RNA–Protein interactions for RNA: YOR118W

RTC5, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene RTC5, Length 1,704 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RTC5	YOR118W	PEX15	Q08215	383 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	STT4	P37297	1900 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	CLB4	P24871	460 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	DCC1	P25559	380 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	REC104	P33323	182 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	PTH2	P34222	208 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	SLM4	P38247	162 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	SAF1	P38352	637 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	ARN1	P38731	627 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	DSS1	P39112	969 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	BST1	P43571	1029 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	PTR3	P43606	678 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	VPS25	P47142	202 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	COG1	P53079	417 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	BOL2	P53082	120 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	ASI2	P53895	289 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	VAC7	P53950	1165 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	TRM12	Q04235	462 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	BLS1	Q06071	122 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	ATG26	Q06321	1198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	ECM30	Q06673	1274 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	LDB18	Q07887	179 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	RSB1	Q08417	382 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	MCH5	Q08777	521 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	HUA2	Q12134	243 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	ICT1	Q12385	394 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	CCH1	P50077	2039 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	HIP1	P06775	603 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	NMT1	P14743	455 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	PHO11	P35842	467 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	YKR073C	P36153	106 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	PHO12	P38693	467 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	ARP1	P38696	384 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	NUP60	P39705	539 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	HAT2	P39984	401 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	PAN6	P40459	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	MRX6	P48564	524 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	IBD2	P53892	351 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	SLM2	P53955	656 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	SPP2	Q02521	185 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	DYN3	Q04949	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	YOL019W	Q08157	551 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	YOL159C	Q08300	171 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	NDD1	Q08887	554 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
RTC5	YOR118W	RUP1	Q12242	671 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	YLR122C	Q12312	125 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	NKP1	Q12493	238 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	SUC2	P00724	532 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	MRPL8	P22353	238 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	SGF29	P25554	259 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	TFC1	P32367	649 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	STE14	P32584	239 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	SKT5	P34226	696 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	TOM20	P35180	183 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	KAE1	P36132	386 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	KTR4	P38131	464 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	APM3	P38153	483 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	LDB7	P38210	180 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	YHL041W	P38730	149 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	EFM1	P38732	585 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	SFB3	P38810	929 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	TIM17	P39515	158 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	GIP4	P39732	760 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	YKU80	Q04437	629 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	RCO1	Q04779	684 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	RSC58	Q07979	502 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	GPB1	Q08886	897 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	FAB1	P34756	2278 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	ATP6	P00854	259 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTC5	YOR118W	ARG81	P05085	880 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTC5	YOR118W	CCA1	P21269	546 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTC5	YOR118W	CSE1	P33307	960 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTC5	YOR118W	TDP1	P38319	544 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTC5	YOR118W	STB5	P38699	743 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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