RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 TEX13BQ9BXU2 312 aa14.16□□□□□ -0.14
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HCG18-241ENST00000602290 CXCL10P02778 98 aa14.15□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 HYAL1Q12794 435 aa14.15□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 CNKSR3Q6P9H4 555 aa14.15□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 DDX11Q96FC9 970 aa14.15□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 Q9Y3F1 56 aa14.15□□□□□ -0.14
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HCG18-241ENST00000602290 TMEM179Q6ZVK1 233 aa14.14□□□□□ -0.15
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HCG18-241ENST00000602290 TMEM105Q8N8V8 129 aa14.14□□□□□ -0.15
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HCG18-241ENST00000602290 SAMD11Q96NU1 681 aa14.14□□□□□ -0.15
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HCG18-241ENST00000602290 ICAM3P32942 547 aa14.12□□□□□ -0.15
HCG18-241ENST00000602290 ICA1Q05084 483 aa14.12□□□□□ -0.15
HCG18-241ENST00000602290 RBL2Q08999 1139 aa14.12□□□□□ -0.15
HCG18-241ENST00000602290 TFCP2Q12800 502 aa14.12□□□□□ -0.15
HCG18-241ENST00000602290 GPM6BQ13491 265 aa14.12□□□□□ -0.15
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HCG18-241ENST00000602290 AFAP1L1Q8TED9 768 aa14.12□□□□□ -0.15
HCG18-241ENST00000602290 SH2D4AQ9H788 454 aa14.12□□□□□ -0.15
HCG18-241ENST00000602290 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
HCG18-241ENST00000602290 INSL6Q9Y581 213 aa14.12□□□□□ -0.15
HCG18-241ENST00000602290 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
HCG18-241ENST00000602290 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa14.11□□□□□ -0.15
HCG18-241ENST00000602290 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa14.11□□□□□ -0.15
HCG18-241ENST00000602290 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
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HCG18-241ENST00000602290 EFCAB14O75071 495 aa14.1□□□□□ -0.15
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HCG18-241ENST00000602290 MS4A1P11836 297 aa14.1□□□□□ -0.15
HCG18-241ENST00000602290 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP14.1□□□□□ -0.151e-8■■■■□ 20.5
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HCG18-241ENST00000602290 SLF1Q9BQI6 1058 aa14.08□□□□□ -0.16
HCG18-241ENST00000602290 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
HCG18-241ENST00000602290 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
HCG18-241ENST00000602290 CLEC1BQ9P126 229 aa14.08□□□□□ -0.16
HCG18-241ENST00000602290 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
HCG18-241ENST00000602290 PARNO95453 639 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
HCG18-241ENST00000602290 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
HCG18-241ENST00000602290 AKR1B1P15121 316 aa14.07□□□□□ -0.16
HCG18-241ENST00000602290 RRP1P56182 461 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
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