RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264350.7

HERC5-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC5, Length 3,513 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5-201ENST00000264350 TSPY4P0CV99 314 aa18.72■□□□□ 0.59
HERC5-201ENST00000264350 TSPY10P0CW01 314 aa18.72■□□□□ 0.59
HERC5-201ENST00000264350 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
HERC5-201ENST00000264350 KDM5BQ9UGL1 1544 aa18.71■□□□□ 0.59
HERC5-201ENST00000264350 PLB1Q6P1J6 1458 aa18.71■□□□□ 0.59
HERC5-201ENST00000264350 MRS2Q9HD23 443 aa18.7■□□□□ 0.58
HERC5-201ENST00000264350 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa18.69■□□□□ 0.58
HERC5-201ENST00000264350 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
HERC5-201ENST00000264350 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa18.69■□□□□ 0.58
HERC5-201ENST00000264350 RGL3Q3MIN7 710 aa18.68■□□□□ 0.58
HERC5-201ENST00000264350 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP18.68■□□□□ 0.58
HERC5-201ENST00000264350 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
HERC5-201ENST00000264350 PKD2Q13563 968 aa18.68■□□□□ 0.58
HERC5-201ENST00000264350 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa18.65■□□□□ 0.58
HERC5-201ENST00000264350 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa18.65■□□□□ 0.58
HERC5-201ENST00000264350 GRIN2AQ12879 1464 aa18.65■□□□□ 0.58
HERC5-201ENST00000264350 FANCIQ9NVI1 1328 aa18.65■□□□□ 0.58
HERC5-201ENST00000264350 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.58
HERC5-201ENST00000264350 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa18.64■□□□□ 0.57
HERC5-201ENST00000264350 PTPN23Q9H3S7 1636 aa18.64■□□□□ 0.57
HERC5-201ENST00000264350 ADAMTS12P58397 1594 aa18.62■□□□□ 0.57
HERC5-201ENST00000264350 PBRM1Q86U86 1689 aa18.6■□□□□ 0.57
HERC5-201ENST00000264350 SAMD9Q5K651 1589 aa18.6■□□□□ 0.57
HERC5-201ENST00000264350 HECW1Q76N89 1606 aa18.59■□□□□ 0.57
HERC5-201ENST00000264350 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa18.59■□□□□ 0.57
HERC5-201ENST00000264350 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
HERC5-201ENST00000264350 NBPF8Q3BBV2 869 aa18.58■□□□□ 0.57
HERC5-201ENST00000264350 ERICH6Q7L0X2 663 aa18.56■□□□□ 0.56
HERC5-201ENST00000264350 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
HERC5-201ENST00000264350 UGGT2Q9NYU1 1516 aa18.56■□□□□ 0.56
HERC5-201ENST00000264350 NUP155O75694 1391 aa18.56■□□□□ 0.56
HERC5-201ENST00000264350 PTPRGP23470 1445 aa18.55■□□□□ 0.56
HERC5-201ENST00000264350 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
HERC5-201ENST00000264350 KDM6BO15054 1643 aa18.55■□□□□ 0.56
HERC5-201ENST00000264350 DISP1Q96F81 1524 aa18.54■□□□□ 0.56
HERC5-201ENST00000264350 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
HERC5-201ENST00000264350 DCAF11Q8TEB1 546 aa18.53■□□□□ 0.56
HERC5-201ENST00000264350 ABCC5O15440 1437 aa18.52■□□□□ 0.56
HERC5-201ENST00000264350 DAPK1P53355 1430 aa18.52■□□□□ 0.56
HERC5-201ENST00000264350 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
HERC5-201ENST00000264350 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
HERC5-201ENST00000264350 PPP4R2Q9NY27 417 aa18.52■□□□□ 0.56
HERC5-201ENST00000264350 NBR1Q14596 966 aa18.52■□□□□ 0.56
HERC5-201ENST00000264350 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
HERC5-201ENST00000264350 SYNJ2O15056 1496 aa18.5■□□□□ 0.55
HERC5-201ENST00000264350 WDR62O43379 1518 aa18.49■□□□□ 0.55
HERC5-201ENST00000264350 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
HERC5-201ENST00000264350 DEKP35659 375 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
HERC5-201ENST00000264350 CARD11Q9BXL7 1154 aa18.48■□□□□ 0.55
HERC5-201ENST00000264350 MIA2Q96PC5 1412 aa18.48■□□□□ 0.55
