RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216420.11

CGRRF1-201, Transcript of cell growth regulator with ring finger domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CGRRF1, Length 2,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1-201ENST00000216420 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.67■■□□□ 1.54
CGRRF1-201ENST00000216420 PDE4AP27815 886 aa24.67■■□□□ 1.54
CGRRF1-201ENST00000216420 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
CGRRF1-201ENST00000216420 ARHGEF11O15085 1522 aa24.65■■□□□ 1.54
CGRRF1-201ENST00000216420 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
CGRRF1-201ENST00000216420 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.65■■□□□ 1.54
CGRRF1-201ENST00000216420 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.64■■□□□ 1.54
CGRRF1-201ENST00000216420 GSE1Q14687 1217 aa24.64■■□□□ 1.53
CGRRF1-201ENST00000216420 MIA2Q96PC5 1412 aa24.64■■□□□ 1.53
CGRRF1-201ENST00000216420 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.63■■□□□ 1.53
CGRRF1-201ENST00000216420 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.63■■□□□ 1.53
CGRRF1-201ENST00000216420 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.63■■□□□ 1.53
CGRRF1-201ENST00000216420 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
CGRRF1-201ENST00000216420 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.62■■□□□ 1.53
CGRRF1-201ENST00000216420 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.61■■□□□ 1.53
CGRRF1-201ENST00000216420 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
CGRRF1-201ENST00000216420 P3H3Q8IVL6 736 aa24.59■■□□□ 1.53
CGRRF1-201ENST00000216420 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
CGRRF1-201ENST00000216420 BRPF3Q9ULD4 1205 aa24.58■■□□□ 1.53
CGRRF1-201ENST00000216420 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.57■■□□□ 1.52
CGRRF1-201ENST00000216420 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CGRRF1-201ENST00000216420 KDM6BO15054 1643 aa24.56■■□□□ 1.52
CGRRF1-201ENST00000216420 CUL7Q14999 1698 aa24.56■■□□□ 1.52
CGRRF1-201ENST00000216420 GRIN2BQ13224 1484 aa24.55■■□□□ 1.52
CGRRF1-201ENST00000216420 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CGRRF1-201ENST00000216420 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CGRRF1-201ENST00000216420 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
CGRRF1-201ENST00000216420 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.54■■□□□ 1.52
CGRRF1-201ENST00000216420 SAMD9Q5K651 1589 aa24.53■■□□□ 1.52
CGRRF1-201ENST00000216420 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.53■■□□□ 1.52
CGRRF1-201ENST00000216420 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.52■■□□□ 1.52
CGRRF1-201ENST00000216420 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.52■■□□□ 1.52
CGRRF1-201ENST00000216420 NFKBIBQ15653 356 aa24.48■■□□□ 1.51
CGRRF1-201ENST00000216420 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.48■■□□□ 1.51
CGRRF1-201ENST00000216420 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.47■■□□□ 1.51
CGRRF1-201ENST00000216420 FAM43AQ8N2R8 423 aa24.47■■□□□ 1.51
CGRRF1-201ENST00000216420 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.47■■□□□ 1.51
CGRRF1-201ENST00000216420 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
CGRRF1-201ENST00000216420 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
CGRRF1-201ENST00000216420 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.44■■□□□ 1.5
CGRRF1-201ENST00000216420 MBD5Q9P267 1494 aa24.43■■□□□ 1.5
CGRRF1-201ENST00000216420 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
CGRRF1-201ENST00000216420 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CGRRF1-201ENST00000216420 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.41■■□□□ 1.5
CGRRF1-201ENST00000216420 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.41■■□□□ 1.5
CGRRF1-201ENST00000216420 PDE3BQ13370 1112 aa24.4■■□□□ 1.5
CGRRF1-201ENST00000216420 KDM5CP41229 1560 aa24.39■■□□□ 1.49
CGRRF1-201ENST00000216420 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.37■■□□□ 1.49
