RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 PLA2G4DQ86XP0 818 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 KSR1Q8IVT5 923 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 GREM2Q9H772 168 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 SATB1Q01826 763 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 SESN3P58005 492 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 COPRSQ9NQ92 184 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 MYL7Q01449 175 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 OSBPL3Q9H4L5 887 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 MLXIPQ9HAP2 919 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 PTPN22Q9Y2R2 807 aa23.31■■□□□ 1.32
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PTPRM-211ENST00000580170 BFSP1Q12934 665 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 NIM1KQ8IY84 436 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
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PTPRM-211ENST00000580170 SEPT10Q9P0V9 454 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 KIAA1024Q9UPX6 916 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 FAN1Q9Y2M0 1017 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 BAG2O95816 211 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 WHAMMQ8TF30 809 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC127Q96BQ5 260 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 EFCC1Q9HA90 598 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 PCDHA4Q9UN74 947 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 CYP21A2P08686 494 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 PDE6BP35913 854 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 SCNN1DP51172 638 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 GJA10Q969M2 543 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 HAUS1Q96CS2 278 aa23.3■■□□□ 1.32
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PTPRM-211ENST00000580170 ATP10AO60312 1499 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 PPIP5K2O43314 1243 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 MMS19Q96T76 1030 aa23.3■■□□□ 1.32
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PTPRM-211ENST00000580170 PCP11498 1178 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 RPS6KA2Q15349 733 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa23.3■■□□□ 1.32
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PTPRM-211ENST00000580170 CIAO1O76071 339 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP23.29■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 CUEDC2Q9H467 287 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 MAN1B1Q9UKM7 699 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 ATP2B4P23634 1241 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 CYP4A11Q02928 519 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF148Q9UQR1 794 aa23.29■■□□□ 1.32
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PTPRM-211ENST00000580170 ZBTB17Q13105 803 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 POLA2Q14181 598 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 APOA5Q6Q788 366 aa23.29■■□□□ 1.32
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PTPRM-211ENST00000580170 H0YCG3 227 aa23.28■■□□□ 1.32
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PTPRM-211ENST00000580170 Q9H521 79 aa23.28■■□□□ 1.32
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PTPRM-211ENST00000580170 JRKLQ9Y4A0 524 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 NSFP46459 744 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 PROSER3Q2NL68 480 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
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PTPRM-211ENST00000580170 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 PDE8BO95263 885 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 MESDQ14696 234 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 P2RX5Q93086 422 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 TCP10L2B9ZVM9 353 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
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PTPRM-211ENST00000580170 SLFN13Q68D06 897 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 MCF2L2Q86YR7 1114 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 ATP8B1O43520 1251 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 ZMYND10O75800 440 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 TRAPPC10P48553 1259 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 C2orf54Q08AI8 447 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 GPR108Q9NPR9 543 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM232C9JQI7 657 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 RASGRP4Q8TDF6 673 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRM-211ENST00000580170 CAPN9O14815 690 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 MFAP3P55082 362 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 E2F5Q15329 346 aa23.26■■□□□ 1.31
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