RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029178.6

Ctnnbl1-201, Transcript of Beta-catenin-like protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctnnbl1, Length 2,442 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa16.47■□□□□ 0.23
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Fgd6Q69ZL1 1399 aa16.46■□□□□ 0.23
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Neo1P97798 1493 aa16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Gcc2Q8CHG3 1679 aa16.43■□□□□ 0.22
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa16.43■□□□□ 0.22
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 NexmifQ5DTT1 1515 aa16.43■□□□□ 0.22
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Arhgef11Q68FM7 1552 aa16.43■□□□□ 0.22
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Ccdc27Q3V036 639 aa16.43■□□□□ 0.22
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Pak3Q61036 559 aa16.42■□□□□ 0.22
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Ncoa3O09000 1398 aa16.41■□□□□ 0.22
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Mug1P28665 1476 aa16.4■□□□□ 0.22
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa16.4■□□□□ 0.22
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Ccnb3Q810T2 1396 aa16.39■□□□□ 0.21
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Camsap2Q8C1B1 1461 aa16.39■□□□□ 0.21
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Liat1Q810M6 228 aa16.39■□□□□ 0.21
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Ncoa2Q61026 1462 aa16.38■□□□□ 0.21
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 AknaQ80VW7 1404 aa16.38■□□□□ 0.21
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa16.38■□□□□ 0.21
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Ccer2J3QPU5 274 aa16.38■□□□□ 0.21
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Mroh2aD3Z750 1679 aa16.38■□□□□ 0.21
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa16.37■□□□□ 0.21
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa16.36■□□□□ 0.21
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Fhad1A6PWD2 1420 aa16.34■□□□□ 0.21
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Jph4Q80WT0 628 aa16.34■□□□□ 0.21
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Egfem1Q8C088 590 aa16.34■□□□□ 0.21
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Chd1P40201 1711 aa16.33■□□□□ 0.2
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Ccdc9Q8VC31 543 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 A2mQ6GQT1 1474 aa16.33■□□□□ 0.2
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Magi1Q6RHR9 1471 aa16.32■□□□□ 0.2
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Abcc1O35379 1528 aa16.32■□□□□ 0.2
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Mia2Q91ZV0 1396 aa16.3■□□□□ 0.2
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Naip2Q9QUK4 1447 aa16.3■□□□□ 0.2
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Gm14025A2AP89 1413 aa16.3■□□□□ 0.2
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa16.29■□□□□ 0.2
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Gtf3c3Q3TMP1 882 aa16.28■□□□□ 0.2
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Vps8Q0P5W1 1427 aa16.27■□□□□ 0.2
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Prex2Q3LAC4 1598 aa16.27■□□□□ 0.19
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Mrs2Q5NCE8 434 aa16.26■□□□□ 0.19
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Fam163aQ8CAA5 168 aa16.26■□□□□ 0.19
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Ipo9Q91YE6 1041 aa16.25■□□□□ 0.19
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa16.25■□□□□ 0.19
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 P3h3Q8CG70 732 aa16.25■□□□□ 0.19
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Adcy10Q8C0T9 1614 aa16.25■□□□□ 0.19
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Cul7Q8VE73 1689 aa16.24■□□□□ 0.19
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Naip5Q9R016 1403 aa16.24■□□□□ 0.19
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Fancd2Q80V62 1450 aa16.23■□□□□ 0.19
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa16.22■□□□□ 0.19
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Irx3P81067 507 aa16.21■□□□□ 0.19
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 NhsB1AV60 1647 aa16.2■□□□□ 0.18
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 NrdcQ8BHG1 1161 aa16.19■□□□□ 0.18
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa16.18■□□□□ 0.18
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Slc4a3P16283 1227 aa16.18■□□□□ 0.18
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Pprc1Q6NZN1 1644 aa16.18■□□□□ 0.18
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa16.18■□□□□ 0.18
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Abcc5Q9R1X5 1436 aa16.17■□□□□ 0.18
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Gm13695A2AK44 830 aa16.16■□□□□ 0.18
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Fgd1P52734 960 aa16.16■□□□□ 0.18
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa16.15■□□□□ 0.18
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Rfx7F8VPJ6 1459 aa16.14■□□□□ 0.17
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Plekhh2Q8C115 1491 aa16.13■□□□□ 0.17
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Plcd4Q8K3R3 807 aa16.13■□□□□ 0.17
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa16.13■□□□□ 0.17
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Wdr7Q920I9 1489 aa16.13■□□□□ 0.17
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Caskin1Q6P9K8 1431 aa16.12■□□□□ 0.17
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Exoc6Q8R313 802 aa16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Ube2uB1AUC4 352 aa16.1■□□□□ 0.17
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Chic2Q9D9G3 165 aa16.1■□□□□ 0.17
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Ncoa1P70365 1447 aa16.1■□□□□ 0.17
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 PtprtQ99M80 1454 aa16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Fhod3Q76LL6 1578 aa16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Rnf17Q99MV7 1640 aa16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 SphkapQ6NSW3 1687 aa16.08■□□□□ 0.17
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Abca8bQ8K440 1620 aa16.08■□□□□ 0.17
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Cabp1Q9JLK7 227 aa16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Mtus2Q3UHD3 1353 aa16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Il16O54824 1322 aa16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Tdrd9Q14BI7 1383 aa16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Iqcf3Q9D498 203 aa16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 Atp10dQ8K2X1 1416 aa16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11.7 ms