RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621420.5

SRP19-208, Transcript of signal recognition particle 19, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SRP19, Length 1,270 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP19-208ENST00000621420 SENP2Q9HC62 589 aa14.74□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa14.74□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 GPCPD1Q9NPB8 672 aa14.74□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 TMEM39AQ9NV64 488 aa14.74□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 LRRC37A2A6NM11 1700 aa14.74□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 GBF1Q92538 1859 aa14.74□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 TMEM232C9JQI7 657 aa14.73□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 HOXC6P09630 235 aa14.73□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 PDHBP11177 359 aa14.73□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 NHLH1Q02575 133 aa14.73□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 COG2Q14746 738 aa14.73□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 Q6ZUG5 572 aa14.73□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 NUP133Q8WUM0 1156 aa14.73□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 PDRG1Q9NUG6 133 aa14.73□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 FBXO28Q9NVF7 368 aa14.73□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 FEM1BQ9UK73 627 aa14.73□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 TLL1O43897 1013 aa14.72□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 LIFRP42702 1097 aa14.72□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 RBM25P49756 843 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 STAT2P52630 851 aa14.72□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 ASPRV1Q53RT3 343 aa14.72□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 TMEM240Q5SV17 173 aa14.72□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 RASIP1Q5U651 963 aa14.72□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 FAM160B2Q86V87 743 aa14.72□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 ZNF654Q8IZM8 581 aa14.72□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 CHURC1Q8WUH1 139 aa14.72□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 BRF1Q92994 677 aa14.72□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 KIFC2Q96AC6 838 aa14.72□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 SLF1Q9BQI6 1058 aa14.72□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 FOXD4L1Q9NU39 408 aa14.72□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.72□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 SLC12A7Q9Y666 1083 aa14.72□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa14.71□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 SEPT4O43236 478 aa14.71□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 DDAH1O94760 285 aa14.71□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 GOLGA8HP0CJ92 632 aa14.71□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 ZNF543Q08ER8 600 aa14.71□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 FAAP100Q0VG06 881 aa14.71□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 GRB14Q14449 540 aa14.71□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa14.71□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 ATG4CQ96DT6 458 aa14.71□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 MYL10Q9BUA6 226 aa14.71□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 MSRAQ9UJ68 235 aa14.71□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa14.71□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 PHF24Q9UPV7 400 aa14.71□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SRP19-208ENST00000621420 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 PI4K2BG5E9Z4 385 aa14.7□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 CALM1P0DP23 149 aa14.7□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 CALM2P0DP24 149 aa14.7□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 CALM3P0DP25 149 aa14.7□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 SNHG28P0DPA3 235 aa14.7□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 RXRAP19793 462 aa14.7□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 SLC16A2P36021 539 aa14.7□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 APOBRQ0VD83 1088 aa14.7□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 RAB30Q15771 203 aa14.7□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa14.7□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 APOA5Q6Q788 366 aa14.7□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 SGMS1Q86VZ5 419 aa14.7□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 MICU3Q86XE3 530 aa14.7□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa14.7□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 TBC1D32Q96NH3 1257 aa14.7□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 SLC28A3Q9HAS3 691 aa14.7□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 CD320Q9NPF0 282 aa14.7□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.7□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 TRANK1O15050 2925 aa14.7□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 GOLGA8BA8MQT2 603 aa14.69□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 PRR33A8MZF0 331 aa14.69□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 ZBTB43O43298 467 aa14.69□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 ZBED4O75132 1171 aa14.69□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 TIMP1P01033 207 aa14.69□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 ACRP10323 421 aa14.69□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 KIF5BP33176 963 aa14.69□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 NEK4P51957 841 aa14.69□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 CCNA1P78396 465 aa14.69□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 PLS1Q14651 629 aa14.69□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 GRM4Q14833 912 aa14.69□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 SYDE2Q5VT97 1194 aa14.69□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 TTBK2Q6IQ55 1244 aa14.69□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 MB21D1Q8N884 522 aa14.69□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 HERVK_113Q902F9 699 aa14.69□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 IL17RAQ96F46 866 aa14.69□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa14.69□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 SMCHD1A6NHR9 2005 aa14.69□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 GOLGA8AA7E2F4 631 aa14.68□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 KLRF2D3W0D1 207 aa14.68□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 TROAPQ12815 778 aa14.68□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 ANKRD1Q15327 319 aa14.68□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 MFSD5Q6N075 450 aa14.68□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 ZNF365Q70YC5 407 aa14.68□□□□□ -0.06
SRP19-208ENST00000621420 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms