RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001711.5

Hoxc6-201, Transcript of Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxc6, Length 1,581 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa28.67■■■□□ 2.18
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Synj2Q9D2G5 1434 aa28.26■■■□□ 2.11
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa28.25■■■□□ 2.11
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Hecw2Q6I6G8 1578 aa28.24■■■□□ 2.11
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Kdm5cP41230 1554 aa28.23■■■□□ 2.11
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cabp1Q9JLK7 227 aa28.2■■■□□ 2.11
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mast1Q9R1L5 1570 aa28.17■■■□□ 2.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Atp10aO54827 1508 aa28.16■■■□□ 2.1
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa28.09■■■□□ 2.09
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa28.05■■■□□ 2.08
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rfx7F8VPJ6 1459 aa28.05■■■□□ 2.08
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Plppr3Q7TPB0 716 aa28.04■■■□□ 2.08
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mia2Q91ZV0 1396 aa28.04■■■□□ 2.08
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Yeats2Q3TUF7 1407 aa28.03■■■□□ 2.08
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 NclP09405 707 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Nos1Q9Z0J4 1429 aa28.02■■■□□ 2.08
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Fhod3Q76LL6 1578 aa27.96■■■□□ 2.07
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ssh2Q5SW75 1423 aa27.88■■■□□ 2.05
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Kif3bQ61771 747 aa27.82■■■□□ 2.04
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Adamtsl3G3UXC7 1706 aa27.79■■■□□ 2.04
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Camsap2Q8C1B1 1461 aa27.75■■■□□ 2.03
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