RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551676.5

PPP1CC-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, human

TSL 2 BASIC

Gene PPP1CC, Length 1,581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP1CC-208	ENST00000551676	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PPP1CC-208	ENST00000551676	MTMR9	Q96QG7	549 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PPP1CC-208	ENST00000551676	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PPP1CC-208	ENST00000551676	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	29.2	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	TYRO3	Q06418	890 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	29.2	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	OTOF	Q9HC10	1997 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZBED4	O75132	1171 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	TDP2	O95551	362 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	CYP3A7	P24462	503 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	MBOAT7	Q96N66	472 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	29.18	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	29.18	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	POLR2M	P0CAP2	368 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	SREBF1	P36956	1147 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	PPAT	Q06203	517 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	VWA5A	O00534	786 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	SLC37A4	O43826	429 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	DSG3	P32926	999 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	GHRHR	Q02643	423 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	ERO1B	Q86YB8	467 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	POTED	Q86YR6	584 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	29.17	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	CALCRL	Q16602	461 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	MOB2	Q70IA6	237 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	CNNM3	Q8NE01	707 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	TBC1D5	Q92609	795 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676		A0A087X0B3	334 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	POTEI	P0CG38	1075 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	POTEJ	P0CG39	1038 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	ARHGAP4	P98171	946 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	COG2	Q14746	738 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	REPS2	Q8NFH8	660 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	ATG4C	Q96DT6	458 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	AK8	Q96MA6	479 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	ELP3	Q9H9T3	547 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	USP25	Q9UHP3	1055 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	CXCL11	O14625	94 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	29.15	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	29.15	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	PANK2	Q9BZ23	570 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	29.15	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	MYPN	Q86TC9	1320 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	PARP14	Q460N5	1801 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	CFB	P00751	764 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	CYP3A4	P08684	503 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	HSD17B4	P51659	736 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	29.14	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	KANK3	Q6NY19	840 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	RLF	Q13129	1914 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PPP1CC-208	ENST00000551676	CIITA	P33076	1130 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PPP1CC-208	ENST00000551676	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	29.13	■■■□□ 2.25
PPP1CC-208	ENST00000551676	OAZ1	P54368	228 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PPP1CC-208	ENST00000551676	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PPP1CC-208	ENST00000551676	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PPP1CC-208	ENST00000551676	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PPP1CC-208	ENST00000551676	UNCX	A6NJT0	531 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PPP1CC-208	ENST00000551676	SLFN14	P0C7P3	912 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PPP1CC-208	ENST00000551676	CPXCR1	Q8N123	301 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PPP1CC-208	ENST00000551676	PDILT	Q8N807	584 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PPP1CC-208	ENST00000551676	RRAGC	Q9HB90	399 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PPP1CC-208	ENST00000551676	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PPP1CC-208	ENST00000551676	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PPP1CC-208	ENST00000551676	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	29.13	■■■□□ 2.25
PPP1CC-208	ENST00000551676	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PPP1CC-208	ENST00000551676		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	29.12	■■■□□ 2.25
PPP1CC-208	ENST00000551676	PPIL2	Q13356	520 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PPP1CC-208	ENST00000551676	E2F4	Q16254	413 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PPP1CC-208	ENST00000551676	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	29.12	■■■□□ 2.25
PPP1CC-208	ENST00000551676	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	29.12	■■■□□ 2.25
PPP1CC-208	ENST00000551676	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PPP1CC-208	ENST00000551676	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PPP1CC-208	ENST00000551676	WNK4	Q96J92	1243 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PPP1CC-208	ENST00000551676	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	29.12	■■■□□ 2.25
PPP1CC-208	ENST00000551676	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	29.12	■■■□□ 2.25
PPP1CC-208	ENST00000551676	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PPP1CC-208	ENST00000551676	IRF6	O14896	467 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PPP1CC-208	ENST00000551676	ATP2A1	O14983	1001 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PPP1CC-208	ENST00000551676	TXLNA	P40222	546 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PPP1CC-208	ENST00000551676		Q4G0T1	1027 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PPP1CC-208	ENST00000551676	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		29.11	■■■□□ 2.25

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