RNA–Protein interactions for RNA: YBL008W-A

YBL008W-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YBL008W-A, Length 240 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL008W-AYBL008W-A VID30P53076 958 aa1.43□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A RRT6P53117 311 aaPredicted RBP1.43□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A GPI1P53306 609 aa1.43□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A FIN1Q03898 291 aa1.43□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A RPS10AQ08745 105 aaPredicted RBP1.43□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A TRM8Q12009 286 aa1.43□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A YCL021W-AQ96VH3 125 aa1.43□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A HEM2P05373 342 aa1.42□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A RNA14P25298 677 aaKnown RBP1.42□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A SDH3P33421 198 aa1.42□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A SHP1P34223 423 aa1.42□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A NOP4P37838 685 aaKnown RBP1.42□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A YBL029WP38201 376 aa1.42□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A VPS52P39904 641 aa1.42□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A HAT2P39984 401 aa1.42□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A IES5P40060 125 aa1.42□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A REE1P40893 198 aa1.42□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A GWT1P47026 490 aa1.42□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A BNA1P47096 177 aa1.42□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A SLD5Q03406 294 aa1.42□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A ATG16Q03818 150 aa1.42□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A YMR087WQ04299 284 aa1.42□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A SSP2Q08646 371 aa1.42□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A ESA1Q08649 445 aa1.42□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A YPL272CQ08984 517 aa1.42□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A ERV2Q12284 196 aa1.42□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A SUC2P00724 532 aa1.41□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A HIP1P06775 603 aa1.41□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A ARD1P07347 238 aaPredicted RBP1.41□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A RPL19AP0CX82 189 aaKnown RBP1.41□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A RPL19BP0CX83 189 aaPredicted RBP1.41□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A APA1P16550 321 aaKnown RBP1.41□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A HEM15P16622 393 aa1.41□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A ISY1P21374 235 aaPredicted RBP1.41□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A SPS22P25380 463 aa1.41□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A DEG1P31115 442 aaKnown RBP1.41□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A FRE1P32791 686 aa1.41□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A YBR144CP34215 104 aa1.41□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A CBP4P37267 147 aa1.41□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A SRO77P38163 1010 aa1.41□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A YFL067WP43537 175 aa1.41□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A DSD1P53095 428 aa1.41□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A YGR066CP53242 292 aa1.41□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A SNO4Q04902 237 aa1.41□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A RBS1Q05672 457 aaKnown RBP1.41□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A LUC7Q07508 261 aaPredicted RBP1.41□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A HSP33Q08914 237 aaKnown RBP1.41□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A HSP32Q08992 237 aa1.41□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A CTF3Q12748 733 aa1.41□□□□□ -2.18
YBL008W-AYBL008W-A PEP4P07267 405 aaKnown RBP1.4□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A NAT1P12945 854 aaKnown RBP1.4□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A CPR1P14832 162 aaKnown RBP1.4□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A ART10P18634 518 aaKnown RBP1.4□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A FUN19P28003 413 aaPredicted RBP1.4□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A SYN8P31377 255 aa1.4□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A GYP6P32806 458 aa1.4□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A MRP4P32902 394 aa1.4□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A MSN2P33748 704 aa1.4□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A SEF1P34228 1148 aa1.4□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A RSM22P36056 628 aa1.4□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A AUR1P36107 401 aaPredicted RBP1.4□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A DUG2P38149 878 aa1.4□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A MAL33P38157 468 aa1.4□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A BNA4P38169 460 aa1.4□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A MUM2P38236 366 aa1.4□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A AXL2P38928 823 aa1.4□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A FLC2P39719 783 aa1.4□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A ALG5P40350 334 aa1.4□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A CBK1P53894 756 aa1.4□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A ARK1P53974 638 aa1.4□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A TOF2Q02208 771 aa1.4□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A MRP51Q02950 344 aa1.4□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A MSC1Q03104 513 aa1.4□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A HER2Q03557 464 aa1.4□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A YML037CQ03703 340 aa1.4□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A IOC4Q04213 475 aa1.4□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A YMR018WQ04364 514 aa1.4□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A YMR027WQ04371 470 aa1.4□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A SOV1Q04748 898 aa1.4□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A PBA1Q05778 276 aa1.4□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A THP1Q08231 455 aa1.4□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP1.4□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A NCE102Q12207 173 aaRIP-Chip data1.4□□□□□ -2.19not detected
YBL008W-AYBL008W-A YER078W-AQ3E7A2 54 aa1.4□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP1.4□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A RAV1P47104 1357 aa1.39□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A SEM1O94742 89 aa1.39□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A GLK1P17709 500 aaKnown RBP1.39□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A PRP2P20095 876 aaPredicted RBP1.39□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A CHS3P29465 1165 aa1.39□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A REC114P32841 428 aa1.39□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A NDT80P38830 627 aa1.39□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A ERP2P39704 215 aa1.39□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A AFG3P39925 761 aa1.39□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A FAU1P40099 211 aa1.39□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A TMA108P40462 946 aa1.39□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A YSA1Q01976 231 aa1.39□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A ELP3Q02908 557 aaKnown RBP1.39□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A YML131WQ03102 365 aa1.39□□□□□ -2.19
YBL008W-AYBL008W-A RLI1Q03195 608 aaKnown RBP1.39□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 46.5 ms