RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000173357.7

Nelfe-204, Transcript of Negative elongation factor E, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nelfe, Length 1,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa38.67■■■■□ 3.78
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 Kidins220E9Q9B7 1793 aa38.04■■■■□ 3.68
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 Atp10aO54827 1508 aa37.71■■■■□ 3.63
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 Alpk3Q924C5 1678 aa37.65■■■■□ 3.62
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 Yeats2Q3TUF7 1407 aa37.58■■■■□ 3.61
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Prdm16A2A935 1275 aa37.58■■■■□ 3.61
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 Neurl4Q5NCX5 1563 aa37.58■■■■□ 3.61
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Mast1Q9R1L5 1570 aa37.58■■■■□ 3.61
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 SphkapQ6NSW3 1687 aa37.54■■■■□ 3.6
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Map3k5O35099 1380 aa37.52■■■■□ 3.6
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Chic2Q9D9G3 165 aa37.52■■■■□ 3.6
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP37.5■■■■□ 3.59
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 Nos1Q9Z0J4 1429 aa37.48■■■■□ 3.59
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa37.42■■■■□ 3.58
Nelfe-204ENSMUST00000173357 UacaQ8CGB3 1411 aa37.4■■■■□ 3.58
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa37.4■■■■□ 3.58
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa37.37■■■■□ 3.57
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 Gli2Q0VGT2 1544 aa37.26■■■■□ 3.56
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 Rsph4aQ8BYM7 716 aa37.1■■■■□ 3.53
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa37.1■■■■□ 3.53
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP37.07■■■■□ 3.53
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