 CLEC11AQ9Y240 323 aa11.47□□□□□ -0.57
SMARCE1-201ENST00000264640 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa11.46□□□□□ -0.57
SMARCE1-201ENST00000264640 EFCAB5A4FU69 1503 aa11.45□□□□□ -0.58
SMARCE1-201ENST00000264640 AKNAQ7Z591 1439 aa11.45□□□□□ -0.58
SMARCE1-201ENST00000264640 HECW1Q76N89 1606 aa11.44□□□□□ -0.58
SMARCE1-201ENST00000264640 FHOD3Q2V2M9 1422 aa11.43□□□□□ -0.58
SMARCE1-201ENST00000264640 SAMD9Q5K651 1589 aa11.42□□□□□ -0.58
SMARCE1-201ENST00000264640 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa11.42□□□□□ -0.58
SMARCE1-201ENST00000264640 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
SMARCE1-201ENST00000264640 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP11.4□□□□□ -0.58
SMARCE1-201ENST00000264640 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
SMARCE1-201ENST00000264640 C19orf67A6NJJ6 358 aa11.39□□□□□ -0.59
SMARCE1-201ENST00000264640 LTBP4Q8N2S1 1624 aa11.38□□□□□ -0.59
SMARCE1-201ENST00000264640 C3P01024 1663 aa11.38□□□□□ -0.59
SMARCE1-201ENST00000264640 PRXQ9BXM0 1461 aa11.38□□□□□ -0.59
SMARCE1-201ENST00000264640 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa11.37□□□□□ -0.59
SMARCE1-201ENST00000264640 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
SMARCE1-201ENST00000264640 MAGI2Q86UL8 1455 aa11.36□□□□□ -0.59
SMARCE1-201ENST00000264640 C9orf84Q5VXU9 1444 aa11.35□□□□□ -0.59
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP10AO60312 1499 aa11.33□□□□□ -0.6
SMARCE1-201ENST00000264640 MYO5CQ9NQX4 1742 aa11.33□□□□□ -0.6
SMARCE1-201ENST00000264640 CSRNP3Q8WYN3 585 aa11.33□□□□□ -0.6
SMARCE1-201ENST00000264640 PTPRTO14522 1441 aa11.33□□□□□ -0.6
SMARCE1-201ENST00000264640 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
SMARCE1-201ENST00000264640 SCAPERQ9BY12 1400 aa11.32□□□□□ -0.6
SMARCE1-201ENST00000264640 IQSEC2Q5JU85 1478 aa11.32□□□□□ -0.6
SMARCE1-201ENST00000264640 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SMARCE1-201ENST00000264640 PLEKHD1A6NEE1 506 aa11.3□□□□□ -0.6
SMARCE1-201ENST00000264640 CHADLQ6NUI6 762 aa11.3□□□□□ -0.6
SMARCE1-201ENST00000264640 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
SMARCE1-201ENST00000264640 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
SMARCE1-201ENST00000264640 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa11.29□□□□□ -0.6
SMARCE1-201ENST00000264640 ABCA6Q8N139 1617 aa11.29□□□□□ -0.6
SMARCE1-201ENST00000264640 PRR29P0C7W0 189 aa11.29□□□□□ -0.6
SMARCE1-201ENST00000264640 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa11.27□□□□□ -0.6
SMARCE1-201ENST00000264640 NCOA1Q15788 1441 aa11.27□□□□□ -0.6
SMARCE1-201ENST00000264640 KIF14Q15058 1648 aa11.27□□□□□ -0.61
SMARCE1-201ENST00000264640 KDM5CP41229 1560 aa11.26□□□□□ -0.61
SMARCE1-201ENST00000264640 PLCH2O75038 1416 aa11.26□□□□□ -0.61
SMARCE1-201ENST00000264640 UBAP1LF5GYI3 381 aa11.25□□□□□ -0.61
SMARCE1-201ENST00000264640 GABBR2O75899 941 aa11.24□□□□□ -0.61
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
SMARCE1-201ENST00000264640 REREQ9P2R6 1566 aa11.24□□□□□ -0.61
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa11.23□□□□□ -0.61
SMARCE1-201ENST00000264640 ARHGAP5Q13017 1502 aa11.22□□□□□ -0.61
SMARCE1-201ENST00000264640 MYT1LQ9UL68 1186 aa11.22□□□□□ -0.61
SMARCE1-201ENST00000264640 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa11.21□□□□□ -0.61
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms