RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555806.5

NEDD1-208, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-208ENST00000555806 VTI1AQ96AJ9 217 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 MAD2L2Q9UI95 211 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 ASGR1P07306 291 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 SMPD1P17405 629 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 ANTXR2P58335 489 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 BEX3Q00994 111 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 PDE4DQ08499 809 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 IQSEC1Q6DN90 963 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 TAPT1Q6NXT6 567 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 GLT1D1Q96MS3 346 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 AP5M1Q9H0R1 490 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 SENP2Q9HC62 589 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 PDLIM7Q9NR12 457 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 MYH6P13533 1939 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 GRM4Q14833 912 aa21.43■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 CASC1Q6TDU7 716 aa21.43■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 TDHQ8IZJ6 230 aa21.43■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 RGS22Q8NE09 1264 aa21.43■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 DNERQ8NFT8 737 aa21.43■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 B4DLN1 442 aa21.42■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 SLC27A2O14975 620 aa21.42■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 PTGS1P23219 599 aa21.42■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 CATIPQ7Z7H3 387 aa21.42■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 MCF2L2Q86YR7 1114 aa21.42■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 AMNQ9BXJ7 453 aa21.42■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 LTBP2Q14767 1821 aa21.41■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 ELP1O95163 1332 aa21.41■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 CTAGE5O15320 804 aa21.41■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 CLTBP09497 229 aa21.41■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 TMEM63BQ5T3F8 832 aa21.41■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.41■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa21.41■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 HOMER1Q86YM7 354 aa21.41■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 TBC1D5Q92609 795 aa21.41■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 DCDC2CA8MYV0 355 aa21.4■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 ZBTB5O15062 677 aa21.4■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 PRC1O43663 620 aa21.4■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 ZEB2O60315 1214 aa21.4■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 CDC45O75419 566 aa21.4■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 NEFLP07196 543 aa21.4■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 NKX3-2P78367 333 aa21.4■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 TROAPQ12815 778 aa21.4■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa21.4■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 WDR11Q9BZH6 1224 aa21.4■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 MAF1Q9H063 256 aa21.4■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 TRIM43BA6NCK2 446 aa21.39■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 EDNRBP24530 442 aa21.39■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 MCM5P33992 734 aa21.39■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 NECTIN1Q15223 517 aa21.39■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 DUSP28Q4G0W2 176 aa21.39■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 BADQ92934 168 aa21.39■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 MTMR8Q96EF0 704 aa21.39■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 LY9Q9HBG7 655 aa21.39■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 Q9Y3F1 56 aa21.39■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 MROH7Q68CQ1 1323 aa21.38■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 CFBP00751 764 aa21.38■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 PPP2R5BQ15173 497 aa21.38■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 CXCL17Q6UXB2 119 aa21.38■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 NFXL1Q6ZNB6 911 aa21.38■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa21.38■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF654Q8IZM8 581 aa21.38■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 LRCH3Q96II8 777 aa21.38■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 TOX2Q96NM4 488 aa21.38■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 TAAR1Q96RJ0 339 aa21.38■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 PIGSQ96S52 555 aa21.38■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 RIOX1Q9H6W3 641 aa21.38■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 TMEM39AQ9NV64 488 aa21.38■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 COL20A1Q9P218 1284 aa21.38■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa21.38■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 ARVCFO00192 962 aa21.37■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 SLC35G1Q2M3R5 365 aa21.37■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 RNF20Q5VTR2 975 aa21.37■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 OR6J1Q8NGC5 347 aa21.37■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 SCFD2Q8WU76 684 aa21.37■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 TMEM87BQ96K49 555 aa21.37■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 RMDN3Q96TC7 470 aa21.37■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 MTA3Q9BTC8 594 aa21.37■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 MYL10Q9BUA6 226 aa21.37■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 CCDC69A6NI79 296 aa21.36■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 CABYRO75952 493 aa21.36■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 DDAH1O94760 285 aa21.36■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 RAG1P15918 1043 aa21.36■■□□□ 1.01
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