RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557266.5

RCCD1-208, Transcript of RCC1 domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RCCD1, Length 2,110 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1-208ENST00000557266 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa25.31■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 TBC1D8O95759 1140 aa25.3■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 DNM2P50570 870 aa25.3■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 DDR1Q08345 913 aa25.3■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 PICALMQ13492 652 aa25.3■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 TUBB2AQ13885 445 aa25.3■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 TUBB2BQ9BVA1 445 aa25.3■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 MYO1AQ9UBC5 1043 aa25.3■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 hCG_1984214I3L0E3 225 aa25.3■■□□□ 1.64
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RCCD1-208ENST00000557266 WDR59Q6PJI9 974 aa25.3■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 CEP112Q8N8E3 955 aa25.3■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 COA7Q96BR5 231 aa25.3■■□□□ 1.64
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RCCD1-208ENST00000557266 BICDL2A1A5D9 508 aa25.29■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 ATP8B1O43520 1251 aa25.29■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 EDIL3O43854 480 aa25.29■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 AKR1B1P15121 316 aa25.29■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 PKNOX2Q96KN3 472 aa25.29■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 CRAMP1Q96RY5 1269 aa25.29■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 TTYH3Q9C0H2 523 aa25.29■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 FOCADQ5VW36 1801 aa25.29■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa25.28■■□□□ 1.64
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RCCD1-208ENST00000557266 TXKP42681 527 aa25.28■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 ASPRV1Q53RT3 343 aa25.28■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 CLEC10AQ8IUN9 316 aa25.28■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 AKT1S1Q96B36 256 aa25.28■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 SLC37A4O43826 429 aa25.28■■□□□ 1.64
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RCCD1-208ENST00000557266 GRB10Q13322 594 aa25.28■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 KIAA0895Q8NCT3 520 aa25.28■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 HPS3Q969F9 1004 aa25.28■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 CALML4Q96GE6 196 aa25.28■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 TRIM10Q9UDY6 481 aa25.28■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 ADCY7P51828 1080 aa25.27■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 CALCRLQ16602 461 aa25.27■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa25.27■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 KLK7P49862 253 aa25.27■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 MEA1Q16626 185 aa25.27■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 COBLL1Q53SF7 1204 aa25.27■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa25.27■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 ARFGAP3Q9NP61 516 aa25.27■■□□□ 1.64
RCCD1-208ENST00000557266 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
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RCCD1-208ENST00000557266 TDP2O95551 362 aa25.26■■□□□ 1.63
RCCD1-208ENST00000557266 PPP1R2P41236 205 aa25.26■■□□□ 1.63
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RCCD1-208ENST00000557266 MIIPQ5JXC2 388 aa25.26■■□□□ 1.63
RCCD1-208ENST00000557266 CNNM4Q6P4Q7 775 aa25.26■■□□□ 1.63
RCCD1-208ENST00000557266 PNMA5Q96PV4 448 aa25.26■■□□□ 1.63
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RCCD1-208ENST00000557266 LRWD1Q9UFC0 647 aa25.26■■□□□ 1.63
RCCD1-208ENST00000557266 LRRC37AA6NMS7 1700 aa25.26■■□□□ 1.63
RCCD1-208ENST00000557266 FAM114A1Q8IWE2 563 aa25.25■■□□□ 1.63
RCCD1-208ENST00000557266 UBXN6Q9BZV1 441 aa25.25■■□□□ 1.63
RCCD1-208ENST00000557266 GPCPD1Q9NPB8 672 aa25.25■■□□□ 1.63
RCCD1-208ENST00000557266 MYMKA6NI61 221 aa25.25■■□□□ 1.63
RCCD1-208ENST00000557266 F8W031 263 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
RCCD1-208ENST00000557266 RIMBP2O15034 1052 aa25.25■■□□□ 1.63
RCCD1-208ENST00000557266 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP25.25■■□□□ 1.63
RCCD1-208ENST00000557266 HERVK_113P62684 666 aa25.25■■□□□ 1.63
RCCD1-208ENST00000557266 AMPD2Q01433 879 aa25.25■■□□□ 1.63
RCCD1-208ENST00000557266 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa25.25■■□□□ 1.63
RCCD1-208ENST00000557266 CERS5Q8N5B7 392 aa25.25■■□□□ 1.63
RCCD1-208ENST00000557266 SEMA6BQ9H3T3 888 aa25.25■■□□□ 1.63
RCCD1-208ENST00000557266 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
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RCCD1-208ENST00000557266 SV2BQ7L1I2 683 aa25.24■■□□□ 1.63
RCCD1-208ENST00000557266 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
RCCD1-208ENST00000557266 SLC39A2Q9NP94 309 aa25.24■■□□□ 1.63
RCCD1-208ENST00000557266 GUCA1BQ9UMX6 200 aa25.24■■□□□ 1.63
RCCD1-208ENST00000557266 CCDC151A5D8V7 595 aa25.24■■□□□ 1.63
RCCD1-208ENST00000557266 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
RCCD1-208ENST00000557266 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
RCCD1-208ENST00000557266 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa25.24■■□□□ 1.63
RCCD1-208ENST00000557266 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
RCCD1-208ENST00000557266 RETREG2Q8NC44 543 aa25.24■■□□□ 1.63
RCCD1-208ENST00000557266 STK17AQ9UEE5 414 aa25.24■■□□□ 1.63
RCCD1-208ENST00000557266 ZNF543Q08ER8 600 aa25.23■■□□□ 1.63
RCCD1-208ENST00000557266 CENPPQ6IPU0 288 aa25.23■■□□□ 1.63
RCCD1-208ENST00000557266 SP8Q8IXZ3 490 aa25.23■■□□□ 1.63
RCCD1-208ENST00000557266 NUP58Q9BVL2 599 aa25.23■■□□□ 1.63
RCCD1-208ENST00000557266 FUT8Q9BYC5 575 aa25.23■■□□□ 1.63
RCCD1-208ENST00000557266 COA1Q9GZY4 146 aa25.23■■□□□ 1.63
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