HERC5-201ENST00000264350 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa18.47■□□□□ 0.55
HERC5-201ENST00000264350 CCDC7Q96M83 1385 aa18.46■□□□□ 0.55
HERC5-201ENST00000264350 AKNAQ7Z591 1439 aa18.46■□□□□ 0.55
HERC5-201ENST00000264350 KIF7Q2M1P5 1343 aa18.46■□□□□ 0.55
HERC5-201ENST00000264350 CNTLNQ9NXG0 1405 aa18.45■□□□□ 0.54
HERC5-201ENST00000264350 ARHGEF11O15085 1522 aa18.45■□□□□ 0.54
HERC5-201ENST00000264350 KIAA0556O60303 1618 aa18.45■□□□□ 0.54
HERC5-201ENST00000264350 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
HERC5-201ENST00000264350 TMC1Q8TDI8 760 aa18.41■□□□□ 0.54
HERC5-201ENST00000264350 CEP170Q5SW79 1584 aa18.41■□□□□ 0.54
HERC5-201ENST00000264350 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa18.4■□□□□ 0.54
HERC5-201ENST00000264350 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa18.4■□□□□ 0.54
HERC5-201ENST00000264350 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa18.4■□□□□ 0.54
HERC5-201ENST00000264350 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa18.39■□□□□ 0.53
HERC5-201ENST00000264350 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
HERC5-201ENST00000264350 ZBED9Q6R2W3 1325 aa18.38■□□□□ 0.53
HERC5-201ENST00000264350 NCOA1Q15788 1441 aa18.37■□□□□ 0.53
HERC5-201ENST00000264350 KIF15Q9NS87 1388 aa18.37■□□□□ 0.53
HERC5-201ENST00000264350 ATP10BO94823 1461 aa18.36■□□□□ 0.53
HERC5-201ENST00000264350 CHGAP10645 457 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
HERC5-201ENST00000264350 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
HERC5-201ENST00000264350 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa18.35■□□□□ 0.53
HERC5-201ENST00000264350 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
HERC5-201ENST00000264350 KIF14Q15058 1648 aa18.33■□□□□ 0.53
HERC5-201ENST00000264350 AFAP1Q8N556 730 aa18.32■□□□□ 0.52
HERC5-201ENST00000264350 USP47Q96K76 1375 aa18.32■□□□□ 0.52
HERC5-201ENST00000264350 C9orf84Q5VXU9 1444 aa18.32■□□□□ 0.52
HERC5-201ENST00000264350 CCDC136Q96JN2 1154 aa18.3■□□□□ 0.52
HERC5-201ENST00000264350 ERICH6BQ5W0A0 696 aa18.29■□□□□ 0.52
HERC5-201ENST00000264350 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
HERC5-201ENST00000264350 ROCK1Q13464 1354 aa18.29■□□□□ 0.52
HERC5-201ENST00000264350 NBPF1Q3BBV0 1214 aa18.27■□□□□ 0.52
HERC5-201ENST00000264350 NUP160Q12769 1436 aa18.27■□□□□ 0.52
HERC5-201ENST00000264350 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC5-201ENST00000264350 GCC2Q8IWJ2 1684 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC5-201ENST00000264350 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC5-201ENST00000264350 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
HERC5-201ENST00000264350 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa18.24■□□□□ 0.51
HERC5-201ENST00000264350 TEX14Q8IWB6 1497 aa18.24■□□□□ 0.51
HERC5-201ENST00000264350 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
HERC5-201ENST00000264350 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP18.23■□□□□ 0.51
HERC5-201ENST00000264350 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
HERC5-201ENST00000264350 SKAP1Q86WV1 359 aa18.23■□□□□ 0.51
HERC5-201ENST00000264350 ARHGAP5Q13017 1502 aa18.22■□□□□ 0.51
HERC5-201ENST00000264350 BCORL1Q5H9F3 1711 aa18.22■□□□□ 0.51
HERC5-201ENST00000264350 KIF3BO15066 747 aa18.21■□□□□ 0.51
HERC5-201ENST00000264350 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
HERC5-201ENST00000264350 NUDCQ9Y266 331 aa18.2■□□□□ 0.5
HERC5-201ENST00000264350 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
HERC5-201ENST00000264350 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
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