RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 FAM83BQ5T0W9 1011 aa23.63■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 SAMD7Q7Z3H4 446 aa23.63■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa23.63■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 PRELPP51888 382 aa23.62■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 CCZ1BP86790 482 aa23.62■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa23.62■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 SYDE2Q5VT97 1194 aa23.62■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 AGBL3Q8NEM8 1001 aa23.62■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 MTFR1LQ9H019 292 aa23.62■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa23.62■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 GJA3Q9Y6H8 435 aa23.62■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 EEF2KMTQ96G04 330 aa23.62■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 LRWD1Q9UFC0 647 aa23.62■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 MEIS2O14770 477 aa23.61■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 HPS3Q969F9 1004 aa23.61■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 GMCL1Q96IK5 515 aa23.61■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa23.61■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 SMCHD1A6NHR9 2005 aa23.61■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 PRCPP42785 496 aa23.61■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 IGSF22Q8N9C0 903 aa23.61■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 HAS1Q92839 578 aa23.61■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 PRR12Q9ULL5 1215 aa23.61■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 DGKZQ13574 1117 aa23.6■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 KMT5BQ4FZB7 885 aa23.6■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 MYO1BO43795 1136 aa23.6■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 MARCH6O60337 910 aa23.6■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 RASA3Q14644 834 aa23.6■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 PPP1R18Q6NYC8 613 aa23.6■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 FBXO11Q86XK2 927 aa23.6■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 TBC1D5Q92609 795 aa23.6■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 KBTBD4Q9NVX7 518 aa23.6■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 TRIM49BA6NDI0 452 aa23.59■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 TEX33O43247 280 aa23.59■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 CCDC174Q6PII3 467 aa23.59■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
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PRDM4-205ENST00000550376 ECM1Q16610 540 aa23.59■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 SPATA1Q5VX52 437 aa23.59■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 KIFC2Q96AC6 838 aa23.59■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 FBXO28Q9NVF7 368 aa23.59■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 KLRC4O43908 158 aa23.58■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 GRB10Q13322 594 aa23.58■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 AK8Q96MA6 479 aa23.58■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 ANO3Q9BYT9 981 aa23.58■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 PMS1P54277 932 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa23.58■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 KCNK18Q7Z418 384 aa23.58■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 VSTM4Q8IW00 320 aa23.58■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 NLGN2Q8NFZ4 835 aa23.58■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 NELFBQ8WX92 580 aa23.58■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa23.58■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 FZD1Q9UP38 647 aa23.58■■□□□ 1.37
PRDM4-205ENST00000550376 OPLAHO14841 1288 aa23.57■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 PNMA5Q96PV4 448 aa23.57■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 TMX2Q9Y320 296 aa23.57■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 CBFA2T2O43439 604 aa23.57■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 MCM6Q14566 821 aa23.57■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 IMPACTQ9P2X3 320 aa23.57■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 PGAP2Q9UHJ9 254 aa23.57■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP23.56■■□□□ 1.36
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PRDM4-205ENST00000550376 FCHSD1Q86WN1 690 aa23.56■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 STAT3P40763 770 aa23.56■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 STAT2P52630 851 aa23.56■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 PPP4R3AQ6IN85 833 aa23.56■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 SLC30A10Q6XR72 485 aa23.56■■□□□ 1.36
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PRDM4-205ENST00000550376 CYP2W1Q8TAV3 490 aa23.56■■□□□ 1.36
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PRDM4-205ENST00000550376 GSDMDP57764 484 aa23.55■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 ASIC1P78348 528 aa23.55■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
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PRDM4-205ENST00000550376 CALML4Q96GE6 196 aa23.55■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 TRIM9Q9C026 710 aa23.55■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 VPS33BQ9H267 617 aa23.55■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 MYH7BA7E2Y1 1941 aa23.55■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 TMEM266Q2M3C6 531 aa23.55■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 MTMR14Q8NCE2 650 aa23.55■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 PCDHA12Q9UN75 941 aa23.55■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP23.54■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 ADKP55263 362 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 PAK1Q13153 545 aa23.54■■□□□ 1.36
PRDM4-205ENST00000550376 PRR16Q569H4 304 aa23.54■■□□□ 1.36
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