RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617055.4

UBE2C-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene UBE2C, Length 705 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-208ENST00000617055 DUSP28Q4G0W2 176 aa21.52■■□□□ 1.04
UBE2C-208ENST00000617055 MUM1L1Q5H9M0 696 aa21.52■■□□□ 1.04
UBE2C-208ENST00000617055 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa21.52■■□□□ 1.04
UBE2C-208ENST00000617055 HLA-CQ95604 372 aa21.52■■□□□ 1.04
UBE2C-208ENST00000617055 POLR3EQ9NVU0 708 aa21.52■■□□□ 1.04
UBE2C-208ENST00000617055 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa21.52■■□□□ 1.04
UBE2C-208ENST00000617055 TANC1Q9C0D5 1861 aa21.52■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 PLA2G6O60733 806 aa21.51■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 MS4A1P11836 297 aa21.51■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 MCCP23508 829 aa21.51■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 RFC2P35250 354 aa21.51■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 SNAP25P60880 206 aa21.51■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 PURAQ00577 322 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 KBTBD3Q8NAB2 608 aa21.51■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 TET1Q8NFU7 2136 aa21.51■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 MORC4Q8TE76 937 aa21.51■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 LRRCC1Q9C099 1032 aa21.51■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.51■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 ARHGEF15O94989 841 aa21.5■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 MYL3P08590 195 aa21.5■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 CPT1AP50416 773 aa21.5■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 TFAP4Q01664 338 aa21.5■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 NSMFQ6X4W1 530 aa21.5■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 ECHDC1Q9NTX5 307 aa21.5■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 KIF28PB7ZC32 967 aa21.49■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 PDE4BQ07343 736 aa21.49■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 KCTD1Q719H9 257 aa21.49■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 HERC6Q8IVU3 1022 aa21.49■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 WDR11Q9BZH6 1224 aa21.49■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 CCPG1Q9ULG6 757 aa21.49■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 PRR12Q9ULL5 1215 aa21.49■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 M0R2C6 588 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 GRB10Q13322 594 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 FAM47CQ5HY64 1035 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 RETREG2Q8NC44 543 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 PITPNM1O00562 1244 aa21.47■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 GPR37L1O60883 481 aa21.47■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 IQCF3P0C7M6 154 aa21.47■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 NBPF20Q3BBV1 942 aa21.47■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 RCSD1Q6JBY9 416 aa21.47■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 NACAP1Q9BZK3 213 aa21.47■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 PTPRSQ13332 1948 aa21.47■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 NFRKBQ6P4R8 1299 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 OR6J1Q8NGC5 347 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 C11orf16Q9NQ32 467 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 STX8Q9UNK0 236 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2C-208ENST00000617055 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 FAM86C2PA6NEL3 165 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 LPXNO60711 386 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 BAIAP3O94812 1187 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 ICAM1P05362 532 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 RASGRP2Q7LDG7 609 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 PPARAQ07869 468 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 BFSP2Q13515 415 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 SPRED2Q7Z698 418 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 RAD50Q92878 1312 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 KPNA6O60684 536 aa21.43■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 KCNJ6P48051 423 aa21.43■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 TSHZ3Q63HK5 1081 aa21.43■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 GPATCH3Q96I76 525 aa21.43■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 NAPBQ9H115 298 aa21.43■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 MTMR7Q9Y216 660 aa21.43■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 NOD1Q9Y239 953 aa21.43■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 PTPDC1A2A3K4 754 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 PI4K2BG5E9Z4 385 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 NFIBO00712 420 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP21.42■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 PPP2R5BQ15173 497 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 IL17RBQ9NRM6 502 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 LMCD1Q9NZU5 365 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 LCHNA4D1U4 455 aa21.41■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 A6NJR5 290 aa21.41■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 TSPY2A6NKD2 308 aa21.41■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 NMT2O60551 498 aa21.41■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 CCDC96Q2M329 555 aa21.41■■□□□ 1.02
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