RNA–Protein interactions for RNA: YLR297W

YLR297W, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YLR297W, Length 390 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR297W	YLR297W	MAD3	P47074	515 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	RPC17	P47076	161 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	TIM8	P57744	87 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	NUP53	Q03790	475 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	OPY2	Q06810	360 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	CRD1	Q07560	283 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	AIM6	Q07716	390 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	YPL191C	Q08930	360 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	PLP2	Q12017	286 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	RAD3	P06839	778 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	YML002W	P0CF17	737 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	YME2	P32843	850 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	BLI1	P35727	113 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	DUG2	P38149	878 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	CST26	P38226	397 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	VHC1	P38329	1120 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	RFC3	P38629	340 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	FIS1	P40515	155 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	YGR079W	P53249	370 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	ESBP6	P53918	673 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	YMR018W	Q04364	514 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	CSM3	Q04659	317 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	UBX3	Q12229	455 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	MED1	Q12321	566 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	RRD2	Q12461	358 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	SEC39	Q12745	709 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	MPD2	Q99316	277 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	PDE1	P22434	369 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	RRT12	P25381	491 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	YSC83	P32792	385 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	MRX3	P38172	270 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	ARN1	P38731	627 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	PES4	P39684	611 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	PHO86	P46956	311 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	UBX6	P47049	396 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	SND1	Q04007	877 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	YMR027W	Q04371	470 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	YDR109C	Q04585	715 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	PDR8	Q06149	701 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	JIP3	O13555	125 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	YCR006C	P25350	157 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	SPS22	P25380	463 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	LAC1	P28496	418 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	GYP6	P32806	458 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	RGT1	P32862	1170 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	BUD2	P33314	1104 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	YIL152W	P40455	235 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	CHS6	P40955	746 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	YFL040W	P43562	540 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	CPR7	P47103	393 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	USE1	P53146	245 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	BIO4	P53630	237 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	BET4	Q00618	327 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	DON1	Q05610	365 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.1	□□□□□ -1.91	not detected
YLR297W	YLR297W	NDD1	Q08887	554 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	TAF10	Q12030	206 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	YLR112W	Q12130	139 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	REC107	P21651	314 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	YME1	P32795	747 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	NIC96	P34077	839 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	CSG2	P35206	410 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YLR297W	YLR297W	HSM3	P38348	480 aa		3.09	□□□□□ -1.91

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 26.3 ms