RNA–Protein interactions for RNA: YJL057C

IKS1, Transcript of Protein kinase of unknown cellular role, yeast

Gene IKS1, Length 2,004 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IKS1	YJL057C	COS12	P53053	380 aa		4.38	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	SLT2	Q00772	484 aa		4.38	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	INA17	Q02888	182 aa		4.38	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	CAB5	Q03941	241 aa		4.38	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	YMR074C	Q04773	145 aa		4.38	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	CTS2	Q06350	511 aa		4.38	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	CRT10	Q08226	957 aa		4.38	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	NRT1	Q08485	598 aa		4.38	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	PUS9	Q12069	462 aa		4.38	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	SLP1	Q12232	587 aa		4.38	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	MRP13	P12686	339 aa		4.38	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	YIM1	P28625	365 aa		4.38	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	FMC1	P40491	155 aa		4.38	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	AIM22	P47051	409 aa		4.38	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	GPN3	Q06543	272 aa		4.38	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	GEP3	Q08622	556 aa		4.38	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	RDR1	Q08904	546 aa		4.38	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	VIK1	Q12045	647 aa		4.38	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	DFG16	Q99234	619 aa		4.38	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	MSF1	P08425	469 aa		4.37	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	RSM22	P36056	628 aa		4.37	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	MAL32	P38158	584 aa		4.37	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	ERG7	P38604	731 aa		4.37	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	VHS2	P40463	436 aa		4.37	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	YHC3	P47040	408 aa		4.37	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	COS5	P47187	383 aa		4.37	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	BUD9	P53226	547 aa		4.37	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	MAL12	P53341	584 aa		4.37	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	STD1	Q02794	444 aa		4.37	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	EKI1	Q03764	534 aa		4.37	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	IVY1	Q04934	453 aa		4.37	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	PDR8	Q06149	701 aa		4.37	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	COS7	Q07788	383 aa		4.37	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	TIP41	Q12199	356 aa		4.37	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	ATG31	Q12421	196 aa		4.37	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	YOS9	Q99220	542 aa		4.37	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	MET3	P08536	511 aa		4.36	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	SEC12	P11655	471 aa		4.36	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	CDC23	P16522	626 aa		4.36	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	CYM1	P32898	989 aa		4.36	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	APT2	P36973	181 aa		4.36	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	IML3	P38265	245 aa		4.36	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	SAK1	P38990	1142 aa		4.36	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	PFA3	P42836	336 aa		4.36	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	STB2	P46679	850 aa		4.36	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	MIG2	P53035	382 aa		4.36	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	IPI3	P53877	555 aa		4.36	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	YMR130W	Q04223	302 aa		4.36	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	NDL1	Q06568	189 aa		4.36	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	ELG1	Q12050	791 aa		4.36	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	SPE2	P21182	396 aa		4.36	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	DAL2	P25335	343 aa		4.36	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	CWP1	P28319	239 aa		4.36	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	NNK1	P36003	928 aa		4.36	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	AGP2	P38090	596 aa		4.36	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	SKN7	P38889	622 aa		4.36	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	IRC8	P47046	822 aa		4.36	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.36	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	FIN1	Q03898	291 aa		4.36	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	ECM30	Q06673	1274 aa		4.36	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		4.35	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		4.35	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	SEC15	P22224	910 aa		4.35	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	YUR1	P26725	428 aa		4.35	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	GIP2	P40036	548 aa		4.35	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	PCL6	P40038	420 aa		4.35	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	TOS3	P43637	560 aa		4.35	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	LOH1	P47055	219 aa		4.35	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	OCA2	P53949	197 aa		4.35	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.35	□□□□□ -1.71	not detected
IKS1	YJL057C	RSM28	Q03430	361 aa		4.35	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	HED1	Q03937	162 aa		4.35	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	RSM24	Q03976	319 aa		4.35	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
IKS1	YJL057C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71

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