RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000124246.3

Gt(ROSA)26Sor-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Gt(ROSA)26Sor, Length 1,181 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Hecw2Q6I6G8 1578 aa34,64■■■■□ 3,14
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Abca9Q8K449 1623 aa34,61■■■■□ 3,13
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Synj2Q9D2G5 1434 aa34,59■■■■□ 3,13
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fam163aQ8CAA5 168 aa34,58■■■■□ 3,13
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP34,57■■■■□ 3,13
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Qser1A2BIE1 1698 aa34,57■■■■□ 3,12
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP34,57■■■■□ 3,12
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Erich3F6QRE9 1637 aa34,55■■■■□ 3,12
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Kiaa0556Q8C753 1610 aa34,55■■■■□ 3,12
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Setd5Q5XJV7 1441 aa34,55■■■■□ 3,12
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ncoa3O09000 1398 aa34,53■■■■□ 3,12
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP34,52■■■■□ 3,12
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa34,47■■■■□ 3,11
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP34,45■■■■□ 3,11
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa34,44■■■■□ 3,1
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Mug1P28665 1476 aa34,44■■■■□ 3,1
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cul9Q80TT8 1865 aa34,44■■■■□ 3,1
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Pcf11G3X9Z4 1553 aa34,42■■■■□ 3,1
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa34,41■■■■□ 3,1
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Adamtsl3G3UXC7 1706 aa34,39■■■■□ 3,1
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa34,38■■■■□ 3,09
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa34,37■■■■□ 3,09
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Eea1Q8BL66 1411 aa34,33■■■■□ 3,09
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Neurl4Q5NCX5 1563 aa34,28■■■■□ 3,08
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 PtprmP28828 1452 aa34,27■■■■□ 3,08
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 OvosQ3UU35 1456 aa34,27■■■■□ 3,08
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Arhgap5P97393 1501 aa34,27■■■■□ 3,08
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Lemd3Q9WU40 921 aa34,27■■■■□ 3,08
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Atp10aO54827 1508 aa34,24■■■■□ 3,07
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Yeats2Q3TUF7 1407 aa34,22■■■■□ 3,07
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Camsap2Q8C1B1 1461 aa34,22■■■■□ 3,07
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Kidins220E9Q9B7 1793 aa34,21■■■■□ 3,07
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 NpatQ8BMA5 1420 aa34,21■■■■□ 3,07
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ptch1Q61115 1434 aa34,19■■■■□ 3,06
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 MyclP10166 368 aa34,17■■■■□ 3,06
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Dip2cE9PWR4 1557 aa34,14■■■■□ 3,06
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP34,14■■■■□ 3,06
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Kdm5cP41230 1554 aa34,13■■■■□ 3,05
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 CntlnA2AM05 1397 aa34,12■■■■□ 3,05
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP34,12■■■■□ 3,05
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 RereQ80TZ9 1558 aa34,11■■■■□ 3,05
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP34,09■■■■□ 3,05
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP34,08■■■■□ 3,05
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Lmod2Q3UHZ5 550 aa34,05■■■■□ 3,04
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cfap65Q3V0B4 1847 aa34,04■■■■□ 3,04
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa34,03■■■■□ 3,04
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 NexmifQ5DTT1 1515 aa34,02■■■■□ 3,04
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Trappc8E9PWG2 1437 aa34,01■■■■□ 3,03
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP33,99■■■■□ 3,03
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 SphkapQ6NSW3 1687 aa33,96■■■■□ 3,03
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Abcc3B2RX12 1523 aa33,96■■■■□ 3,03
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa33,96■■■■□ 3,03
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Peg3Q3URU2 1571 aa33,95■■■■□ 3,03
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cfap74Q3UY96 1578 aa33,93■■■■□ 3,02
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Tdrd9Q14BI7 1383 aa33,92■■■■□ 3,02
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Tiam1Q60610 1591 aa33,92■■■■□ 3,02
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Adcy10Q8C0T9 1614 aa33,83■■■■□ 3,01
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Talpid3E9PV87 1520 aa33,82■■■■□ 3
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fbxo41Q6NS60 873 aa33,81■■■■□ 3
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Hecw1Q8K4P8 1604 aa33,8■■■■□ 3
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Caskin1Q6P9K8 1431 aa33,79■■■■□ 3
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa33,79■■■■□ 3
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa33,79■■■■□ 3
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Abca6Q8K441 1624 aa33,79■■■■□ 3
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP33,78■■■■□ 3
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Naip1Q9QWK5 1403 aa33,78■■■■□ 3
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Myom2Q14BI5 1463 aa33,69■■■□□ 2,98
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Trpm1Q2TV84 1622 aa33,69■■■□□ 2,98
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Afap1Q80YS6 731 aa33,68■■■□□ 2,98
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa33,67■■■□□ 2,98
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa33,66■■■□□ 2,98
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa33,64■■■□□ 2,98
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Scn4aQ9ER60 1841 aa33,64■■■□□ 2,98
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ccnb3Q810T2 1396 aa33,6■■■□□ 2,97
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa33,59■■■□□ 2,97
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Map3k5O35099 1380 aa33,58■■■□□ 2,97
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Dip2bQ3UH60 1574 aa33,57■■■□□ 2,96
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Topaz1E5FYH1 1653 aa33,57■■■□□ 2,96
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP33,55■■■□□ 2,96
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fhod3Q76LL6 1578 aa33,55■■■□□ 2,96
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Dip2aQ8BWT5 1523 aa33,54■■■□□ 2,96
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Nos1Q9Z0J4 1429 aa33,52■■■□□ 2,96
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gli2Q0VGT2 1544 aa33,5■■■□□ 2,95
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Trpm2Q91YD4 1506 aa33,48■■■□□ 2,95
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP33,48■■■□□ 2,95
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Naip6Q9JIB6 1403 aa33,46■■■□□ 2,95
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 RictorQ6QI06 1708 aa33,42■■■□□ 2,94
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP33,39■■■□□ 2,94
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Pip4k2bQ80XI4 416 aa33,37■■■□□ 2,93
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP33,34■■■□□ 2,93
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Knl1Q66JQ7 1612 aa33,34■■■□□ 2,93
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Bcl9Q9D219 1425 aa33,34■■■□□ 2,93
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fmn2Q9JL04 1578 aa33,32■■■□□ 2,92
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP33,31■■■□□ 2,92
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Prdm16A2A935 1275 aa33,28■■■□□ 2,92
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rsph4aQ8BYM7 716 aa33,26■■■□□ 2,91
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ltbp4Q8K4G1 1666 aa33,26■■■□□ 2,91
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Kif3bQ61771 747 aa33,25■■■□□ 2,91
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Mast1Q9R1L5 1570 aa33,25■■■□□ 2,91
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Uggt2E9Q4X2 1504 aa33,23■■■□□ 2,91
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 38,5 ms