RNA–Protein interactions for RNA: YHR213W

YHR213W, Transcript of Pseudogenic fragment with similarity to flocculins, yeast

Gene YHR213W, Length 597 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YHR213W	YHR213W	HIF1	Q12373	385 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YHR213W	YHR213W	CYB2	P00175	591 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YHR213W	YHR213W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YHR213W	YHR213W	PAH1	P32567	862 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YHR213W	YHR213W	TRS65	P32893	560 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YHR213W	YHR213W	PDR3	P33200	976 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YHR213W	YHR213W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YHR213W	YHR213W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YHR213W	YHR213W	YBL029W	P38201	376 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YHR213W	YHR213W	RTS1	P38903	757 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YHR213W	YHR213W	SHC1	P39000	512 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YHR213W	YHR213W	BUR6	P40096	142 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YHR213W	YHR213W	SGF73	P53165	657 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YHR213W	YHR213W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YHR213W	YHR213W	UBX2	Q04228	584 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YHR213W	YHR213W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YHR213W	YHR213W	FIG2	P25653	1609 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YHR213W	YHR213W	PMD1	P32634	1753 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YHR213W	YHR213W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
YHR213W	YHR213W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
YHR213W	YHR213W	BAR1	P12630	587 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YHR213W	YHR213W	RPB8	P20436	146 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YHR213W	YHR213W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
YHR213W	YHR213W	ADH7	P25377	361 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YHR213W	YHR213W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
YHR213W	YHR213W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
YHR213W	YHR213W	YOX1	P34161	385 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YHR213W	YHR213W	MIA40	P36046	403 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YHR213W	YHR213W	RIM2	P38127	377 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YHR213W	YHR213W	MAL33	P38157	468 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YHR213W	YHR213W	YIR014W	P40570	242 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YHR213W	YHR213W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
YHR213W	YHR213W	COG4	Q06096	861 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YHR213W	YHR213W	YOL159C	Q08300	171 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YHR213W	YHR213W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
YHR213W	YHR213W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	KRE2	P27809	442 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	GAC1	P28006	793 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	RPN12	P32496	274 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	DBP8	P38719	431 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	TMA108	P40462	946 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	YDL218W	Q07629	317 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	YDR056C	Q12025	205 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	HUA2	Q12134	243 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	NCB2	Q92317	146 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	POM152	P39685	1337 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	SEM1	O94742	89 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	PGS1	P25578	521 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	BLI1	P35727	113 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	ELO1	P39540	310 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	RTS2	P40962	232 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	SGM1	P47166	707 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	SMA1	Q02651	245 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	YML037C	Q03703	340 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	EKI1	Q03764	534 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	YKU80	Q04437	629 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	ATG26	Q06321	1198 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	DAP1	Q12091	152 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	ARG81	P05085	880 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	AAC3	P18238	307 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	SAN1	P22470	610 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	YIH1	P25637	258 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	CPR3	P25719	182 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	TSC10	P38342	320 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	SPL2	P38839	148 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	AFG3	P39925	761 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	HXT9	P40885	567 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	HKR1	P41809	1802 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	YGR127W	P53275	312 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	IRC4	Q03036	179 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	YLR278C	Q05854	1341 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	PPT2	Q12036	173 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	BSC1	Q12140	328 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	FLO11	P08640	1367 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	PDR18	P53756	1333 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	KAR3	P17119	729 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	YCK1	P23291	538 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	GID7	P25569	745 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	MIC60	P36112	540 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
YHR213W	YHR213W	ANS1	P38832	159 aa		3.05	□□□□□ -1.92

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.5 ms