RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559737.5

USP3-AS1-203, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP3-AS1, Length 1,434 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-203ENST00000559737 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 MMP1P03956 469 aa21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 POLR2MP0CAP2 368 aa21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 PTPREP23469 700 aa21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 GNA11P29992 359 aa21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 PSMC4P43686 418 aa21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 HSD17B4P51659 736 aa21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 GHRHRQ02643 423 aa21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 KCTD2Q14681 263 aa21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 CD99L2Q8TCZ2 262 aa21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 OXER1Q8TDS5 423 aa21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRIM47Q96LD4 638 aa21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 PCDHA4Q9UN74 947 aa21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 FKTNO75072 461 aa21.42■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 PDCP20941 246 aa21.42■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 CALML3P27482 149 aa21.42■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 BLIDQ8IZY5 108 aa21.42■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 DAGLBQ8NCG7 672 aa21.42■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 RASGRP4Q8TDF6 673 aa21.42■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM260Q9NX78 707 aa21.42■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 COL20A1Q9P218 1284 aa21.42■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 H3BQV1 296 aa21.41■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 PIK3CDO00329 1044 aa21.41■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 STRNO43815 780 aa21.41■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 PGK2P07205 417 aa21.41■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 ADORA2AP29274 412 aa21.41■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 CLK2P49760 499 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 FCGRTP55899 365 aa21.41■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 IFFO2Q5TF58 517 aa21.41■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 GALNT17Q6IS24 598 aa21.41■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 FCHSD1Q86WN1 690 aa21.41■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 PFASO15067 1338 aa21.4■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 BTBD18B2RXH4 712 aa21.4■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 M0R2N6 131 aa21.4■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 FOXN1O15353 648 aa21.4■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 CNTN2Q02246 1040 aa21.4■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 GRB14Q14449 540 aa21.4■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 KIF22Q14807 665 aa21.4■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa21.4■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 ABRAQ8N0Z2 381 aa21.4■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 SAMD3Q8N6K7 520 aa21.4■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 BICD2Q8TD16 824 aa21.4■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 PGBD1Q96JS3 809 aa21.4■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 GLT8D2Q9H1C3 349 aa21.4■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa21.39■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC15A5A6NIM6 579 aa21.39■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 KRT2P35908 639 aa21.39■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 NR5A1Q13285 461 aa21.39■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 MORN1Q5T089 497 aa21.39■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 TAAR1Q96RJ0 339 aa21.39■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 MAF1Q9H063 256 aa21.39■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 GJD2Q9UKL4 321 aa21.39■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 PCDHA6Q9UN73 950 aa21.39■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa21.39■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa21.39■■□□□ 1.02
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF236Q9UL36 1845 aa21.39■■□□□ 1.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 POTEB2H3BUK9 544 aa21.38■■□□□ 1.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 STX6O43752 255 aa21.38■■□□□ 1.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 COBLO75128 1261 aa21.38■■□□□ 1.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 PKP1Q13835 747 aa21.38■■□□□ 1.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM133AQ8N9E0 248 aa21.38■■□□□ 1.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 ERO1AQ96HE7 468 aa21.38■■□□□ 1.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 MTMR6Q9Y217 621 aa21.38■■□□□ 1.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa21.38■■□□□ 1.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 KIF28PB7ZC32 967 aa21.38■■□□□ 1.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 MCTP1Q6DN14 999 aa21.38■■□□□ 1.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 TNFRSF25Q93038 417 aa21.38■■□□□ 1.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 BRMS1Q9HCU9 246 aa21.38■■□□□ 1.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 GABRQQ9UN88 632 aa21.38■■□□□ 1.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 ASTN1O14525 1302 aa21.37■■□□□ 1.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 SOWAHBA6NEL2 793 aa21.37■■□□□ 1.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 DDIT3P35638 169 aa21.37■■□□□ 1.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 MAP2K5Q13163 448 aa21.37■■□□□ 1.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 DPP9Q86TI2 863 aa21.37■■□□□ 1.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 USP6NLQ92738 828 aa21.37■■□□□ 1.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 FGD4Q96M96 766 aa21.37■■□□□ 1.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 NUDT12Q9BQG2 462 aa21.37■■□□□ 1.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM205CA6NFA0 338 aa21.36■■□□□ 1.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 SPDYE3A6NKU9 549 aa21.36■■□□□ 1.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF792Q3KQV3 632 aa21.36■■□□□ 1.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 TEX2Q8IWB9 1127 aa21.36■■□□□ 1.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 NPLOC4Q8TAT6 608 aa21.36■■□□□ 1.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 ANO3Q9BYT9 981 aa21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms