RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257604.9

TRAFD1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain containing 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene TRAFD1, Length 3,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1-201ENST00000257604 PTPRGP23470 1445 aa20.71■□□□□ 0.91
TRAFD1-201ENST00000257604 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.7■□□□□ 0.95e-6■■■□□ 14.8
TRAFD1-201ENST00000257604 UACAQ9BZF9 1416 aa20.68■□□□□ 0.9
TRAFD1-201ENST00000257604 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.68■□□□□ 0.9
TRAFD1-201ENST00000257604 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.68■□□□□ 0.9
TRAFD1-201ENST00000257604 TSPY4P0CV99 314 aa20.67■□□□□ 0.9
TRAFD1-201ENST00000257604 TSPY10P0CW01 314 aa20.67■□□□□ 0.9
TRAFD1-201ENST00000257604 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.66■□□□□ 0.9
TRAFD1-201ENST00000257604 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
TRAFD1-201ENST00000257604 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.64■□□□□ 0.89
TRAFD1-201ENST00000257604 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
TRAFD1-201ENST00000257604 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.62■□□□□ 0.89
TRAFD1-201ENST00000257604 ABCC5O15440 1437 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAFD1-201ENST00000257604 DAPK1P53355 1430 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAFD1-201ENST00000257604 KDM6BO15054 1643 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAFD1-201ENST00000257604 NUP160Q12769 1436 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAFD1-201ENST00000257604 PKD2Q13563 968 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAFD1-201ENST00000257604 ARHGEF11O15085 1522 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAFD1-201ENST00000257604 MIA2Q96PC5 1412 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAFD1-201ENST00000257604 ATP10BO94823 1461 aa20.56■□□□□ 0.88
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TRAFD1-201ENST00000257604 ANP32CO43423 234 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAFD1-201ENST00000257604 KIF14Q15058 1648 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAFD1-201ENST00000257604 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
TRAFD1-201ENST00000257604 RGL3Q3MIN7 710 aa20.52■□□□□ 0.88
TRAFD1-201ENST00000257604 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.52■□□□□ 0.88
TRAFD1-201ENST00000257604 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.52■□□□□ 0.87
TRAFD1-201ENST00000257604 NUP155O75694 1391 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAFD1-201ENST00000257604 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAFD1-201ENST00000257604 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
TRAFD1-201ENST00000257604 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
TRAFD1-201ENST00000257604 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAFD1-201ENST00000257604 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAFD1-201ENST00000257604 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAFD1-201ENST00000257604 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAFD1-201ENST00000257604 NCOA1Q15788 1441 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAFD1-201ENST00000257604 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAFD1-201ENST00000257604 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
TRAFD1-201ENST00000257604 CHD1O14646 1710 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAFD1-201ENST00000257604 AKNAQ7Z591 1439 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAFD1-201ENST00000257604 FKBP8Q14318 412 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAFD1-201ENST00000257604 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
TRAFD1-201ENST00000257604 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAFD1-201ENST00000257604 BCL11AQ9H165 835 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAFD1-201ENST00000257604 KIF15Q9NS87 1388 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAFD1-201ENST00000257604 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAFD1-201ENST00000257604 AFAP1Q8N556 730 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAFD1-201ENST00000257604 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAFD1-201ENST00000257604 WASHC2AQ641Q2 1341 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAFD1-201ENST00000257604 ROCK1Q13464 1354 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAFD1-201ENST00000257604 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
TRAFD1-201ENST00000257604 ABCA8O94911 1581 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAFD1-201ENST00000257604 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
TRAFD1-201ENST00000257604 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAFD1-201ENST00000257604 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.31■□□□□ 0.84
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TRAFD1-201ENST00000257604 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.28■□□□□ 0.84
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TRAFD1-201ENST00000257604 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.83
TRAFD1-201ENST00000257604 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAFD1-201ENST00000257604 CCDC184Q52MB2 194 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAFD1-201ENST00000257604 PZPP20742 1482 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAFD1-201ENST00000257604 ANP32EQ9BTT0 268 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAFD1-201ENST00000257604 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
TRAFD1-201ENST00000257604 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAFD1-201ENST00000257604 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAFD1-201ENST00000257604 OSCARQ8IYS5 282 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAFD1-201ENST00000257604 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
TRAFD1-201ENST00000257604 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAFD1-201ENST00000257604 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAFD1-201ENST00000257604 MRS2Q9HD23 443 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAFD1-201ENST00000257604 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
TRAFD1-201ENST00000257604 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAFD1-201ENST00000257604 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAFD1-201ENST00000257604 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAFD1-201ENST00000257604 KIF3BO15066 747 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAFD1-201ENST00000257604 CHGAP10645 457 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
TRAFD1-201ENST00000257604 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAFD1-201ENST00000257604 NBPF1Q3BBV0 1214 aa20.15■□□□□ 0.82
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TRAFD1-201ENST00000257604 USP47Q96K76 1375 aa20.14■□□□□ 0.81
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TRAFD1-201ENST00000257604 ABCC2Q92887 1545 aa20.12■□□□□ 0.81
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TRAFD1-201ENST00000257604 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
TRAFD1-201ENST00000257604 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAFD1-201ENST00000257604 NEFLP07196 543 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAFD1-201ENST00000257604 CCER2I3L3R5 266 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAFD1-201ENST00000257604 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
TRAFD1-201ENST00000257604 GGT6Q6P531 493 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAFD1-201ENST00000257604 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAFD1-201ENST00000257604 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
TRAFD1-201ENST00000257604 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAFD1-201ENST00000257604 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
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