RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253754.7

PDLIM4-201, Transcript of PDZ and LIM domain 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDLIM4, Length 2,282 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM4-201ENST00000253754 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.93■■□□□ 1.9
PDLIM4-201ENST00000253754 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.93■■□□□ 1.9
PDLIM4-201ENST00000253754 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.92■■□□□ 1.9
PDLIM4-201ENST00000253754 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
PDLIM4-201ENST00000253754 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
PDLIM4-201ENST00000253754 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.88■■□□□ 1.89
PDLIM4-201ENST00000253754 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.88■■□□□ 1.89
PDLIM4-201ENST00000253754 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.87■■□□□ 1.89
PDLIM4-201ENST00000253754 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
PDLIM4-201ENST00000253754 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.86■■□□□ 1.89
PDLIM4-201ENST00000253754 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.86■■□□□ 1.89
PDLIM4-201ENST00000253754 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.86■■□□□ 1.89
PDLIM4-201ENST00000253754 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.86■■□□□ 1.89
PDLIM4-201ENST00000253754 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
PDLIM4-201ENST00000253754 KDM6BO15054 1643 aa26.84■■□□□ 1.89
PDLIM4-201ENST00000253754 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.83■■□□□ 1.89
PDLIM4-201ENST00000253754 KCNH8Q96L42 1107 aa26.82■■□□□ 1.88
PDLIM4-201ENST00000253754 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.82■■□□□ 1.88
PDLIM4-201ENST00000253754 TONSLQ96HA7 1378 aa26.82■■□□□ 1.88
PDLIM4-201ENST00000253754 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.79■■□□□ 1.88
PDLIM4-201ENST00000253754 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
PDLIM4-201ENST00000253754 AKNAQ7Z591 1439 aa26.78■■□□□ 1.88
PDLIM4-201ENST00000253754 TRIM52Q96A61 297 aa26.77■■□□□ 1.88
PDLIM4-201ENST00000253754 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
PDLIM4-201ENST00000253754 DAPK1P53355 1430 aa26.76■■□□□ 1.87
PDLIM4-201ENST00000253754 ABCC5O15440 1437 aa26.74■■□□□ 1.87
PDLIM4-201ENST00000253754 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
PDLIM4-201ENST00000253754 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.73■■□□□ 1.87
PDLIM4-201ENST00000253754 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.72■■□□□ 1.87
PDLIM4-201ENST00000253754 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.69■■□□□ 1.86
PDLIM4-201ENST00000253754 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
PDLIM4-201ENST00000253754 PREX2Q70Z35 1606 aa26.68■■□□□ 1.86
PDLIM4-201ENST00000253754 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.65■■□□□ 1.86
PDLIM4-201ENST00000253754 ROCK1Q13464 1354 aa26.65■■□□□ 1.86
PDLIM4-201ENST00000253754 FOXD1Q16676 465 aa26.65■■□□□ 1.86
PDLIM4-201ENST00000253754 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.64■■□□□ 1.86
PDLIM4-201ENST00000253754 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.63■■□□□ 1.85
PDLIM4-201ENST00000253754 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.63■■□□□ 1.85
PDLIM4-201ENST00000253754 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.62■■□□□ 1.85
PDLIM4-201ENST00000253754 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.62■■□□□ 1.85
PDLIM4-201ENST00000253754 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.6■■□□□ 1.85
PDLIM4-201ENST00000253754 ASXL2Q76L83 1435 aa26.59■■□□□ 1.85
PDLIM4-201ENST00000253754 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.57■■□□□ 1.84
PDLIM4-201ENST00000253754 PLCH2O75038 1416 aa26.56■■□□□ 1.84
PDLIM4-201ENST00000253754 MBD5Q9P267 1494 aa26.54■■□□□ 1.84
PDLIM4-201ENST00000253754 TSPY4P0CV99 314 aa26.54■■□□□ 1.84
PDLIM4-201ENST00000253754 TSPY10P0CW01 314 aa26.54■■□□□ 1.84
PDLIM4-201ENST00000253754 NCOA1Q15788 1441 aa26.54■■□□□ 1.84
PDLIM4-201ENST00000253754 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.52■■□□□ 1.84
