RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548041.5

CS-211, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-211ENST00000548041 COL20A1Q9P218 1284 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 WDR81Q562E7 1941 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 CFBP00751 764 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 GJB1P08034 283 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 CNGA1P29973 690 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 ADD1P35611 737 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 GJA8P48165 433 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 GNAQP50148 359 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 AK2P54819 239 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 CCT2P78371 535 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 FUT2Q10981 343 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 STK3Q13188 491 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 ARMCX2Q7L311 632 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP9.98□□□□□ -0.817e-8■■■□□ 18
CS-211ENST00000548041 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 LZTS2Q9BRK4 669 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 PNMA2Q9UL42 364 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 ADCY6O43306 1168 aa9.97□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 DTNBO60941 627 aa9.97□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 LARGE1O95461 756 aa9.97□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 SGPL1O95470 568 aa9.97□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 SMARCA1P28370 1054 aa9.97□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 RCAN1P53805 252 aa9.97□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 EVCP57679 992 aa9.97□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 KIF2CQ99661 725 aa9.97□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 C22orf23Q9BZE7 217 aa9.97□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 KATNBL1Q9H079 304 aa9.97□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
CS-211ENST00000548041 PTGS1P23219 599 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 HSD17B4P51659 736 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 NTRK3Q16288 839 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 LHX8Q68G74 356 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 WWC2Q6AWC2 1192 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 TYW1BQ6NUM6 668 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 EEPD1Q7L9B9 569 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 MCF2L2Q86YR7 1114 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 PHKBQ93100 1093 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 TAAR1Q96RJ0 339 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 TPCN1Q9ULQ1 816 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 ASB14A6NK59 587 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 SEPT4O43236 478 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 TFRCP02786 760 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 RBM25P49756 843 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 NEK4P51957 841 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 GHRHRQ02643 423 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 SCRN1Q12765 414 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 ACVR2BQ13705 512 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 RGS22Q8NE09 1264 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 PDGFCQ9NRA1 345 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 CNPY2Q9Y2B0 182 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 V9GY48 417 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 LTBP2Q14767 1821 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 STXBP3O00186 592 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 AKR1A1P14550 325 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 EDNRBP24530 442 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 ADCYAP1R1P41586 468 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 RGS19P49795 217 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 PPP2R5BQ15173 497 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 PKN1Q16512 942 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 UBE2SQ16763 222 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 CCDC144BQ3MJ40 725 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 TMEM63BQ5T3F8 832 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 USP17L6PQ6QN14 398 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 FCHSD1Q86WN1 690 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 DNERQ8NFT8 737 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 IL31RAQ8NI17 732 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 MORC4Q8TE76 937 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 RMDN3Q96TC7 470 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 SLC26A6Q9BXS9 759 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-211ENST00000548041 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms