RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564105.5

CTU2-204, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTU2, Length 1,586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-204ENST00000564105 CLEC4DQ8WXI8 215 aa21.97■■□□□ 1.11
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CTU2-204ENST00000564105 SLC25A27O95847 323 aa21.96■■□□□ 1.11
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CTU2-204ENST00000564105 NR5A1Q13285 461 aa21.96■■□□□ 1.11
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CTU2-204ENST00000564105 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
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CTU2-204ENST00000564105 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa21.95■■□□□ 1.1
CTU2-204ENST00000564105 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
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CTU2-204ENST00000564105 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CTU2-204ENST00000564105 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
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CTU2-204ENST00000564105 MYSM1Q5VVJ2 828 aa21.87■■□□□ 1.09
CTU2-204ENST00000564105 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CTU2-204ENST00000564105 MMP19Q99542 508 aa21.87■■□□□ 1.09
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