PDLIM4-201ENST00000253754 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.52■■□□□ 1.84
PDLIM4-201ENST00000253754 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.51■■□□□ 1.83
PDLIM4-201ENST00000253754 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.5■■□□□ 1.83
PDLIM4-201ENST00000253754 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.5■■□□□ 1.83
PDLIM4-201ENST00000253754 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.5■■□□□ 1.83
PDLIM4-201ENST00000253754 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.5■■□□□ 1.83
PDLIM4-201ENST00000253754 ADGRL2O95490 1459 aa26.49■■□□□ 1.83
PDLIM4-201ENST00000253754 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.48■■□□□ 1.83
PDLIM4-201ENST00000253754 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.48■■□□□ 1.83
PDLIM4-201ENST00000253754 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.48■■□□□ 1.83
PDLIM4-201ENST00000253754 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
PDLIM4-201ENST00000253754 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.46■■□□□ 1.83
PDLIM4-201ENST00000253754 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.46■■□□□ 1.83
PDLIM4-201ENST00000253754 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.45■■□□□ 1.83
PDLIM4-201ENST00000253754 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.45■■□□□ 1.82
PDLIM4-201ENST00000253754 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.44■■□□□ 1.82
PDLIM4-201ENST00000253754 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.41■■□□□ 1.82
PDLIM4-201ENST00000253754 PZPP20742 1482 aa26.41■■□□□ 1.82
PDLIM4-201ENST00000253754 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.4■■□□□ 1.82
PDLIM4-201ENST00000253754 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
PDLIM4-201ENST00000253754 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
PDLIM4-201ENST00000253754 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.37■■□□□ 1.81
PDLIM4-201ENST00000253754 FANCAO15360 1455 aa26.37■■□□□ 1.81
PDLIM4-201ENST00000253754 ABCC1P33527 1531 aa26.37■■□□□ 1.81
PDLIM4-201ENST00000253754 KIF15Q9NS87 1388 aa26.36■■□□□ 1.81
PDLIM4-201ENST00000253754 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.34■■□□□ 1.81
PDLIM4-201ENST00000253754 ANP32CO43423 234 aa26.33■■□□□ 1.81
PDLIM4-201ENST00000253754 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.33■■□□□ 1.8
PDLIM4-201ENST00000253754 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.31■■□□□ 1.8
PDLIM4-201ENST00000253754 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.3■■□□□ 1.8
PDLIM4-201ENST00000253754 CD109Q6YHK3 1445 aa26.3■■□□□ 1.8
PDLIM4-201ENST00000253754 AFAP1Q8N556 730 aa26.3■■□□□ 1.8
PDLIM4-201ENST00000253754 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.29■■□□□ 1.8
PDLIM4-201ENST00000253754 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.28■■□□□ 1.8
PDLIM4-201ENST00000253754 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.27■■□□□ 1.8
PDLIM4-201ENST00000253754 PKD2Q13563 968 aa26.27■■□□□ 1.8
PDLIM4-201ENST00000253754 ADGRL1O94910 1474 aa26.25■■□□□ 1.79
PDLIM4-201ENST00000253754 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.24■■□□□ 1.79
PDLIM4-201ENST00000253754 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
PDLIM4-201ENST00000253754 CCER2I3L3R5 266 aa26.23■■□□□ 1.79
PDLIM4-201ENST00000253754 MYT1Q01538 1121 aa26.23■■□□□ 1.79
PDLIM4-201ENST00000253754 PLXNC1O60486 1568 aa26.21■■□□□ 1.79
PDLIM4-201ENST00000253754 NUP155O75694 1391 aa26.21■■□□□ 1.79
PDLIM4-201ENST00000253754 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
PDLIM4-201ENST00000253754 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.16■■□□□ 1.78
PDLIM4-201ENST00000253754 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.15■■□□□ 1.78
PDLIM4-201ENST00000253754 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.15■■□□□ 1.78
PDLIM4-201ENST00000253754 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.13■■□□□ 1.77
PDLIM4-201ENST00000253754 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.13■■□□□ 1.77
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