CGRRF1-201ENST00000216420 KIF14Q15058 1648 aa24.37■■□□□ 1.49
CGRRF1-201ENST00000216420 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
CGRRF1-201ENST00000216420 ROCK1Q13464 1354 aa24.36■■□□□ 1.49
CGRRF1-201ENST00000216420 TMC1Q8TDI8 760 aa24.36■■□□□ 1.49
CGRRF1-201ENST00000216420 KIF15Q9NS87 1388 aa24.34■■□□□ 1.49
CGRRF1-201ENST00000216420 USP47Q96K76 1375 aa24.32■■□□□ 1.48
CGRRF1-201ENST00000216420 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.31■■□□□ 1.48
CGRRF1-201ENST00000216420 E9PCH4 1651 aa24.3■■□□□ 1.48
CGRRF1-201ENST00000216420 INSRP06213 1382 aa24.3■■□□□ 1.48
CGRRF1-201ENST00000216420 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CGRRF1-201ENST00000216420 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.29■■□□□ 1.48
CGRRF1-201ENST00000216420 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.29■■□□□ 1.48
CGRRF1-201ENST00000216420 RALBP1Q15311 655 aa24.28■■□□□ 1.48
CGRRF1-201ENST00000216420 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.26■■□□□ 1.47
CGRRF1-201ENST00000216420 FOXD1Q16676 465 aa24.26■■□□□ 1.47
CGRRF1-201ENST00000216420 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
CGRRF1-201ENST00000216420 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
CGRRF1-201ENST00000216420 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.22■■□□□ 1.47
CGRRF1-201ENST00000216420 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.21■■□□□ 1.47
CGRRF1-201ENST00000216420 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.2■■□□□ 1.47
CGRRF1-201ENST00000216420 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.19■■□□□ 1.46
CGRRF1-201ENST00000216420 PKNOX2Q96KN3 472 aa24.19■■□□□ 1.46
CGRRF1-201ENST00000216420 DAPK1P53355 1430 aa24.19■■□□□ 1.46
CGRRF1-201ENST00000216420 PZPP20742 1482 aa24.17■■□□□ 1.46
CGRRF1-201ENST00000216420 FAM161AQ3B820 660 aa24.17■■□□□ 1.46
CGRRF1-201ENST00000216420 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CGRRF1-201ENST00000216420 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.16■■□□□ 1.46
CGRRF1-201ENST00000216420 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.16■■□□□ 1.46
CGRRF1-201ENST00000216420 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
CGRRF1-201ENST00000216420 NESP48681 1621 aa24.15■■□□□ 1.46
CGRRF1-201ENST00000216420 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa24.15■■□□□ 1.46
CGRRF1-201ENST00000216420 CRBNQ96SW2 442 aa24.14■■□□□ 1.45
CGRRF1-201ENST00000216420 SLC4A3P48751 1232 aa24.13■■□□□ 1.45
CGRRF1-201ENST00000216420 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
CGRRF1-201ENST00000216420 C8orf34Q49A92 452 aa24.13■■□□□ 1.45
CGRRF1-201ENST00000216420 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
CGRRF1-201ENST00000216420 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.12■■□□□ 1.45
CGRRF1-201ENST00000216420 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CGRRF1-201ENST00000216420 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CGRRF1-201ENST00000216420 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.11■■□□□ 1.45
CGRRF1-201ENST00000216420 NLRP13Q86W25 1043 aa24.11■■□□□ 1.45
CGRRF1-201ENST00000216420 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
CGRRF1-201ENST00000216420 ABCC5O15440 1437 aa24.11■■□□□ 1.45
CGRRF1-201ENST00000216420 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.1■■□□□ 1.45
CGRRF1-201ENST00000216420 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.1■■□□□ 1.45
CGRRF1-201ENST00000216420 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.1■■□□□ 1.45
CGRRF1-201ENST00000216420 TOPBP1Q92547 1522 aa24.09■■□□□ 1.45
CGRRF1-201ENST00000216420 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.08■■□□□ 1.45
CGRRF1-201ENST00000216420 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CGRRF1-201ENST00000216420 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CGRRF1-201ENST00000216420 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.06■■□□□ 1.44
CGRRF1-201ENST00000216420 SKAP1Q86WV1 359 aa24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms