RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619348.4

CYFIP1-211, Transcript of cytoplasmic FMR1 interacting protein 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CYFIP1, Length 3,471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1-211ENST00000619348 ANKRD40Q6AI12 368 aa14.66□□□□□ -0.06
CYFIP1-211ENST00000619348 CABP7Q86V35 215 aa14.66□□□□□ -0.06
CYFIP1-211ENST00000619348 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CYFIP1-211ENST00000619348 DYDC1Q8WWB3 177 aa14.66□□□□□ -0.06
CYFIP1-211ENST00000619348 P2RX5Q93086 422 aa14.66□□□□□ -0.06
CYFIP1-211ENST00000619348 UBA5Q9GZZ9 404 aa14.66□□□□□ -0.06
CYFIP1-211ENST00000619348 ASAP1Q9ULH1 1129 aa14.66□□□□□ -0.06
CYFIP1-211ENST00000619348 CEP83Q9Y592 693 aa14.66□□□□□ -0.06
CYFIP1-211ENST00000619348 CHUKO15111 745 aa14.65□□□□□ -0.06
CYFIP1-211ENST00000619348 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CYFIP1-211ENST00000619348 GLI1P08151 1106 aa14.65□□□□□ -0.06
CYFIP1-211ENST00000619348 GNAT2P19087 354 aa14.65□□□□□ -0.06
CYFIP1-211ENST00000619348 SLC1A4P43007 532 aa14.65□□□□□ -0.06
CYFIP1-211ENST00000619348 TRADDQ15628 312 aa14.65□□□□□ -0.06
CYFIP1-211ENST00000619348 DNAAF5Q86Y56 855 aa14.65□□□□□ -0.06
CYFIP1-211ENST00000619348 CALML4Q96GE6 196 aa14.65□□□□□ -0.06
CYFIP1-211ENST00000619348 DISC1Q9NRI5 854 aa14.65□□□□□ -0.06
CYFIP1-211ENST00000619348 STK4Q13043 487 aa14.65□□□□□ -0.06
CYFIP1-211ENST00000619348 SOGA3Q5TF21 947 aa14.65□□□□□ -0.06
CYFIP1-211ENST00000619348 ALS2CLQ60I27 953 aa14.65□□□□□ -0.06
CYFIP1-211ENST00000619348 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CYFIP1-211ENST00000619348 BLIDQ8IZY5 108 aa14.65□□□□□ -0.06
CYFIP1-211ENST00000619348 ADSSL1Q8N142 457 aa14.65□□□□□ -0.06
CYFIP1-211ENST00000619348 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa14.65□□□□□ -0.06
CYFIP1-211ENST00000619348 SPAG5Q96R06 1193 aa14.65□□□□□ -0.06
CYFIP1-211ENST00000619348 HAUS2Q9NVX0 235 aa14.65□□□□□ -0.06
CYFIP1-211ENST00000619348 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CYFIP1-211ENST00000619348 PLCG1P19174 1290 aa14.65□□□□□ -0.06
CYFIP1-211ENST00000619348 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CYFIP1-211ENST00000619348 SNCBQ16143 134 aa14.65□□□□□ -0.06
CYFIP1-211ENST00000619348 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CYFIP1-211ENST00000619348 KCNV1Q6PIU1 500 aa14.65□□□□□ -0.06
CYFIP1-211ENST00000619348 CCDC170Q8IYT3 715 aa14.65□□□□□ -0.06
CYFIP1-211ENST00000619348 MTRQ99707 1265 aa14.65□□□□□ -0.06
CYFIP1-211ENST00000619348 ANO9A1A5B4 782 aa14.64□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 VIMP08670 466 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 IFNAR2P48551 515 aa14.64□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 TNNC1P63316 161 aa14.64□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa14.64□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 HEG1Q9ULI3 1381 aa14.64□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 PALMO75781 387 aa14.64□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 PDHBP11177 359 aa14.64□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 NAPAP54920 295 aa14.64□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 CREG2Q8IUH2 290 aa14.64□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 TEX2Q8IWB9 1127 aa14.64□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa14.64□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 MCM9Q9NXL9 1143 aa14.64□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 TACC3Q9Y6A5 838 aa14.64□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 KIF5BP33176 963 aa14.64□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 SPATA20Q8TB22 786 aa14.64□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 TBC1D5Q92609 795 aa14.64□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 PHF20Q9BVI0 1012 aa14.64□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 DIP2BQ9P265 1576 aa14.63□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 CALML3P27482 149 aa14.63□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 AMPD3Q01432 767 aa14.63□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 LRP10Q7Z4F1 713 aa14.63□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 IRF2BP1Q8IU81 584 aa14.63□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 CCDC13Q8IYE1 715 aa14.63□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 GGT7Q9UJ14 662 aa14.63□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa14.63□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa14.63□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 DNAJC7Q99615 494 aa14.63□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 TSG101Q99816 390 aa14.63□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 EPN3Q9H201 632 aa14.63□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 TMEM60Q9H2L4 133 aa14.63□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 NDST4Q9H3R1 872 aa14.63□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 HAUS3Q68CZ6 603 aa14.62□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 STAG1Q8WVM7 1258 aa14.62□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 DIP2AQ14689 1571 aa14.62□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 PHF20L1A8MW92 1017 aa14.62□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 SRGNP10124 158 aa14.62□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 LLGL1Q15334 1064 aa14.62□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 PKN1Q16512 942 aa14.62□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 THAP9Q9H5L6 903 aa14.62□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 SLIT1O75093 1534 aa14.62□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 CCNE1P24864 410 aa14.62□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 KLHL30Q0D2K2 578 aa14.62□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 RPS6KA1Q15418 735 aa14.62□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 PDXDC2PQ6P474 469 aa14.62□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa14.62□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa14.62□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 MGARPQ8TDB4 240 aa14.62□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 SLC40A1Q9NP59 571 aa14.62□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 AKAP12Q02952 1782 aa14.61□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 ABCC6O95255 1503 aa14.61□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 A0A1B0GUA9 196 aa14.61□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 CALM1P0DP23 149 aa14.61□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 CALM2P0DP24 149 aa14.61□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 CALM3P0DP25 149 aa14.61□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 LONP1P36776 959 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CYFIP1-211ENST00000619348 MDH1P40925 334 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.1 ms