RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585084.5

GPS1-225, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-225	ENST00000585084	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		33.35	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		33.35	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		33.35	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	TIMP1	P01033	207 aa		33.34	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	USH1G	Q495M9	461 aa		33.34	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	33.34	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	TBX21	Q9UL17	535 aa		33.34	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	TNKS	O95271	1327 aa		33.33	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	RAD50	Q92878	1312 aa		33.33	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		33.33	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		33.33	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	IL25	Q9H293	177 aa		33.33	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	CPVL	Q9H3G5	476 aa		33.33	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		33.33	■■■□□ 2.93
GPS1-225	ENST00000585084	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		33.32	■■■□□ 2.92
GPS1-225	ENST00000585084	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	33.32	■■■□□ 2.92
GPS1-225	ENST00000585084	PTGS1	P23219	599 aa		33.31	■■■□□ 2.92
GPS1-225	ENST00000585084	EPHB4	P54760	987 aa		33.31	■■■□□ 2.92
GPS1-225	ENST00000585084	PDE4D	Q08499	809 aa		33.31	■■■□□ 2.92
GPS1-225	ENST00000585084	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	33.31	■■■□□ 2.92
GPS1-225	ENST00000585084	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		33.31	■■■□□ 2.92
GPS1-225	ENST00000585084	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		33.31	■■■□□ 2.92
GPS1-225	ENST00000585084	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		33.31	■■■□□ 2.92
GPS1-225	ENST00000585084	DNER	Q8NFT8	737 aa		33.31	■■■□□ 2.92
GPS1-225	ENST00000585084	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		33.31	■■■□□ 2.92
GPS1-225	ENST00000585084		B4DLN1	442 aa		33.3	■■■□□ 2.92
GPS1-225	ENST00000585084	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	33.3	■■■□□ 2.92
GPS1-225	ENST00000585084	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	33.3	■■■□□ 2.92
GPS1-225	ENST00000585084	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	33.3	■■■□□ 2.92
GPS1-225	ENST00000585084	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		33.3	■■■□□ 2.92
GPS1-225	ENST00000585084	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	33.29	■■■□□ 2.92
GPS1-225	ENST00000585084	ITGA7	Q13683	1181 aa		33.29	■■■□□ 2.92
GPS1-225	ENST00000585084	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		33.29	■■■□□ 2.92
GPS1-225	ENST00000585084	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	33.29	■■■□□ 2.92
GPS1-225	ENST00000585084	MFSD5	Q6N075	450 aa		33.29	■■■□□ 2.92
GPS1-225	ENST00000585084	RGS22	Q8NE09	1264 aa		33.29	■■■□□ 2.92
GPS1-225	ENST00000585084	FAM161B	Q96MY7	647 aa		33.29	■■■□□ 2.92
GPS1-225	ENST00000585084	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		33.29	■■■□□ 2.92
GPS1-225	ENST00000585084	TRDN	Q13061	729 aa		33.28	■■■□□ 2.92
GPS1-225	ENST00000585084	ABCB11	O95342	1321 aa		33.28	■■■□□ 2.92
GPS1-225	ENST00000585084	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	33.27	■■■□□ 2.92
GPS1-225	ENST00000585084	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	33.27	■■■□□ 2.92	4e-9	■■□□□ 13.6
GPS1-225	ENST00000585084	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		33.27	■■■□□ 2.92
GPS1-225	ENST00000585084	MAF1	Q9H063	256 aa		33.27	■■■□□ 2.92
GPS1-225	ENST00000585084	CHML	P26374	656 aa		33.26	■■■□□ 2.91
GPS1-225	ENST00000585084	TMEM199	Q8N511	208 aa		33.26	■■■□□ 2.91
GPS1-225	ENST00000585084	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		33.26	■■■□□ 2.91
GPS1-225	ENST00000585084	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		33.26	■■■□□ 2.91
GPS1-225	ENST00000585084	CD4	P01730	458 aa		33.25	■■■□□ 2.91
GPS1-225	ENST00000585084	EDNRB	P24530	442 aa		33.25	■■■□□ 2.91
GPS1-225	ENST00000585084	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		33.25	■■■□□ 2.91
GPS1-225	ENST00000585084		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	33.25	■■■□□ 2.91
GPS1-225	ENST00000585084	CPT1A	P50416	773 aa		33.24	■■■□□ 2.91
GPS1-225	ENST00000585084	PPP2R5B	Q15173	497 aa		33.24	■■■□□ 2.91
GPS1-225	ENST00000585084	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		33.24	■■■□□ 2.91
GPS1-225	ENST00000585084	FBXO11	Q86XK2	927 aa		33.24	■■■□□ 2.91
GPS1-225	ENST00000585084	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		33.24	■■■□□ 2.91
GPS1-225	ENST00000585084	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		33.24	■■■□□ 2.91
GPS1-225	ENST00000585084	SCFD2	Q8WU76	684 aa		33.24	■■■□□ 2.91
GPS1-225	ENST00000585084	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	33.23	■■■□□ 2.91	1e-14	■□□□□ 8.4
GPS1-225	ENST00000585084	PSMC6	P62333	389 aa		33.23	■■■□□ 2.91
GPS1-225	ENST00000585084	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	33.23	■■■□□ 2.91
GPS1-225	ENST00000585084	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		33.23	■■■□□ 2.91
GPS1-225	ENST00000585084	GUCD1	Q96NT3	240 aa		33.23	■■■□□ 2.91
GPS1-225	ENST00000585084	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		33.23	■■■□□ 2.91
GPS1-225	ENST00000585084	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	33.23	■■■□□ 2.91
GPS1-225	ENST00000585084	SEC23A	Q15436	765 aa		33.22	■■■□□ 2.91
GPS1-225	ENST00000585084	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	33.22	■■■□□ 2.91
GPS1-225	ENST00000585084	GRIN2D	O15399	1336 aa		33.22	■■■□□ 2.91
GPS1-225	ENST00000585084	CSF2RA	P15509	400 aa		33.21	■■■□□ 2.91
GPS1-225	ENST00000585084	PTH1R	Q03431	593 aa		33.21	■■■□□ 2.91
GPS1-225	ENST00000585084	TBC1D5	Q92609	795 aa		33.21	■■■□□ 2.91
GPS1-225	ENST00000585084	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	33.21	■■■□□ 2.91	3e-7	■□□□□ 9.2
GPS1-225	ENST00000585084	MYL3	P08590	195 aa		33.2	■■■□□ 2.91
GPS1-225	ENST00000585084	CYP21A2	P08686	494 aa		33.2	■■■□□ 2.91
GPS1-225	ENST00000585084	CYP2C18	P33260	490 aa		33.2	■■■□□ 2.91
GPS1-225	ENST00000585084	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		33.2	■■■□□ 2.91
GPS1-225	ENST00000585084	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	33.2	■■■□□ 2.91
GPS1-225	ENST00000585084	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		33.2	■■■□□ 2.91
GPS1-225	ENST00000585084	HIPK3	Q9H422	1215 aa		33.2	■■■□□ 2.91
GPS1-225	ENST00000585084	COL6A3	P12111	3177 aa		33.2	■■■□□ 2.91
GPS1-225	ENST00000585084	MYH6	P13533	1939 aa		33.2	■■■□□ 2.9
GPS1-225	ENST00000585084	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	33.19	■■■□□ 2.9
GPS1-225	ENST00000585084	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
GPS1-225	ENST00000585084	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
GPS1-225	ENST00000585084	ERICH2	A1L162	156 aa		33.19	■■■□□ 2.9
GPS1-225	ENST00000585084	KLRF2	D3W0D1	207 aa		33.19	■■■□□ 2.9
GPS1-225	ENST00000585084	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	33.19	■■■□□ 2.9
GPS1-225	ENST00000585084	TTLL4	Q14679	1199 aa		33.19	■■■□□ 2.9
GPS1-225	ENST00000585084	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	33.19	■■■□□ 2.9
GPS1-225	ENST00000585084	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	33.19	■■■□□ 2.9
GPS1-225	ENST00000585084	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
GPS1-225	ENST00000585084	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		33.18	■■■□□ 2.9
GPS1-225	ENST00000585084	AMN	Q9BXJ7	453 aa		33.18	■■■□□ 2.9
GPS1-225	ENST00000585084	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		33.18	■■■□□ 2.9
GPS1-225	ENST00000585084	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	33.17	■■■□□ 2.9
GPS1-225	ENST00000585084	SGSM2	O43147	1006 aa		33.17	■■■□□ 2.9
GPS1-225	ENST00000585084	B4GALT4	O60513	344 aa		33.17	■■■□□ 2.9

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